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芽孢杆菌左聚糖蔗糖酶基因克隆、表达及分子改造

摘要第4-7页
ABSTRACT第7-9页
第一章 前言第14-36页
    1.1 果聚糖第14-23页
        1.1.1 果聚糖分类及其性质第14-15页
        1.1.2 菊糖第15页
        1.1.3 左聚糖第15-17页
        1.1.4 果聚糖的功能及应用第17-19页
            1.1.4.1 医学应用第17-18页
            1.1.4.2 食品工业应用第18页
            1.1.4.3 化妆品行业应用第18-19页
            1.1.4.4 制药工业应用第19页
            1.1.4.5 农牧业应用第19页
            1.1.4.6 其他应用第19页
        1.1.5 左聚糖的生产第19-23页
            1.1.5.1 酶法生产左聚糖第20-21页
            1.1.5.2 发酵法生产左聚糖第21-23页
    1.2 蔗糖资源及其利用第23-24页
    1.3 与蔗糖利用有关的酶第24-35页
        1.3.1 蔗糖转化酶第24-25页
        1.3.2 蔗糖磷酸化酶第25页
        1.3.3 左聚糖蔗糖酶第25-35页
            1.3.3.1 左聚糖蔗糖酶及其催化反应第25-26页
            1.3.3.2 已知左聚糖蔗糖酶的三维结构和功能分析第26-32页
            1.3.3.3 不同来源的左聚糖蔗糖酶及其产左聚糖的概况第32-35页
    1.4 本课题研究的目的和意义第35-36页
第二章 材料与方法第36-60页
    2.1 材料第36-38页
        2.1.1 菌株第36页
        2.1.2 化学试剂和酶制剂第36-37页
        2.1.3 PCR引物及测序第37页
        2.1.4 质粒第37-38页
        2.1.5 主要仪器设备第38页
        2.1.6 主要缓冲液和试剂溶液第38页
        2.1.7 培养基第38页
            2.1.7.1 苯胺兰高糖平板培养基(HSAB)第38页
            2.1.7.2 其他培养基第38页
    2.2 方法第38-60页
        2.2.1 一般方法第38-47页
            2.2.1.1 大肠杆菌的培养第38-39页
            2.2.1.2 嗜热细菌的培养第39页
            2.2.1.3 采集微生物样品及分离第39页
            2.2.1.4 菌种保藏第39页
            2.2.1.5 细菌基因组总DNA提取第39-40页
            2.2.1.6 质粒提取第40-41页
            2.2.1.7 目的DNA片段的回收和纯化第41-42页
            2.2.1.8 大肠杆菌化学法感受态的制备第42页
            2.2.1.9 DNA酶切与连接第42页
            2.2.1.10 化学法转化第42-43页
            2.2.1.11 阳性克隆重组子的筛选和酶切验证第43页
            2.2.1.12 重组子质粒的验证第43页
            2.2.1.13 大肠杆菌重组蛋白粗酶的提取第43-44页
            2.2.1.14 重组蛋白表达产物的SDS-PAGE电泳第44页
            2.2.1.15 金属镍亲和层析纯化酶第44-45页
            2.2.1.16 细菌的16SrDNA克隆及测序第45页
            2.2.1.17 蛋白质含量标准曲线制作第45-46页
            2.2.1.18 葡萄糖标准曲线的制作第46-47页
        2.2.2 左聚糖蔗糖酶基因克隆及表达载体构建第47-55页
            2.2.2.1 SacB基因克隆第47页
            2.2.2.2 PCR扩增方法第47-48页
            2.2.2.3 表达载体构建第48-51页
            2.2.2.4 外源基因片段的诱导表达第51页
            2.2.2.5 重组左聚糖蔗糖酶的纯化第51页
            2.2.2.6 左聚糖蔗糖酶水解活力的测定第51-52页
            2.2.2.7 左聚糖蔗糖酶水解活力的酶学性质测定第52-53页
            2.2.2.8 左聚糖蔗糖酶聚合活力的测定第53页
            2.2.2.9 左聚糖蔗糖酶聚合活力性质测定第53-54页
            2.2.2.10 左聚糖蔗糖酶生成左聚糖的产物组成分析第54-55页
        2.2.3 左聚糖蔗糖酶高通量筛选体系的建立第55-56页
            2.2.3.1 左聚糖蔗糖酶产生菌野生型突变体的筛选第55页
            2.2.3.2 左聚糖蔗糖酶突变体大肠杆菌重组子的筛选第55-56页
        2.2.4 左聚糖蔗糖酶基因定向进化第56-57页
            2.2.4.1 易错PCR引物第56页
            2.2.4.2 易错PCR方法第56-57页
        2.2.5 左聚糖蔗糖酶融合蛋白的设计与构建第57-59页
            2.2.5.1 左聚糖蔗糖酶融合基因的设计第57-58页
