蛋白质—蛋白质相互作用界面和热点预测的方法研究
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 目录 | 第6-8页 |
| 第一章 前言 | 第8-12页 |
| 1.1 研究背景与意义 | 第8-9页 |
| 1.2 研究现状 | 第9-10页 |
| 1.3 本文的研究内容 | 第10-11页 |
| 1.4 本文的结构安排 | 第11-12页 |
| 第二章 蛋白质相互作用机制及其预测 | 第12-19页 |
| 2.1 蛋白质的组成与结构层次 | 第12-13页 |
| 2.2 蛋白质相互作用的特点 | 第13-14页 |
| 2.3 蛋白质相互作用的计算方法 | 第14-16页 |
| 2.4 数据的可靠性挑战 | 第16-17页 |
| 2.5 相关数据库的应用 | 第17-18页 |
| 2.6 本章小结 | 第18-19页 |
| 第三章 基于氨基酸序列的界面预测 | 第19-27页 |
| 3.1 蛋白质特征提取 | 第19-23页 |
| 3.1.1 氨基酸残基的进化保守性 | 第19页 |
| 3.1.2 氨基酸残基进化保守性的序列比对 | 第19-20页 |
| 3.1.3 氨基酸的理化属性特征 | 第20-22页 |
| 3.1.4 蛋白质特征编码 | 第22-23页 |
| 3.2 相互作用数据样本集的构建 | 第23-24页 |
| 3.3 构建支持向量机预测器 | 第24-25页 |
| 3.4 界面预测器性能评价 | 第25-26页 |
| 3.5 本章小结 | 第26-27页 |
| 第四章 基于界面的结构特征的发现与计算方法 | 第27-37页 |
| 4.1 相互作用界面结构域的扩展计算 | 第27-29页 |
| 4.1.1 界面结构域的界定 | 第27-28页 |
| 4.1.2 界面结构域的计算 | 第28-29页 |
| 4.2 热点残基的计算 | 第29-34页 |
| 4.2.1 热点残基的定义 | 第30页 |
| 4.2.2 热点残基关键属性的分析 | 第30-32页 |
| 4.2.3 基于多特征随机融合的特征向量构建 | 第32-33页 |
| 4.2.4 热点残基预测器性能评价 | 第33-34页 |
| 4.3 结构功能域—热区的初步研究 | 第34页 |
| 4.4 界面位点和热点预测的算法描述 | 第34-36页 |
| 4.5 本章小结 | 第36-37页 |
| 第五章 实验结果分析及评价 | 第37-44页 |
| 5.1 相互作用界面的实验结果与分析 | 第37-38页 |
| 5.2 热点残基的实验结果与分析 | 第38-42页 |
| 5.3 本章小结 | 第42-44页 |
| 第六章 总结与展望 | 第44-46页 |
| 6.1 工作总结 | 第44页 |
| 6.2 展望 | 第44-46页 |
| 参考文献 | 第46-50页 |
| 致谢 | 第50-51页 |
| 附录A 攻读学位期间发表的论文 | 第51-52页 |
| 详细摘要 | 第52-56页 |
