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基于梯度提升决策树的肽碎片离子强度建模

摘要第4-5页
ABSTRACT第5-6页
第一章 绪论第9-13页
    1.1 研究背景与意义第9-10页
    1.2 论文领域研究现状第10-11页
    1.3 论文主要研究内容第11-12页
    1.4 本文组织结构第12-13页
第二章 相关概念、技术和算法第13-27页
    2.1 生化知识第13-16页
        2.1.1 氨基酸和蛋白质第13-14页
        2.1.2 氨基酸属性第14-16页
    2.2 质谱技术介绍第16-20页
        2.2.1 质谱技术相关概念第16-17页
        2.2.2 质谱测序技术第17-20页
    2.3 论文在质谱中的研究第20页
    2.4 论文相关算法第20-26页
        2.4.1 决策树算法第20-21页
        2.4.2 Boosting方法第21-22页
        2.4.3 AdaBoost算法第22页
        2.4.4 梯度提升决策树算法第22-26页
    2.5 本章小结第26-27页
第三章 建模过程设计方案及评价指标第27-37页
    3.1 建模步骤第27-28页
        3.1.1 建模流程设计第27-28页
        3.1.2 建模流程解释第28页
    3.2 系统环境概述第28-31页
        3.2.1 系统开发平台第28页
        3.2.2 Python及XGBoost安装与配置第28-31页
    3.3 相关工具第31-34页
        3.3.1 pFind第31-33页
        3.3.2 XGBoost第33-34页
    3.4 评价指标第34-36页
        3.4.1 假阳性率第34页
        3.4.2 余弦相似度第34-35页
        3.4.3 皮尔森相关系数第35-36页
    3.5 实验技术路线第36页
    3.6 本章小结第36-37页
第四章 基于GBDT的离子强度建模实现第37-47页
    4.1 建模详细步骤第37-43页
        4.1.1 实验数据集及预处理第37-39页
        4.1.2 质谱数据的鉴定第39-40页
        4.1.3 鉴定结果过滤第40页
        4.1.4 数据文件构建第40-43页
        4.1.5 离子强度建模第43页
    4.2 预测模型性能评估第43-46页
        4.2.1 相似度评估第43-44页
        4.2.2 皮尔森相关系数评估第44-45页
        4.2.3 评价指标评估第45-46页
    4.3 本章小结第46-47页
第五章 总结及展望第47-49页
    5.1 总结第47页
    5.2 展望第47-49页
参考文献第49-53页
附录第53-68页
    附录1 氨基酸属性特征及解释第53-56页
    附录2 PYTHON核心代码解析第56-68页
攻读硕士期间公开发表论文及科研情况第68-69页
致谢第69页

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