摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
1 绪论 | 第9-14页 |
1.1 代谢组学 | 第9-11页 |
1.2 化学计量学在代谢组学中的应用 | 第11-13页 |
1.3 本文研究内容 | 第13-14页 |
2 随机森林算法简介 | 第14-21页 |
2.1 分类问题 | 第14-15页 |
2.2 Bagging方法 | 第15-16页 |
2.3 决策树简介 | 第16-17页 |
2.4 随机森林模型 | 第17-21页 |
2.4.1 变量重要度 | 第18-19页 |
2.4.2 相似得分确定样本相似度 | 第19-21页 |
3 随机森林用于鉴定糖尿病小鼠经诺和龙治疗的代谢轨迹 | 第21-30页 |
3.1 引言 | 第21页 |
3.2 实验部分 | 第21-22页 |
3.2.1 仪器与试剂 | 第21-22页 |
3.2.2 动物样本 | 第22页 |
3.2.3 样本处理 | 第22页 |
3.2.4 GC-MS分析条件 | 第22页 |
3.3 结果与讨论 | 第22-29页 |
3.3.1 小鼠尿液中代谢物质的定性定量分析 | 第22-25页 |
3.3.2 小鼠样本经诺和龙治疗后的代谢轨迹变化 | 第25-27页 |
3.3.3 生物标记物对代谢轨迹变化的贡献 | 第27-29页 |
3.4 本章小结 | 第29-30页 |
4 随机森林用于鉴定糖尿病小鼠经罗格列酮治疗的代谢轨迹 | 第30-38页 |
4.1 引言 | 第30页 |
4.2 实验部分 | 第30页 |
4.2.1 动物模型 | 第30页 |
4.2.2 实验条件与处理方法 | 第30页 |
4.3 结果与讨论 | 第30-37页 |
4.3.1 小鼠尿液中代谢物质的定性定量分析 | 第30-32页 |
4.3.2 小鼠样本经罗格列酮治疗后的代谢轨迹变化 | 第32-35页 |
4.3.3 生物标记物对代谢轨迹变化的贡献 | 第35-37页 |
4.4 本章小结 | 第37-38页 |
5 基于随机森林分析AMPK基因敲除小鼠代谢图谱 | 第38-47页 |
5.1 引言 | 第38页 |
5.2 实验部分 | 第38页 |
5.2.1 动物模型 | 第38页 |
5.2.2 实验条件与处理方法 | 第38页 |
5.3 结果与讨论 | 第38-46页 |
5.3.1 小鼠尿液中代谢物质的定性定量分析 | 第38-41页 |
5.3.2 随机森林算法处理分析代谢数据 | 第41-43页 |
5.3.3 随机森林算法挖掘分析代谢数据中的生物学信息 | 第43-46页 |
5.4 本章小结 | 第46-47页 |
6 结论 | 第47-48页 |
参考文献 | 第48-56页 |
攻读学位期间主要研究成果 | 第56-57页 |
致谢 | 第57页 |