| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 缩略词 | 第14-15页 |
| 第一章 绪论 | 第15-30页 |
| 1.1 植物内生真菌及多样性 | 第15-20页 |
| 1.1.1 植物内生真菌的定义 | 第15页 |
| 1.1.2 植物内生真菌的多样性 | 第15-17页 |
| 1.1.2.1 内生真菌的生态多样性 | 第15-16页 |
| 1.1.2.2 内生真菌的种类多样性 | 第16-17页 |
| 1.1.3 植物内生真菌多样性的研究方法 | 第17-20页 |
| 1.1.3.1 纯培养技术 | 第17-18页 |
| 1.1.3.2 免培养技术 | 第18-20页 |
| 1.2 土壤重金属污染及修复 | 第20-27页 |
| 1.2.1 土壤重金属污染 | 第20-22页 |
| 1.2.2 重金属污染土壤的修复 | 第22-27页 |
| 1.2.2.1 经典修复 | 第22-23页 |
| 1.2.2.2 植物修复 | 第23-26页 |
| 1.2.2.3 内生菌对植物修复的辅助作用 | 第26-27页 |
| 1.3 研究背景、内容及技术路线 | 第27-30页 |
| 1.3.1 研究背景 | 第27-28页 |
| 1.3.2 研究内容 | 第28-29页 |
| 1.3.3 技术路线 | 第29-30页 |
| 第二章 土荆芥可培养内生真菌多样性及其重金属抗性 | 第30-49页 |
| 2.1 试剂及仪器 | 第30-33页 |
| 2.1.1 试剂 | 第30-32页 |
| 2.1.2 仪器设备 | 第32-33页 |
| 2.2 材料与方法 | 第33-39页 |
| 2.2.1 植物样品与土样 | 第33-34页 |
| 2.2.2 植物内生真菌的分离与鉴定 | 第34-38页 |
| 2.2.2.1 植物样品的预处理 | 第34页 |
| 2.2.2.2 内生真菌的分离与纯化 | 第34-35页 |
| 2.2.2.3 内生真菌的形态学鉴定 | 第35页 |
| 2.2.2.4 内生真菌的分子鉴定 | 第35-38页 |
| 2.2.3 土壤样品和植物样品重金属含量测定 | 第38-39页 |
| 2.2.4 内生真菌的重金属抗性及最小抑制浓度 | 第39页 |
| 2.3 数据统计与分析 | 第39-40页 |
| 2.4 结果 | 第40-47页 |
| 2.4.1 定殖率 | 第40-41页 |
| 2.4.2 内生真菌的组成 | 第41-45页 |
| 2.4.3 样品重金属含量 | 第45页 |
| 2.4.4 内生真菌的重金属抗性及最小抑制浓度 | 第45-47页 |
| 2.5 讨论 | 第47-49页 |
| 2.5.1 内生真菌的多样性 | 第47-48页 |
| 2.5.2 内生真菌的重金属抗性及最小抑制浓度 | 第48-49页 |
| 第三章 土荆芥免培养内生真菌的多样性研究 | 第49-69页 |
| 3.1 试剂与仪器 | 第49-50页 |
| 3.1.1 试剂 | 第49页 |
| 3.1.2 仪器设备 | 第49-50页 |
| 3.2 材料与方法 | 第50-53页 |
| 3.2.1 植物样品 | 第50-51页 |
| 3.2.2 高通量测序 | 第51-53页 |
| 3.2.2.1 样品的预处理 | 第51页 |
| 3.2.2.2 提取样品总DNA | 第51-52页 |
| 3.2.2.3 DNA检测 | 第52页 |
| 3.2.2.4 真菌ITS区域扩增及高通量测序 | 第52-53页 |
| 3.2.2.5 高通量测序流程 | 第53页 |
| 3.3 数据分析 | 第53-54页 |
| 3.3.1 物种注释 | 第53-54页 |
| 3.3.2 多样性指数分析 | 第54页 |
| 3.4 实验结果 | 第54-66页 |
| 3.4.1 数据过滤及tags拼接 | 第54-56页 |
| 3.4.2 OTU数目统计 | 第56-57页 |
| 3.4.3 OTU alpha多样性 | 第57-58页 |
| 3.4.4 样品间的共有菌种 | 第58-59页 |
| 3.4.5 不同分类水平样品中优势菌种 | 第59-61页 |
| 3.4.6 最佳分类水平 | 第61-62页 |
| 3.4.7 最佳分类水平下样品间的beta多样性比较 | 第62-63页 |
| 3.4.8 最佳分类水平上的物种分类热图 | 第63-66页 |
| 3.5 讨论 | 第66-69页 |
| 第四章 总结与展望 | 第69-72页 |
| 4.1 总结 | 第69-70页 |
| 4.1.1 土荆芥可培养内生真菌的多样性及重金属抗性 | 第69-70页 |
| 4.1.2 土荆芥免培养内生真菌的多样性 | 第70页 |
| 4.2 展望 | 第70-72页 |
| 致谢 | 第72-73页 |
| 参考文献 | 第73-84页 |
| 附录 攻读硕士期间发表论文目录 | 第84页 |