| 英文缩略词 | 第9-11页 |
| 中文摘要 | 第11-13页 |
| 英文摘要 | 第13-15页 |
| 第一部分 直肠癌区域癌化的研究及其临床意义 | 第16-71页 |
| 前言 | 第16-22页 |
| 材料与方法 | 第22-37页 |
| 1. 实验材料 | 第22-24页 |
| 1.1 肿瘤及配对的粘膜标本 | 第22页 |
| 1.2 公共数据库下载的结直肠癌基因表达谱数据 | 第22页 |
| 1.3 主要试剂与试剂盒 | 第22-23页 |
| 1.4 主要仪器与耗材 | 第23-24页 |
| 1.5 芯片质量控制和分析软件 | 第24页 |
| 2. 实验方法 | 第24-34页 |
| 2.1 总RNA的提取 | 第24-25页 |
| 2.2 RNA浓度检测和质量控制 | 第25-26页 |
| 2.3 基因表达谱分析 | 第26-34页 |
| 2.3.1 待标记样品的准备工作 | 第26-28页 |
| 2.3.2 反转录mRNA合成cDNA | 第28-29页 |
| 2.3.3 cDNA转录为cRNA | 第29页 |
| 2.3.4 cRNA纯化与质量控制 | 第29-30页 |
| 2.3.5 杂交 | 第30-32页 |
| 2.3.6 清洗芯片 | 第32-33页 |
| 2.3.7 芯片扫描 | 第33页 |
| 2.3.8 芯片数据提取与质量控制 | 第33-34页 |
| 3. 数据的分析与处理 | 第34-36页 |
| 3.1 GeneSpring GX v12.6.1软件的应用 | 第34-35页 |
| 3.2 主成分分析(Principal ComponentAnalysis,PCA) | 第35页 |
| 3.3 差异基因的筛选 | 第35页 |
| 3.4 GO分析 | 第35页 |
| 3.5 KEGG Pathway分析 | 第35-36页 |
| 3.6 基因富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA) | 第36页 |
| 4. 统计分析 | 第36-37页 |
| 结果 | 第37-62页 |
| 1. 患者临床病理资料 | 第37-38页 |
| 2. 癌与癌旁不同距离粘膜的主成分分析 | 第38-39页 |
| 3. 差异基因表达情况 | 第39-43页 |
| 3.1 肿瘤组织与癌旁1cm粘膜组织差异基因表达情况 | 第39页 |
| 3.2 癌旁1cm粘膜组织与癌旁5cm粘膜组织差异基因表达情况 | 第39页 |
| 3.3 癌旁5cm粘膜组织与上切缘粘膜组织差异基因表达情况 | 第39-43页 |
| 4. 差异基因GO分析 | 第43-50页 |
| 4.1 肿瘤组织与癌旁1cm粘膜组织差异基因GO分析 | 第43页 |
| 4.2 癌旁1cm粘膜组织与癌旁5cm粘膜组织差异基因GO分析 | 第43页 |
| 4.3 癌旁5cm粘膜组织与上切缘粘膜组织差异基因GO分析 | 第43-50页 |
| 5. 差异基因KEGG Pathyway分析 | 第50-55页 |
| 5.1 肿瘤组织与癌旁1cm粘膜组织差异基因Pathway分析 | 第50页 |
| 5.2 癌旁1cm粘膜组织与癌旁5cm粘膜组织差异基因Pathway分析 | 第50页 |
| 5.3 癌旁5cm粘膜组织与上切缘粘膜组织差异基因Pathway分析 | 第50-55页 |
| 6. GSEA分析 | 第55-57页 |
| 7. 差异基因与预后分析 | 第57-62页 |
| 讨论 | 第62-65页 |
| 结论 | 第65-66页 |
| 参考文献 | 第66-71页 |
| 第二部分 直肠癌新辅助放化疗后手术时机的选择 | 第71-92页 |
| 前言 | 第71-73页 |
| 材料与方法 | 第73-75页 |
| 1. 研究对象 | 第73页 |
| 1.1 纳入标准 | 第73页 |
| 1.2 排除标准 | 第73页 |
| 1.3 一般资料 | 第73页 |
| 2. 术前检查与分期 | 第73页 |
| 3. 治疗情况 | 第73-74页 |
| 4. 术后病理检查 | 第74页 |
| 5. 观察指标 | 第74页 |
| 6. 术后复查与随访 | 第74页 |
| 7. 统计学分析 | 第74-75页 |
| 结果 | 第75-82页 |
| 1. 患者临床资料 | 第75页 |
| 2. 手术情况 | 第75-76页 |
| 3. 围手术期并发症 | 第76-78页 |
| 4. 术后胃肠道功能恢复情况 | 第78页 |
| 5. 术后病理情况 | 第78页 |
| 6. 生存情况 | 第78-80页 |
| 7. 最佳手术时间 | 第80-82页 |
| 讨论 | 第82-86页 |
| 结论 | 第86-87页 |
| 参考文献 | 第87-92页 |
| 基金资助 | 第92-93页 |
| 博士期间发表论文 | 第93-95页 |
| 论文综述 | 第95-109页 |
| 第一部分 区域癌化理论在结直肠癌中的临床意义 | 第95-101页 |
| 参考文献 | 第98-101页 |
| 第二部分 直肠癌新辅助放化疗后手术时机的选择 | 第101-109页 |
| 参考文献 | 第105-109页 |
| 致谢 | 第109-111页 |
| 个人简历 | 第111-113页 |
