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铜尾矿废弃地生态恢复过程中参与铁硫氧化和氮转化的功能微生物研究

摘要第3-5页
Abstract第5-7页
第一章 前言第11-21页
    1.1 植物修复对重金属尾矿微生物群落结构的影响第11-13页
    1.2 重金属尾矿的铁硫氧化过程研究第13-16页
    1.3 参与氮转化的功能微生物研究第16-17页
    1.4 研究区概况及主要研究问题第17-19页
    1.5 研究目的、意义、内容和技术路线第19-21页
第二章 不同酸化阶段铜尾矿活性微生物的研究第21-32页
    2.1 材料与方法第21-23页
        2.1.1 实验设计和基础化学性质测定第21-22页
        2.1.2 基因组总DNA提取和高通量测序第22页
        2.1.3 实时定量PCR第22页
        2.1.4 数据分析第22-23页
    2.2 结果与分析第23-26页
        2.2.1 葡萄糖添加对尾矿生物化学性质的影响第23-24页
        2.2.2 葡萄糖添加对微生物群落结构和组成的影响第24-26页
        2.2.3 微生物网络结构分析第26页
    2.3 讨论第26-31页
    2.4 小结第31-32页
第三章 植被重建对铜尾矿铁硫氧化的影响第32-44页
    3.1 材料与方法第32-34页
        3.1.1 野外调查和样本采集第32页
        3.1.2 尾矿中化学性质分析第32-33页
        3.1.3 尾矿中基因组总DNA提取和定量PCR第33-34页
        3.1.4 数据统计第34页
    3.2 结果与分析第34-39页
        3.2.1 不同植物群落下尾矿表层的微气候第35页
        3.2.2 不同植物群落下铜尾矿的化学性质第35-36页
        3.2.3 不同植物群落下铜尾矿的耗氧量第36-37页
        3.2.4 不同植物群落下铜尾矿的关键铁硫氧化菌数量第37-39页
    3.3 讨论第39-43页
    3.4 小结第43-44页
第四章 植被重建对铜尾矿中微生物群落组成及固氮微生物的影响第44-58页
    4.1 材料与方法第44-46页
        4.1.1 野外调查和样本采集第44-45页
        4.1.2 尾矿基础化学性质分析第45页
        4.1.3 尾矿中基因组总DNA提取,RNA的提取和分子生物学分析第45页
        4.1.4 数据分析第45-46页
    4.2 结果与分析第46-54页
        4.2.1 植被重建后铜尾矿的生物化学性质第47页
        4.2.2 植被重建后铜尾矿的微生物群落组成的差异分析第47-49页
        4.2.3 植被重建后铜尾矿中固氮菌的结构分析第49-54页
    4.3 讨论第54-57页
    4.4 小结第57-58页
第五章 铜尾矿中植物根际对氮转化功能基因的影响第58-69页
    5.1 材料与方法第58-61页
        5.1.1 调查和样本采集第58-59页
        5.1.2 基础化学性质分析和固氮、硝化和反硝化速率测定第59页
        5.1.3 功能基因定量分析第59页
        5.1.4 数据分析第59-61页
    5.2 结果与分析第61-65页
        5.2.1 植物构建对根际化学性质的影响第61页
        5.2.2 植物根际对氮转化功能基因的影响第61-64页
        5.2.3 土壤化学性质与功能基因数量与转录的关系第64-65页
    5.3 讨论第65-68页
    5.4 小结第68-69页
第六章 人工覆土方式对铜尾矿中细菌群落组成的影响第69-84页
    6.1 材料与方法第69-70页
        6.1.1 调查和样本采集第69页
        6.1.2 尾矿基础化学性质分析第69页
        6.1.3 尾矿中基因组总DNA提取和高通量测序第69-70页
        6.1.4 数据分析第70页
    6.2 结果与分析第70-77页
        6.2.1 人工覆土和直接植被重建下尾矿的物理化学性质变化第70页
        6.2.2 人工覆土和直接植被重建下尾矿细菌多样性和结构的差异第70-74页
        6.2.3 人工覆土和直接植被重建下尾矿主要优势类群的差异第74-76页
        6.2.4 人工覆土和植被重建下尾矿预测宏基因组功能的差异第76-77页
    6.3 讨论第77-82页
    6.4 小结第82-84页
第七章 铜尾矿添加Fe~(2+)和S~(2+)后的微生物研究第84-93页
    7.1 材料与方法第84-86页
        7.1.1 实验设计和基础化学性质测定第84-85页
        7.1.2 基因组总DNA提取和稳定性同位素核酸探针技术(DNA-SIP)第85页
        7.1.3 实时定量PCR和cbbL基因克隆文库的构建第85页
        7.1.4 数据分析第85-86页
    7.2 结果与分析第86-90页
        7.2.1 Fe~(2+)和S~(2+)添加对尾矿化学性质的影响第86页
        7.2.2 Fe~(2+)和S~(2+)添加后尾矿中的自养微生物第86-89页
        7.2.3 Fe~(2+)和S~(2+)的添加对尾矿中异养微生物的影响第89-90页
    7.3 讨论第90-91页
    7.4 小结第91-93页
第八章 结论与创新点第93-95页
    8.1 总结第93-94页
    8.2 创新点第94-95页
参考文献第95-118页
致谢第118-119页
攻读学位期间发表论文第119-120页

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