| 摘要 | 第11-15页 |
| ABSTRACT | 第15-20页 |
| 缩略词表 | 第21-22页 |
| 第一章 前言 | 第22-36页 |
| 1 新梢白化茶树生理生化及其叶色形成机理研究进展 | 第22-27页 |
| 1.1 茶树新梢白化类型 | 第22-23页 |
| 1.1.1 根据茶树与生态环境的关系分类 | 第22页 |
| 1.1.2 根据茶树新梢的颜色分类 | 第22-23页 |
| 1.2 生理水平研究 | 第23页 |
| 1.2.1 显微及超微结构研究 | 第23页 |
| 1.2.2 酶活性研究 | 第23页 |
| 1.3 生化水平研究 | 第23-24页 |
| 1.4 分子水平研究 | 第24-27页 |
| 1.4.1 茶树芽叶白化种质DNA分子标记研究 | 第24-25页 |
| 1.4.2 茶树新梢白化基因差异表达研究 | 第25-26页 |
| 1.4.3 与品质和叶色相关基因的克隆 | 第26页 |
| 1.4.4 茶树新梢白化蛋白质组学研究 | 第26-27页 |
| 2 植物白化叶色产生机制 | 第27-30页 |
| 2.1 外在因素 | 第27页 |
| 2.2 内在因素 | 第27-30页 |
| 2.2.1 光合色素生物合成途径中的基因突变 | 第27-29页 |
| 2.2.2 叶绿体分化与发育相关基因的突变 | 第29页 |
| 2.2.3 捕光色素蛋白复合体相关的基因突变 | 第29-30页 |
| 2.2.4 光敏色素生色团生物途径中基因突变 | 第30页 |
| 2.2.5 与光合系统无直接关系的基因突变 | 第30页 |
| 3 RNA-SEQ和DGE技术及其在基因差异表达中的应用 | 第30-32页 |
| 3.1 RNA-Seq和DGE技术原理及其优势 | 第31页 |
| 3.2 RNA-Seq和DGE技术在茶树基因差异表达上的应用现状及前景 | 第31-32页 |
| 4 本研究的目的及意义 | 第32-33页 |
| 5 研究内容 | 第33-35页 |
| 5.1 确定‘白鸡冠’茶树叶色白化的类型 | 第33页 |
| 5.2 ‘白鸡冠’茶树响应光调控的转录组特征分析 | 第33页 |
| 5.3 ‘白鸡冠’茶树响应光调控的基因表达谱差异分析 | 第33页 |
| 5.4 ‘白鸡冠’茶树响应光调控和叶色白化相关基因的挖掘 | 第33页 |
| 5.5 光照对‘白鸡冠’茶树超微结构及体内防御酶的影响研究 | 第33-34页 |
| 5.6 光照对‘白鸡冠’茶树主要呈味物质及香气组分的影响研究 | 第34-35页 |
| 6 技术路线 | 第35-36页 |
| 第二章 光照和温度对‘白鸡冠,茶树新梢白化的影响 | 第36-47页 |
| 1 材料与方法 | 第36-38页 |
| 1.1 试验材料 | 第36-37页 |
| 1.2 试验方法 | 第37-38页 |
| 1.2.1 叶绿素含量检测 | 第37-38页 |
| 1.2.2 数据统计与分析 | 第38页 |
| 2 结果与分析 | 第38-45页 |
| 2.1 ‘白鸡冠’在自然条件下的表型及叶绿素积累特性 | 第38-40页 |
| 2.1.1 自然条件下表型特征 | 第38-39页 |
| 2.1.2 自然条件下光合色素分析 | 第39-40页 |
| 2.2 光照和温度对‘白鸡冠’茶树白化表型及色素含量的影响 | 第40-45页 |
| 2.2.1 光强和温度对‘白鸡冠’茶树表型及色素含量的影响 | 第40-43页 |
| 2.2.2 不同遮荫程度对‘白鸡冠’表型及叶绿素相对含量的影响 | 第43-44页 |
| 2.2.3 半叶法遮荫对‘白鸡冠’茶树白化表型和叶绿素的影响 | 第44-45页 |
| 3 讨论 | 第45-46页 |
| 3.1 光照对新梢白化茶树表型性状的影响 | 第45-46页 |
| 3.2 确定以外界遮荫进行取样 | 第46页 |
| 4 小结 | 第46-47页 |
