摘要 | 第5-7页 |
ABSTRACT | 第7-8页 |
第一章 引言 | 第13-18页 |
1.1 肠巨噬细胞与肠道屏障功能 | 第13页 |
1.2 长链非编码RNA的定义 | 第13-14页 |
1.3 长链非编码RNA的功能 | 第14-15页 |
1.4 长链非编码RNA与疾病 | 第15-16页 |
1.5 LncRNA在炎症中的作用 | 第16-17页 |
1.6 本次研究的目的:肠屏障中肠巨噬细胞炎症模型的lncRNA表达谱 | 第17-18页 |
第二章 LPS诱导大鼠肠巨噬细胞中lncRNA的差异表达谱 | 第18-38页 |
2.1 实验材料 | 第18-19页 |
2.1.1 实验对象 | 第18页 |
2.1.2 主要实验试剂 | 第18-19页 |
2.1.3 主要仪器 | 第19页 |
2.2 实验方法 | 第19-28页 |
2.2.1 肠巨噬细胞的分离培养和分组 | 第19-20页 |
2.2.2 大鼠的肠巨噬细胞鉴定 | 第20页 |
2.2.3 用Trizol抽提法提取大鼠的肠巨噬细胞总RNA | 第20-21页 |
2.2.4 总RNA质控 | 第21页 |
2.2.5 基因芯片实验 | 第21-28页 |
2.3 基因芯片结果中差异lncRNA和mRNA的统计分析 | 第28页 |
2.4 实验结果 | 第28-35页 |
2.4.1 大鼠肠巨噬细胞分离培养与鉴定 | 第28页 |
2.4.2 RNA质检结果 | 第28-29页 |
2.4.3 基因芯片分析差异表达的lncRNA | 第29-31页 |
2.4.4 基因芯片分析差异表达的mRNA | 第31-33页 |
2.4.5 差异表达lncRNA和mRNA的聚类分析 | 第33-35页 |
2.5 讨论 | 第35-36页 |
2.6 小结 | 第36-38页 |
第三章 差异表达基因的初步生物信息学分析 | 第38-55页 |
3.1 实验材料和方法 | 第38-40页 |
3.1.1 GO分析(基因功能分析) | 第38页 |
3.1.2 通路分析 | 第38-39页 |
3.1.3 lncRNA- mRNA共表达网络 | 第39-40页 |
3.2 差异表达lncRNA和mRNA生物信息学统计分析 | 第40页 |
3.3 实验结果 | 第40-50页 |
3.3.1 基因功能分析 | 第40-43页 |
3.3.2 Pathway分析 | 第43-46页 |
3.3.3 LncRNA-mRNA-Network | 第46-50页 |
3.4 讨论 | 第50-53页 |
3.5 小结 | 第53-55页 |
第四章 验证差异表达的lncRNA和mRNA | 第55-61页 |
4.1 实验材料 | 第55-56页 |
4.1.1 主要实验试剂 | 第55页 |
4.1.2 主要仪器 | 第55-56页 |
4.2 实验方法 | 第56-59页 |
4.2.1 总RNA提取及质检 | 第56页 |
4.2.2 运用实时定量PCR验证基因芯片结果 | 第56-59页 |
4.3 PCR结果的统计分析 | 第59页 |
4.4 PCR验证结果 | 第59-60页 |
4.5 讨论 | 第60页 |
4.6 小结 | 第60-61页 |
第五章 总结 | 第61-62页 |
参考文献 | 第62-71页 |
致谢 | 第71-72页 |
攻读学位期间发表的文章 | 第72页 |