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砖红绒盖牛肝菌子实体原基培养及原基有无的转录组差异初歩分析

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第一章 综述第10-20页
    1.1 牛肝菌属概况第10页
    1.2 牛肝菌国内外研究进展第10-17页
        1.2.1 牛肝菌的分类地位第10-12页
        1.2.2 牛肝菌的活性成分第12-13页
        1.2.3 基本营养物质第13-14页
        1.2.4 菌丝体培养及人工驯化第14-15页
        1.2.5 生态与共生研究第15-17页
    1.3 大型真菌转录组测序技术及其研究概况第17-18页
    1.4 研究目的及意义第18-20页
第二章 砖红绒盖牛肝菌试管子实体原基诱导及鉴定第20-36页
    前言第20页
    2.1 实验材料、试剂及仪器第20-22页
        2.1.1 材料第20-21页
        2.1.2 试剂及仪器第21-22页
    2.2 方法第22-24页
        2.2.1 分离培养基第22页
        2.2.2 分离方法第22页
        2.2.3 子实体DNA提取第22-23页
        2.2.4 菌丝体、子实体原基DNA提取第23页
        2.2.5 DNA条带检测第23页
        2.2.6 引物序列及ITS-PCR扩增第23-24页
        2.2.7 扩增产物的序列测定第24页
    2.3 结果与分析第24-34页
        2.3.1 原基培养第24-27页
        2.3.2 分子鉴定第27-34页
    2.4 讨论第34-36页
第三章 砖红绒盖牛肝菌试管子实体原基转录组分析第36-59页
    前言第36页
    3.1 材料、试剂及仪器第36-37页
        3.1.1 材料第36-37页
        3.1.2 试剂与仪器第37页
    3.2 方法第37-45页
        3.2.1 前期准备工作第37页
        3.2.2 总RNA提取第37-38页
        3.2.3 总RNA质量检测第38页
        3.2.4 cDNA文库的构建(此步及以下各步由北京百迈克生物科技有限公司完成)第38-40页
        3.2.5 文库质检第40页
        3.2.6 上机测序第40页
        3.2.7 测序质量控制第40-42页
        3.2.8 测序数据组装第42-44页
        3.2.9 Unigene的获得及其分析第44页
        3.2.10 基因表达量分析第44-45页
        3.2.11 差异表达分析第45页
    3.3 结果与分析第45-57页
        3.3.1 测序信息统计第45-46页
        3.3.2 转录组测序数据组装第46-48页
        3.3.3 文库质量评估第48-49页
        3.3.4 Unigene功能注释第49-50页
        3.3.5 基因表达量分析第50-51页
        3.3.6 差异表达分析第51-52页
        3.3.7 差异表达基因功能注释第52-53页
        3.3.8 差异表达基因GO功能富集第53-55页
        3.3.9 差异表达基因COG功能分类第55-56页
        3.3.10 差异表达基因KEGG功能注释第56-57页
    3.4 小结第57-58页
    3.5 讨论第58-59页
参考文献第59-65页
致谢第65页

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