| 第三章 ‘白鸡冠’茶树叶片应答光照的转录组分析 | 第47-62页 |
| 1 材料与方法 | 第47-51页 |
| 1.1 试验材料 | 第47页 |
| 1.2 试验方法 | 第47-51页 |
| 1.2.1 茶树总RNA提取及质量检测 | 第47-48页 |
| 1.2.2 cDNA文库构建及Illumina高通量测序 | 第48-49页 |
| 1.2.3 数据评估、组装及功能注释 | 第49-51页 |
| 2 结果与分析 | 第51-60页 |
| 2.1 茶树总RNA提取质量分析 | 第51-52页 |
| 2.2 De novo转录本测序和组装结果 | 第52-53页 |
| 2.3 基因注释 | 第53-60页 |
| 2.3.1 功能注释结果统计 | 第53-55页 |
| 2.3.2 GO分类 | 第55-57页 |
| 2.3.3 KOG注释 | 第57-58页 |
| 2.3.4 KEGG通路注释 | 第58-59页 |
| 2.3.5 转录因子 | 第59-60页 |
| 3 讨论 | 第60-61页 |
| 4 小结 | 第61-62页 |
| 第四章 ‘白鸡冠’茶树叶片差异基因表达谱(DGE)特征分析 | 第62-79页 |
| 1 材料与方法 | 第62-64页 |
| 1.1 试验材料 | 第62页 |
| 1.2 试验方法 | 第62-64页 |
| 1.2.1 RNA提取及质量检测 | 第62页 |
| 1.2.2 文库构建及测序 | 第62页 |
| 1.2.3 数据评估、组装及功能注释 | 第62-63页 |
| 1.2.4 基因表达水平分析 | 第63页 |
| 1.2.5 差异基因表达分析 | 第63-64页 |
| 1.2.6 上调和下调差异表达基因火山图 | 第64页 |
| 1.2.7 差异基因GO富集分析 | 第64页 |
| 1.2.8 差异基因KEGG富集分析 | 第64页 |
| 2 结果与分析 | 第64-77页 |
| 2.1 测序数据的产出和表达谱reads的注释 | 第64-65页 |
| 2.2 样品间相关性检验 | 第65-66页 |
| 2.3 不同处理组之间的差异表达基因分析 | 第66-67页 |
| 2.4 上调和下调差异表达基因火山图 | 第67-68页 |
| 2.5 差异表达基因GO功能富集分析 | 第68-73页 |
| 2.5.1 下调差异基因的GO富集分析 | 第68-73页 |
| 2.5.2 上调差异基因的GO富集分析 | 第73页 |
| 2.6 差异基因的KEGG代谢通路富集分析及其表达模式 | 第73-77页 |
| 3 讨论 | 第77-78页 |
| 3.1 无参转录组测序结合基因表达谱测序的适用性探讨 | 第77页 |
| 3.2 DGE技术的高重复性及其高通量 | 第77-78页 |
| 3.3 差异表达基因及其模式分析 | 第78页 |
| 4 小结 | 第78-79页 |
| 第五章 ‘白鸡冠’茶树响应光调控及叶色相关基因挖掘 | 第79-106页 |
| 1 材料与方法 | 第79-81页 |
| 1.1 试验材料 | 第79页 |
| 1.2 试验方法 | 第79-81页 |
| 1.2.1 茶树共有差异表达基因维恩图 | 第79页 |
| 1.2.2 GO注释及DAG功能富集 | 第79-80页 |
| 1.2.3 实时荧光定量PCR验证 | 第80-81页 |
| 2 结果与分析 | 第81-104页 |
| 2.1 不同遮荫处理时间差异基因集分析 | 第81-90页 |
| 2.1.1 不同遮荫处理时间差异基因对比 | 第81页 |
| 2.1.2 处理组间共有上调差异表达基因GO注释及其功能富集 | 第81-85页 |
| 2.1.3 处理组间共有下调差异表达基因GO注释及其功能富集 | 第85-88页 |
| 2.1.4 处理组共有差异表达基因鉴定转录因子 | 第88-90页 |
| 2.2 处理组与对照组差异基因集分析 | 第90-95页 |
