| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 第1章 绪论 | 第10-24页 |
| ·HIV-1 整合酶及其抑制剂的研究进展 | 第10-16页 |
| ·HIV-1 整合酶的研究意义 | 第10-12页 |
| ·整合酶的结构与功能 | 第12-14页 |
| ·整合酶抑制剂的研究现状及进展 | 第14-16页 |
| ·LEDGF/p75:抗HIV-1 感染的新靶点及其抑制剂研究 | 第16-20页 |
| ·人体LEDGF/p75 蛋白简介 | 第16-19页 |
| ·抑制剂的研究现状及进展 | 第19-20页 |
| ·HIV-1 融合抑制剂的研究进展 | 第20-24页 |
| ·跨膜蛋白gp41的结构与功能 | 第20-21页 |
| ·融合抑制剂的研究进展 | 第21-24页 |
| 第2章 研究方法 | 第24-38页 |
| ·分子动力学模拟 | 第24-30页 |
| ·基本原理 | 第24-28页 |
| ·基本步骤 | 第28-29页 |
| ·常用分子动力学模拟软件简介 | 第29-30页 |
| ·分子对接 | 第30-36页 |
| ·搜索算法 | 第31-32页 |
| ·打分函数 | 第32-33页 |
| ·常用的分子对接软件 | 第33-36页 |
| ·三维定量构效关系 | 第36-38页 |
| ·简介 | 第36页 |
| ·易位体比较分子力场分析 | 第36-38页 |
| 第3章 HIV-1整合酶与p75衍生小肽抑制剂的结合模式及其抑制机理的分子模拟研究 | 第38-48页 |
| ·研究背景及意义 | 第38页 |
| ·材料与方法 | 第38-40页 |
| ·体系准备 | 第38-39页 |
| ·分子对接 | 第39页 |
| ·分子动力学模拟 | 第39-40页 |
| ·MM-GBSA 能量分解 | 第40页 |
| ·结果与讨论 | 第40-45页 |
| ·对接模式预测 | 第40-41页 |
| ·整合酶与p75 衍生短肽复合物的分子动力学模拟 | 第41-43页 |
| ·能量分解 | 第43页 |
| ·结合模式预测 | 第43-45页 |
| ·本章小结 | 第45-48页 |
| 第4章 抗HIV融合抑制剂定量构效关系的研究 | 第48-56页 |
| ·研究背景及意义 | 第48页 |
| ·材料与方法 | 第48-53页 |
| ·数据来源 | 第48-49页 |
| ·分子准备 | 第49-50页 |
| ·化合物分子片段划分 | 第50-51页 |
| ·Topomer CoMFA 模型的建立 | 第51-53页 |
| ·结果分析 | 第53-55页 |
| ·预测结果分析 | 第53-54页 |
| ·等高线图分析 | 第54-55页 |
| ·本章小结 | 第55-56页 |
| 结论 | 第56-58页 |
| 参考文献 | 第58-72页 |
| 附录 | 第72-74页 |
| 攻读硕士学位期间所发表的学术论文 | 第74-76页 |
| 致谢 | 第76页 |