| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 缩略词表 | 第7-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-21页 |
| 1.1 涩味的形成 | 第10-14页 |
| 1.1.1 单宁 | 第10-11页 |
| 1.1.2 儿茶素 | 第11-12页 |
| 1.1.3 多糖,有机酸和涩味之间的关系 | 第12-13页 |
| 1.1.4 涩味物质在果实中的分布 | 第13-14页 |
| 1.2 单宁及儿茶素合成途径 | 第14-17页 |
| 1.3 转录组 | 第17-19页 |
| 1.3.1 RNA-Seq测序技术 | 第17-18页 |
| 1.3.2 RNA-Seq在葫芦科蔬菜研究中的应用 | 第18-19页 |
| 1.4 黄瓜涩味物质研究进展 | 第19-20页 |
| 1.5 研究目的及意义 | 第20-21页 |
| 第二章 基于转录组的黄瓜涩味相关基因挖掘 | 第21-39页 |
| 2.1 实验材料 | 第21页 |
| 2.2 实验方法 | 第21-23页 |
| 2.2.1 总RNA提取方法 | 第21-22页 |
| 2.2.2 文库构建 | 第22页 |
| 2.2.3 上机测序 | 第22-23页 |
| 2.3 数据分析 | 第23-26页 |
| 2.3.1 数据分析流程图如下 | 第23页 |
| 2.3.2 分析内容 | 第23页 |
| 2.3.3 数据预处理 | 第23-24页 |
| 2.3.4 基因组比对 | 第24页 |
| 2.3.5 基因水平表达定量 | 第24-25页 |
| 2.3.6 基因差异表达分析 | 第25页 |
| 2.3.7 差异表达基因的GO富集分析 | 第25页 |
| 2.3.8 KEGG富集分析 | 第25-26页 |
| 2.4 结果分析 | 第26-39页 |
| 2.4.1 测序数据统计分析 | 第26-27页 |
| 2.4.2 基因组覆盖 | 第27-28页 |
| 2.4.3 表达谱差异分析 | 第28-29页 |
| 2.4.4 差异基因分析 | 第29-35页 |
| 2.4.5 差异基因GO功能注释和KEGG富集分析 | 第35页 |
| 2.4.6 候选基因确定 | 第35-36页 |
| 2.4.7 讨论 | 第36-39页 |
| 第三章 黄瓜涩味候选基因qRT-PCR验证 | 第39-51页 |
| 3.1 转录组结果qRT-PCR验证 | 第39-45页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第39页 |
| 3.1.2 总RNA提取及RNA检测 | 第39页 |
| 3.1.3 cDNA第一链的合成 | 第39页 |
| 3.1.4 引物设计与适合性检验 | 第39-40页 |
| 3.1.5 实时荧光定量PCR扩增 | 第40-41页 |
| 3.1.6 数据处理分析 | 第41页 |
| 3.1.7 结果与分析 | 第41-45页 |
| 3.2 不同涩味黄瓜品种qRT-PCR分析 | 第45-48页 |
| 3.2.1 实验材料 | 第45页 |
| 3.2.2 总RNA提取及RNA检测 | 第45-46页 |
| 3.2.3 cDNA第一链的合成 | 第46页 |
| 3.2.4 引物设计与适合性检验 | 第46页 |
| 3.2.5 实时荧光定量PCR扩增 | 第46页 |
| 3.2.6 数据处理分析 | 第46页 |
| 3.2.7 结果与分析 | 第46-48页 |
| 3.3 讨论 | 第48-51页 |
| 全文结论 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-60页 |
| 致谢 | 第60-62页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第62-63页 |