| 摘要 | 第3-6页 |
| ABSTRACT | 第6-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-32页 |
| 1.1 人体肠道微生物研究进展 | 第12-26页 |
| 1.1.1 人体肠道微生物概述 | 第12-13页 |
| 1.1.2 肠道内有重要生理学意义的微生物组成 | 第13-17页 |
| 1.1.2.1 梭菌 | 第14页 |
| 1.1.2.2 拟杆菌 | 第14-15页 |
| 1.1.2.3 双歧杆菌 | 第15页 |
| 1.1.2.4 肠杆菌 | 第15页 |
| 1.1.2.5 乳酸菌 | 第15-16页 |
| 1.1.2.6 其他重要细菌类群和古菌 | 第16-17页 |
| 1.1.3 肠道细菌F. prausnitzii 综述 | 第17-20页 |
| 1.1.3.1 F. prausnitzii 形态 | 第17页 |
| 1.1.3.2 F. prausnitzii 系统分类地位 | 第17-18页 |
| 1.1.3.3 F. prausnitzii 重要功能 | 第18-19页 |
| 1.1.3.4 F. prausnitzii 的研究方法 | 第19-20页 |
| 1.1.4 肠道微生物的主要功能 | 第20-21页 |
| 1.1.4.1 营养与消化 | 第20页 |
| 1.1.4.2 促进上皮细胞的生长与分化 | 第20-21页 |
| 1.1.4.3 免疫功能 | 第21页 |
| 1.1.4.4 保护作用 | 第21页 |
| 1.1.5 肠道微生物与性别的关系 | 第21-22页 |
| 1.1.6 肠道微生物与疾病的关系 | 第22-26页 |
| 1.1.6.1 肠道菌群与肥胖的关系 | 第22-24页 |
| 1.1.6.2 肠道菌群与胰岛素抵抗的关系 | 第24-25页 |
| 1.1.6.3 肠道菌群与其它疾病的关系 | 第25-26页 |
| 1.2 研究微生物组成多样性的分子生物学技术 | 第26-32页 |
| 1.2.1 实时定量PCR 技术 | 第26-28页 |
| 1.2.2 变性/温度梯度凝胶电泳技术 | 第28-32页 |
| 第二章 建立肠道细菌Feacalibacterium prausnitzii 数量和组成的分析方法 | 第32-54页 |
| 引言 | 第32-33页 |
| 2.1 材料与方法 | 第33-40页 |
| 2.1.1 材料 | 第33-35页 |
| 2.1.1.1 克隆与引物 | 第33-34页 |
| 2.1.1.2 试剂和仪器 | 第34页 |
| 2.1.1.3 计算机程序和数据库 | 第34-35页 |
| 2.1.2 方法 | 第35-40页 |
| 2.1.2.1 序列的比对和系统发育分析 | 第35页 |
| 2.1.2.2 RDP 的Probe Match 分析 | 第35页 |
| 2.1.2.3 SPCR 分析 | 第35页 |
| 2.1.2.4 真实PCR 验证 | 第35-36页 |
| 2.1.2.5 F. prausnitzii 特异性的实时定量PCR | 第36-38页 |
| 2.1.2.6 F. prausnitzii 特异性的PCR-DGGE | 第38-40页 |
| 2.2 结果 | 第40-51页 |
| 2.2.1 引物比较 | 第40-45页 |
| 2.2.1.1 序列比对和系统发育分析 | 第40-43页 |
| 2.2.1.2 RDP 的Probe Match 分析 | 第43页 |
| 2.2.1.3 SPCR 分析 | 第43-45页 |
| 2.2.2 真实PCR 验证结果 | 第45-47页 |
| 2.2.3 F. prausnitzii 特异性的实时定量PCR | 第47-48页 |
| 2.2.4 F. prausnitzii 特异性的PCR-DGGE | 第48-51页 |
| 2.3 讨论 | 第51-54页 |
| 第三章 应用实时定量PCR技术对中国成年人群肠道中Feacalibacterium prausnitzii进行数量分析 | 第54-68页 |
| 引言 | 第54-55页 |
| 3.1 材料与方法 | 第55-59页 |
| 3.1.1 样本来源 | 第55页 |
| 3.1.2 粪便基因组DNA 提取 | 第55-57页 |
| 3.1.3 F. prausnitzii 特异性实时定量PCR | 第57-59页 |
| 3.1.3.1 DNA 浓度的测定 | 第57页 |
| 3.1.3.2 粪便样品F. prausnitzii 特异性实时定量PCR 和总菌实时定量PCR | 第57-59页 |
| 3.2 结果 | 第59-64页 |
| 3.2.1 实验样品的选择 | 第59-60页 |
| 3.2.2 F. prausnitzii 特异性实时定量PCR 结果 | 第60-64页 |
| 3.3 讨论 | 第64-68页 |
| 第四章 应用PCR-DGGE 技术对中国成年人群肠道中Feacalibacterium prausnitzii 进行组成分析 | 第68-78页 |
| 引言 | 第68-69页 |
| 4.1 材料与方法 | 第69-70页 |
| 4.1.1 材料 | 第69-70页 |
| 4.1.1.1 粪便样品来源 | 第69页 |
| 4.1.1.2 试剂 | 第69-70页 |
| 4.1.2 方法 | 第70页 |
| 4.1.2.1 粪便基因组DNA 的提取 | 第70页 |
| 4.1.2.2 F. prausnitzii 特异性的PCR-DGGE | 第70页 |
| 4.2 结果 | 第70-75页 |
| 4.3 讨论 | 第75-78页 |
| 参考文献 | 第78-87页 |
| 附录1 溶液试剂及培养基配方 | 第87-88页 |
| 附录2 仪器设备 | 第88-89页 |
| 附录3 缩写和全称 | 第89-91页 |
| 附录4 F. prausnitzii 特异性实时定量PCR 样品基本信息 | 第91-94页 |
| 附录5 F. prausnitzii 特异性实时定量PCR 数据汇总 | 第94-99页 |
| 致谢 | 第99-101页 |
| 研究生阶段已发表或录用的论文 | 第101-103页 |
