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基于电子顺磁共振方法的膜蛋白结构解析以及功能研究

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
第一章 电子顺磁共振的理论简介第12-22页
    1.1 引言第12页
    1.2 电子顺磁共振基本原理第12-14页
    1.3 电子顺磁共振中的各种相互作用第14-17页
        1.3.1 电子自旋Zeeman相互作用第14页
        1.3.2 核自旋Zeeman相互作用第14-15页
        1.3.3 超精细耦合第15-16页
        1.3.4 零场分裂第16页
        1.3.5 核四极距第16页
        1.3.6 偶极-偶极相互作用第16-17页
        1.3.7 海森堡交换耦合第17页
    1.4 g因子第17-18页
    1.5 电子顺磁共振谱仪第18-21页
    参考文献第21-22页
第二章 EPR在生物大分子中的应用第22-52页
    2.1 引言第22页
    2.2 生物大分子中的自旋标记第22-29页
        2.2.1 自旋标记物第23-24页
        2.2.2 位点特异性自旋标记方法(SDSL)第24-26页
        2.2.3 其他自旋标记方法第26-29页
    2.3 EPR在蛋白质研究中得到的主要信息第29-40页
        2.3.1 蛋白动力学信息第29-33页
        2.3.2 易趋性信息(Accessibility )第33-35页
        2.3.3 蛋白中的距离信息第35-40页
    2.4 EPR在生物大分子中的应用第40-47页
        2.4.1 蛋白质的结构功能研究第40-43页
        2.4.2 EPR在核酸研究中的应用第43-45页
        2.4.3 原位条件下的蛋白质EPR研究第45-47页
    2.5 小结第47-48页
    参考文献第48-52页
第三章 基于电子顺磁共振(EPR)方法的E.coli整合膜蛋白YgaP的结构解析和底物结合研究第52-104页
    3.0 引言第52-54页
    3.1 YgaP膜蛋白的背景介绍第54-59页
        3.1.1 硫氰酸酶简介第54-56页
        3.1.2 YgaP蛋白的结构和功能研究第56-59页
    3.2 实验材料与方法第59-76页
        3.2.1 YgaP膜蛋白的基因和氨基酸序列以及蛋白二级结构的预测第59-61页
        3.2.2 分子克隆以及位点特异性突变第61-66页
        3.2.3 YgaP膜蛋白的表达与纯化第66-68页
        3.2.4 YgaP膜蛋白的位点特异性自旋标记第68-69页
        3.2.5 圆二色光谱实验第69页
        3.2.6 连续波EPR实验以及数据处理第69-70页
        3.2.7 功率饱和EPR实验以及数据处理第70-71页
        3.2.8 CW-EPR方法和DEER方法的距离测量第71-73页
        3.2.9 EPR方法测量的距离约束的处理第73-74页
        3.2.10 YgaP膜蛋白的结构计算第74-76页
        3.2.11 YgaP结合SCN的EPR检测第76页
    3.3 实验结果与讨论第76-98页
        3.3.1 YgaP膜蛋白的表达和纯化第76-78页
        3.3.2 YgaP膜蛋白在DPC去污剂中的圆二色光谱结果与分析第78-79页
        3.3.3 单自旋标记YgaP膜蛋白的CW-EPR光谱以及动力学分析第79-81页
        3.3.4 单自旋标记YgaP膜蛋白的易趋性分析第81-84页
        3.3.5 CW-EPR方法和DEER方法的距离测量结果及分析第84-88页
        3.3.6 全长YgaP膜蛋白的结构解析第88-92页
        3.3.7 YgaP膜蛋白结合底物SCN的动力学变化第92-95页
        3.3.8 YgaP膜蛋白结合底物SCN的构象变化第95-98页
    3.4 本章小结第98-100页
    参考文献第100-104页
第四章 利用电子顺磁共振方法研究人源干扰素诱导膜蛋白IFITM3的跨膜拓扑结构第104-139页
    4.1 背景介绍第104-116页
        4.1.1 干扰素刺激基因与病毒抑制因子第104-105页
        4.1.2 IFITM蛋白简介及其抗病毒功能第105-109页
        4.1.3 IFITM蛋白的翻译后修饰第109-111页
        4.1.4 IFITM蛋白的拓扑结构以及功能机制研究第111-116页
    4.2 实验材料与方法第116-124页
        4.2.1 IFITM3膜蛋白的基因和氨基酸序列第116页
        4.2.2 IFITM3膜蛋白的二级结构预测第116-118页
        4.2.3 位点特异性半胱氨酸突变第118-121页
        4.2.4 IFITM3膜蛋白的表达与纯化第121-122页
        4.2.5 IFITM3膜蛋白的位点特异性自旋标记第122-123页
        4.2.6 连续波EPR实验以及数据处理第123页
        4.2.7 功率饱和EPR实验以及数据处理第123-124页
    4.3 实验结果与讨论第124-132页
        4.3.1 IFITM3膜蛋白的表达和纯化第125-126页
        4.3.2 自旋标记IFITM3膜蛋白的CW-EPR光谱以及分析第126-127页
        4.3.3 IFITM3蛋白的跨膜区氨基酸位点的易趋性分析第127-130页
        4.3.4 IFITM3蛋白的跨膜区(W60-Y132)在膜中的拓扑结构第130-132页
    4.4 本章小结第132-133页
    参考文献第133-139页
致谢第139-140页
在读期间发表的学术论文与取得的研究成果第140页

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