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长链非编码RNA在脂多糖刺激的大鼠肠巨噬细胞中表达谱分析

摘要第5-7页
ABSTRACT第7-8页
第一章 引言第13-18页
    1.1 肠巨噬细胞与肠道屏障功能第13页
    1.2 长链非编码RNA的定义第13-14页
    1.3 长链非编码RNA的功能第14-15页
    1.4 长链非编码RNA与疾病第15-16页
    1.5 LncRNA在炎症中的作用第16-17页
    1.6 本次研究的目的:肠屏障中肠巨噬细胞炎症模型的lncRNA表达谱第17-18页
第二章 LPS诱导大鼠肠巨噬细胞中lncRNA的差异表达谱第18-38页
    2.1 实验材料第18-19页
        2.1.1 实验对象第18页
        2.1.2 主要实验试剂第18-19页
        2.1.3 主要仪器第19页
    2.2 实验方法第19-28页
        2.2.1 肠巨噬细胞的分离培养和分组第19-20页
        2.2.2 大鼠的肠巨噬细胞鉴定第20页
        2.2.3 用Trizol抽提法提取大鼠的肠巨噬细胞总RNA第20-21页
        2.2.4 总RNA质控第21页
        2.2.5 基因芯片实验第21-28页
    2.3 基因芯片结果中差异lncRNA和mRNA的统计分析第28页
    2.4 实验结果第28-35页
        2.4.1 大鼠肠巨噬细胞分离培养与鉴定第28页
        2.4.2 RNA质检结果第28-29页
        2.4.3 基因芯片分析差异表达的lncRNA第29-31页
        2.4.4 基因芯片分析差异表达的mRNA第31-33页
        2.4.5 差异表达lncRNA和mRNA的聚类分析第33-35页
    2.5 讨论第35-36页
    2.6 小结第36-38页
第三章 差异表达基因的初步生物信息学分析第38-55页
    3.1 实验材料和方法第38-40页
        3.1.1 GO分析(基因功能分析)第38页
        3.1.2 通路分析第38-39页
        3.1.3 lncRNA- mRNA共表达网络第39-40页
    3.2 差异表达lncRNA和mRNA生物信息学统计分析第40页
    3.3 实验结果第40-50页
        3.3.1 基因功能分析第40-43页
        3.3.2 Pathway分析第43-46页
        3.3.3 LncRNA-mRNA-Network第46-50页
    3.4 讨论第50-53页
    3.5 小结第53-55页
第四章 验证差异表达的lncRNA和mRNA第55-61页
    4.1 实验材料第55-56页
        4.1.1 主要实验试剂第55页
        4.1.2 主要仪器第55-56页
    4.2 实验方法第56-59页
        4.2.1 总RNA提取及质检第56页
        4.2.2 运用实时定量PCR验证基因芯片结果第56-59页
    4.3 PCR结果的统计分析第59页
    4.4 PCR验证结果第59-60页
    4.5 讨论第60页
    4.6 小结第60-61页
第五章 总结第61-62页
参考文献第62-71页
致谢第71-72页
攻读学位期间发表的文章第72页

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