            2.2.5.2 融合蛋白PCR引物的设计第58页
            2.2.5.3 PCR扩增及载体构建第58-59页
        2.2.6 左聚糖蔗糖酶三维结构同源建模第59-60页
            2.2.6.1 构建三维结构同源模型第59页
            2.2.6.2 同源建模结果分析第59-60页
第三章 结果与分析第60-122页
    3.1 产左聚糖蔗糖酶芽孢杆菌的筛选第60-63页
        3.1.1 产左聚糖蔗糖酶野生型突变株筛选体系的建立第60-62页
        3.1.2 嗜热菌Geobacillus sp. HB1的分离第62页
        3.1.3 菌株的鉴定及系统树建立第62-63页
    3.2 芽孢杆菌左聚糖蔗糖酶基因的克隆第63-73页
        3.2.1 枯草芽孢杆菌左聚糖蔗糖酶(levansucrase) SacB基因的克隆第63-69页
            3.2.1.1 表达载体pSE-SS54A和pSE-SS56A的构建第65-67页
            3.2.1.2 重组蛋白SS54A和SS56A在大肠杆菌中的诱导表达及纯化第67-69页
        3.2.2 从嗜热菌Geobacillus sp. HB1克隆SacB基因第69-71页
            3.2.2.1 基因HBR1的PCR扩增第69页
            3.2.2.2 表达载体pET-HBR1的构建第69-70页
            3.2.2.3 重组蛋白HBR1在大肠杆菌的诱导表达及纯化第70-71页
        3.2.3 从嗜热地芽孢杆菌克隆SacB基因第71-73页
            3.2.3.1 基因9823SB的PCR扩增第71页
            3.2.3.2 表达载体pET-9823SB的构建第71-72页
            3.2.3.3 重组蛋白9823SB在大肠杆菌的诱导表达及纯化第72-73页
    3.3 左聚糖蔗糖酶基因的分子改造第73-79页
        3.3.1 左聚糖蔗糖酶重组子高效筛选体系的建立第73-75页
        3.3.2 易错PCR突变体库建立第75页
        3.3.3 左聚糖蔗糖酶基因突变体的筛选第75-78页
        3.3.4 重组蛋白T305A在大肠杆菌的诱导表达及纯化第78-79页
    3.4 左聚糖蔗糖酶融合蛋白的设计和构建第79-81页
        3.4.1 融合蛋白所需基因片段的克隆第79-80页
        3.4.2 两步连接法构建融合蛋白表达载体pSE-STHB6第80页
        3.4.3 重组融合蛋白STHB6的诱导表达及纯化第80-81页
    3.5 重组左聚糖蔗糖酶的序列比对分析第81-90页
        3.5.1 重组左聚糖蔗糖酶基因的核苷酸序列比对分析第81页
        3.5.2 重组左聚糖蔗糖酶的氨基酸序列比对分析第81-90页
    3.6 重组左聚糖蔗糖酶的酶学性质研究第90-116页
        3.6.1 重组左聚糖蔗糖酶水解酶活性的研究第90-103页
            3.6.1.1 水解活力最适pH的研究第90-92页
            3.6.1.2 水解活力最适温度的研究第92-95页
            3.6.1.3 水解活力热稳定性的研究第95-98页
            3.6.1.4 水解活力的Km值和Vmax值测定第98-100页
            3.6.1.5 部分金属离子和去污剂对左聚糖蔗糖酶水解活力的影响第100-103页
        3.6.2 重组左聚糖蔗糖酶聚合酶活性的研究第103-116页
            3.6.2.1 pH对左聚糖蔗糖酶产生左聚糖的影响第103-105页
            3.6.2.2 温度对左聚糖蔗糖酶产左聚糖的影响第105-108页
            3.6.2.3 蔗糖底物浓度对左聚糖蔗糖酶产生左聚糖的影响第108-110页
            3.6.2.4 反应时间对左聚糖蔗糖酶产生左聚糖的影响第110-112页
            3.6.2.5 左聚糖蔗糖酶催化蔗糖生成产物的初步鉴定分析第112-116页
    3.7 重组左聚糖蔗糖酶三维结构的同源建模及分析第116-122页
        3.7.1 重组蛋白的同源建模方法第116页
        3.7.2 重组蛋白的三维结构比对分析第116-122页
第四章 结论与展望第122-127页
    4.1 结论第122-124页
        4.1.1 建立了野生型产左聚糖蔗糖酶菌株的快速筛选方法第122页
        4.1.2 建立了一步法高效筛选左聚糖蔗糖酶重组子的平板选择方法第122页
        4.1.3 克隆了多个芽孢杆菌左聚糖蔗糖酶基因第122页
        4.1.4 表达和纯化了多个重组左聚糖蔗糖酶并研究了其酶学性质第122-123页
        4.1.5 分子改造获得了高底物浓度下高转化率的左聚糖蔗糖酶突变体第123页
        4.1.6 构建了可在高温高底物浓度下高效合成左聚糖的融合蛋白左聚糖蔗糖酶第123-124页
        4.1.7 通过同源建模比对分析氨基酸残基功能第124页
    4.2 讨论第124-126页
    4.3 展望第126-127页
参考文献第127-138页
附录第138-144页
致谢第144-145页
攻读学位期间发表论文情况第145页

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