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Saccharomyces cerevisiae OYE2分子改造及其在不对称合成(R)-香茅醛中的应用

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-8页
第一章 绪论第13-29页
    1.1 (R)-香茅醛简介第13-15页
        1.1.1 手性化合物第13-14页
        1.1.2 香茅醛的简介第14-15页
    1.2 柠檬醛第15-19页
        1.2.1 柠檬醛的简介第15-16页
        1.2.2 柠檬醛的立体选择性第16-18页
            1.2.2.1 柠檬醛的C=O加氢第17-18页
            1.2.2.2 柠檬醛α,β位C=C加氢第18页
        1.2.3 氨基酸催化的柠檬醛顺反异构化反应第18-19页
    1.3 (R)-香茅醛的合成第19-22页
        1.3.1 (R)-香茅醛的化学合成第19-20页
        1.3.2 (R)-香茅醛的生物合成第20-22页
            1.3.2.1 香茅醛的微生物合成第20-21页
            1.3.2.2 烯醇还原酶合成(R)-香茅醛第21-22页
            1.3.2.3 烯醇还原酶合成(S)-香茅醛第22页
    1.4 烯醇还原酶第22-25页
        1.4.1 烯醇还原酶的来源及功能第22-23页
        1.4.2 烯醇还原酶催化机理第23-25页
    1.5 烯醇还原酶的蛋白质工程改造第25-27页
        1.5.1 烯醇还原酶S. pastorianus OYE1的改造第25-26页
        1.5.2 烯醇还原酶B. subtilis YqjM的改造第26-27页
    1.6 本论文研究背景、内容及意义第27-29页
第二章 S. cerevisiae OYE2不对称合成(R)-香茅醛第29-45页
    2.1 引言第29-30页
    2.2 实验材料第30-32页
        2.2.1 重组菌株第30页
        2.2.2 试剂第30页
        2.2.3 培养基第30-31页
        2.2.4 缓冲液第31页
            2.2.4.1 催化体系缓冲液的配制第31页
            2.2.4.2 Ni~(2+)柱蛋白纯化洗脱缓冲液的配制第31页
        2.2.5 主要仪器第31-32页
    2.3 实验方法第32-34页
        2.3.1 菌种培养第32-33页
        2.3.2 S. Cerevisiae OYE2和C. boidinii FDHCB表达和纯化第33页
            2.3.2.1 重组菌E. coli BL21/pEASY-E1-oye2诱导表达第33页
            2.3.2.2 老黄酶OYE2的分离纯化以及蛋白浓度的测定第33页
        2.3.3 (Z)-柠檬醛和(E)-柠檬醛的制备第33-34页
    2.4 异构化反应偶联不对称氢化反应的反应体系优化第34页
    2.5 色谱检测条件及各个物质标准曲线的准备第34页
    2.6 结果与讨论第34-43页
        2.6.0 烯醇还原酶OYE2和甲酸脱氢酶FDHCB表达和分离纯化第34-35页
        2.6.1 橙花醛和香叶醛的化学合成第35-37页
        2.6.2 各物质的气相色谱图及标准曲线绘制第37-38页
        2.6.3 氨基酸种类对(E/Z)-柠檬醛不对称氢化产物e.e.值的影响第38-39页
        2.6.4 甘氨酸浓度对(E/Z)-柠檬醛不对称氢化产物e.e.值的影响第39页
        2.6.5 反应pH值对(E/Z)-柠檬醛不对称氢化产物e.e.值的影响第39-40页
        2.6.6 不对称氢化反应偶联底物异构化反应的反应进程第40-41页
        2.6.7 底物与产物在OYE2催化过程中的对应关系第41-43页
    2.7 本章讨论与小结第43-45页
第三章 S. cerevisiae OYE2的分子改造及其突变子的合成应用第45-64页
    3.1 引言第45-46页
    3.2 实验材料第46-48页
        3.2.1 菌种第46页
        3.2.2 试剂第46页
        3.2.3 培养基第46页
        3.2.4 缓冲液第46-47页
        3.2.5 主要仪器、设备及相关分析软件第47-48页
    3.3 实验方法第48-53页
        3.3.1 同源建模及分子对接第48页
        3.3.2 菌种培养第48页
        3.3.3 E. coli BL21/pEASY-E1-oye2重组质粒的提取第48-49页
        3.3.4 突变库的构建第49-51页
        3.3.5 大肠杆菌E. coli BL21 (DE3)感受态的制备及转化第51页
        3.3.6 突变体阳性克隆子的初步鉴定及序列测序第51-52页
        3.3.7 OYE2突变子的分析第52-53页
            3.3.7.1 突变子诱导表达纯化第52页
            3.3.7.2 突变子催化柠檬醛不对称合成(R)-香茅醛的效果比对第52-53页
    3.4 结果与分析第53-62页
        3.4.1 同源建模及分子对接第53-56页
            3.4.1.1 S. cerevisiae OYE2同源建模第53页
            3.4.1.2 结合黄素FMN的S. cerevisiae OYE2三维结构模型第53-54页
            3.4.1.3 S. cerevisiae OYE2三维模型与底物柠檬醛的对接第54-56页
        3.4.2 菌种的培养及质粒的提取第56页
        3.4.3 突变子库的构建第56-57页
        3.4.4 突变子的诱导表达及纯化第57-58页
        3.4.5 OYE突变子不对称还原柠檬醛得率及立体选择性的对比第58-59页
        3.4.6 底物与产物在P75M催化过程中的对应关系第59-60页
        3.4.7 P75M与OYE2催化柠檬醛的效果比较第60-62页
        3.4.8 P75M 和 OYE2 分别与(Z)-柠檬醛分子对接的效果比较第62页
    3.5 本章讨论与小结第62-64页
第四章 突变文库筛选方法的探索第64-72页
    4.1 引言第64页
    4.2 实验材料第64-66页
        4.2.1 菌种第64-65页
        4.2.2 试剂第65页
        4.2.3 培养基第65-66页
        4.2.4 主要仪器、设备及相关分析软件第66页
    4.3 实验方法第66-68页
        4.3.1 菌种培养第66-67页
        4.3.2 重组蛋白诱导表达纯化第67页
        4.3.3 柠檬醛荧光反应及标准曲线的绘制第67页
        4.3.4 荧光鉴定法用于突变文库的筛选效果第67-68页
    4.4 结果与分析第68-70页
        4.4.1 柠檬醛产生荧光情况第68-69页
        4.4.2 荧光鉴定法用于突变文库的筛选效果第69-70页
    4.5 本章讨论与小结第70-72页
第五章 总结与展望第72-75页
    5.1 结论第72-73页
    5.2 展望第73-75页
参考文献第75-84页
致谢第84-85页
攻读硕士学位期间发表论文情况第85页

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