| 2.2.1 处理组与对照组差异基因对比 | 第90-91页 |
| 2.2.2 处理间(T6d_Z vs.T3d_Z)上调差异表达基因GO注释及其功能富集 | 第91页 |
| 2.2.3 处理间(T6d_Z vs.T3d_Z)下调差异表达基因GO注释及其功能富集 | 第91-95页 |
| 2.3 响应光调控及叶色相关基因实时荧光定量PCR验证 | 第95-104页 |
| 2.3.1 RNA电泳图 | 第95-96页 |
| 2.3.2 目的基因及内参基因扩增效率分析 | 第96-97页 |
| 2.3.3 荧光定量PCR验证DEGs | 第97-99页 |
| 2.3.4 遮荫对‘白鸡冠’叶片叶绿素代谢途径关键基因表达的影响及其表达模式 | 第99-100页 |
| 2.3.5 ‘白鸡冠’不同叶位叶绿素代谢途径相关基因表达模式分析 | 第100-104页 |
| 3 讨论 | 第104-105页 |
| 3.1 响应光信号的转录因子 | 第104-105页 |
| 3.2 富集与细胞壁重构相关基因 | 第105页 |
| 3.3 叶绿素合成途径基因受抑制 | 第105页 |
| 4 小结 | 第105-106页 |
| 第六章 ‘白鸡冠’茶树响应光调控的生理生化变化 | 第106-126页 |
| 1 材料与方法 | 第107-112页 |
| 1.1 试验材料 | 第107-108页 |
| 1.2 试验方法 | 第108-112页 |
| 1.2.1 叶绿体超微结构检测 | 第108-109页 |
| 1.2.2 茶树体内防御酶及丙二醛检测 | 第109-111页 |
| 1.2.3 光合色素测定 | 第111页 |
| 1.2.4 茶树主要呈味物质测定 | 第111页 |
| 1.2.5 茶树香气成分测定 | 第111-112页 |
| 1.2.6 数据统计与分析 | 第112页 |
| 2 结果与分析 | 第112-123页 |
| 2.1 光照对叶绿体超微结构的影响 | 第112-115页 |
| 2.2 光照对‘白鸡冠’茶树保护性酶酶活性及MDA变化 | 第115-117页 |
| 2.2.1 遮荫前‘白鸡冠’茶树保护性酶酶活性及MDA含量 | 第115-116页 |
| 2.2.2 遮荫处理对‘白鸡冠’茶树保护性酶酶活性及MDA的影响 | 第116-117页 |
| 2.3 光照对‘白鸡冠’光合色素的影响 | 第117-118页 |
| 2.4 光照对‘白鸡冠’主要呈味物质的影响 | 第118-120页 |
| 2.4.1 不同季节‘白鸡冠’主要呈味物质分析 | 第118-119页 |
| 2.4.2 光强对‘白鸡冠’主要呈味物质的影响 | 第119-120页 |
| 2.5 光强对‘白鸡冠’茶树香气的影响 | 第120-123页 |
| 3 讨论 | 第123-125页 |
| 3.1 光照对新梢白化茶树叶绿体结构的影响 | 第123-124页 |
| 3.2 光照对新梢白化茶树体内过氧化物酶的影响 | 第124页 |
| 3.3 光照对新梢白化茶树色素积累的影响 | 第124页 |
| 3.4 光照对新梢白化茶树主要呈味物质的影响 | 第124-125页 |
| 3.5 光照对‘白鸡冠’茶树香气成分的影响 | 第125页 |
| 4 小结 | 第125-126页 |
| 第七章 总结与讨论 | 第126-131页 |
| 7.1 本研究主要研究结果 | 第126-127页 |
| 7.2 讨论 | 第127-130页 |
| 7.2.1 ‘白鸡冠’叶色表型及叶绿体发育与光合系统Ⅱ密切相关 | 第127-128页 |
| 7.2.2 遮荫降低光氧化损伤,修复叶绿体结构 | 第128页 |
| 7.2.3 ‘白鸡冠’白化表型与光合色素代谢和叶绿体发育密切相关 | 第128-130页 |
| 7.3 展望 | 第130-131页 |
| 参考文献 | 第131-139页 |
| 附录 | 第139-150页 |
| 致谢 | 第150-152页 |
| 作者简介 | 第152-153页 |
