| 摘要 | 第7-10页 |
| ABSTRACT | 第10-13页 |
| 缩略词表 | 第14-15页 |
| 1 前言 | 第15-43页 |
| 1.1 研究问题的由来 | 第15-16页 |
| 1.2 文献综述 | 第16-42页 |
| 1.2.1 代谢组概述 | 第16-22页 |
| 1.2.1.1 代谢物与代谢组 | 第16-17页 |
| 1.2.1.2 代谢组学的发展 | 第17-19页 |
| 1.2.1.3 代谢组的分析方法 | 第19-21页 |
| 1.2.1.4 水稻的代谢组研究进展 | 第21-22页 |
| 1.2.2 代谢数量性状 | 第22-23页 |
| 1.2.3 代谢数量性状定位群体 | 第23-27页 |
| 1.2.3.1 双亲本群体 | 第23-24页 |
| 1.2.3.2 自然群体 | 第24-25页 |
| 1.2.3.3 多亲本群体 | 第25-27页 |
| 1.2.4 分子标记 | 第27-30页 |
| 1.2.4.1 以分子杂交技术为基础的分子标记 | 第27-28页 |
| 1.2.4.2 以PCR技术为基础的分子标记 | 第28-29页 |
| 1.2.4.3 以核苷酸序列为基础的分子标记 | 第29-30页 |
| 1.2.5 代谢数量性状分析 | 第30-33页 |
| 1.2.5.1 连锁分析 | 第30-31页 |
| 1.2.5.2 关联分析 | 第31-32页 |
| 1.2.5.3 上位性分析 | 第32-33页 |
| 1.2.6 mQTL研究进展 | 第33-36页 |
| 1.2.6.1 拟南芥中的mQTL研究 | 第33-34页 |
| 1.2.6.2 水稻中的mQTL研究 | 第34-35页 |
| 1.2.6.3 其它作物中的mQTL研究 | 第35-36页 |
| 1.2.7 代谢性状和mQTL的特异性 | 第36-38页 |
| 1.2.7.1 代谢性状的时空特异性 | 第36-37页 |
| 1.2.7.2 mQTL的分布与特异性 | 第37-38页 |
| 1.2.8 代谢途径和调控网络 | 第38-40页 |
| 1.2.9 系统性的遗传基因组研究 | 第40-42页 |
| 1.2.9.1 mQTL与其它QTL | 第40-41页 |
| 1.2.9.2 代谢组与分子设计育种 | 第41-42页 |
| 1.3 研究目的和意义 | 第42-43页 |
| 2 材料与方法 | 第43-51页 |
| 2.1 实验材料 | 第43-44页 |
| 2.1.1 水稻材料 | 第43页 |
| 2.1.2 菌株和载体 | 第43-44页 |
| 2.2 实验方法 | 第44-51页 |
| 2.2.1 田间种植 | 第44-45页 |
| 2.2.2 代谢样品取样 | 第45-47页 |
| 2.2.2.1 RIL群体发芽 72 h种子代谢样品 | 第45页 |
| 2.2.2.2 RIL群体抽穗期剑叶代谢样品 | 第45-46页 |
| 2.2.2.3 RIL群体灌浆期种子代谢样品 | 第46页 |
| 2.2.2.4 RIL群体成熟期干种子代谢样品 | 第46-47页 |
| 2.2.2.5 IL群体及自然群体代谢样品 | 第47页 |
| 2.2.3 代谢样品检测 | 第47-48页 |
| 2.2.3.1 代谢样品预处理 | 第47页 |
| 2.2.3.2 代谢样品抽提 | 第47页 |
| 2.2.3.3 代谢样品检测及数据处理 | 第47-48页 |
| 2.2.4 代谢性状数据分析 | 第48页 |
| 2.2.5 mQTL定位 | 第48-49页 |
| 2.2.6 两位点互作分析 | 第49页 |
| 2.2.7 测序及序列拼接 | 第49-50页 |
| 2.2.8 载体构建 | 第50页 |
| 2.2.9 遗传转化 | 第50页 |
| 2.2.10 RNA抽提、RT-PCR和Real-time PCR | 第50-51页 |
| 3 结果与分析 | 第51-96页 |
| 3.1 广泛定向检测水稻代谢组的方法 | 第51-54页 |
| 3.2 水稻抽穗期剑叶和发芽 72 h种子的mQTL研究 | 第54-80页 |
| 3.2.1 抽穗期剑叶和发芽 72 h种子的代谢组 | 第54-57页 |
| 3.2.2 代谢性状的分布与统计 | 第57-59页 |
| 3.2.3 mQTL定位 | 第59-62页 |
| 3.2.4 mQTL分布 | 第62-65页 |
| 3.2.5 两位点互作分析 | 第65-69页 |
| 3.2.6 mQTL定位结果验证 | 第69-72页 |
| 3.2.7 筛选候选基因 | 第72-76页 |
| 3.2.8 构建代谢途径 | 第76-80页 |
| 3.3 水稻不同发育时期种子的mQTL研究 | 第80-90页 |
| 3.3.1 三个发育时期种子的代谢组检测 | 第80-81页 |
| 3.3.2 代谢性状统计及mQTL定位 | 第81-82页 |
| 3.3.3 mQTL的分布 | 第82-85页 |
| 3.3.4 三个时期的比较分析 | 第85-88页 |
| 3.3.4.1 代谢性状的比较 | 第85-86页 |
| 3.3.4.2 mQTL的比较 | 第86-88页 |
| 3.3.5 筛选候选基因 | 第88-90页 |
| 3.4 水稻代谢相关基因克隆 | 第90-96页 |
| 4 讨论 | 第96-103页 |
| 4.1 检测方法的拓展 | 第96-97页 |
| 4.2 定位群体的局限性 | 第97-98页 |
| 4.3 寻找更多的mQTL热点 | 第98-99页 |
| 4.4 候选基因的克隆与应用 | 第99-100页 |
| 4.5 代谢性状与其它类型性状的联系 | 第100-103页 |
| 5 展望 | 第103-104页 |
| 参考文献 | 第104-120页 |
| 附录 | 第120-135页 |
| 附表I 附表 | 第120-130页 |
| 附录II 代谢物缩写全称 | 第130-131页 |
| 附录III 部分实验的详细步骤 | 第131-133页 |
| 附录IV 作者简介 | 第133-135页 |
| 致谢 | 第135-137页 |
