| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 第一章 绪论 | 第13-23页 |
| 1.1 前言 | 第13页 |
| 1.2 中药复方作用靶点和整体性作用机制研究的困难 | 第13-14页 |
| 1.3 中药靶点鉴别和分析方法综述 | 第14-19页 |
| 1.3.1 复方靶点鉴定方法 | 第14-17页 |
| 1.3.2 药物-靶点结合数据库 | 第17-18页 |
| 1.3.3 靶点功能分析方法和工具 | 第18-19页 |
| 1.4 中药复方协同整合机制研究进展 | 第19-22页 |
| 1.4.1 中药复方药效物质基础研究 | 第19-21页 |
| 1.4.2 中药复方协同整合机制研究 | 第21页 |
| 1.4.3 中药系统药理学研究 | 第21-22页 |
| 1.5 本论文研究内容 | 第22-23页 |
| 第二章 大规模药物直接靶点预测和药物重定位技术 | 第23-43页 |
| 2.1 引言 | 第23页 |
| 2.2 研究思路和内容 | 第23-24页 |
| 2.3 构建数据集 | 第24-25页 |
| 2.4 建立分子描述符矩阵 | 第25-26页 |
| 2.4.1 CDK指纹矩阵 | 第25页 |
| 2.4.2 DRAGON描述符矩阵 | 第25-26页 |
| 2.5 理论和数学模型 | 第26-27页 |
| 2.6 Z score贝叶斯网络整合 | 第27-28页 |
| 2.7 模型评价 | 第28-29页 |
| 2.7.1 模型评价标准 | 第28页 |
| 2.7.2 与 1NN模型比较 | 第28页 |
| 2.7.3 外部数据验证 | 第28-29页 |
| 2.7.4 实验验证 | 第29页 |
| 2.8 结果和讨论 | 第29-43页 |
| 2.8.1 特征分析 | 第29-32页 |
| 2.8.2 外部数据验证 | 第32页 |
| 2.8.3 靶点分类预测 | 第32-33页 |
| 2.8.4 WES模型对比 1NN模型 | 第33-34页 |
| 2.8.5 配体结构骨架跳跃分析 | 第34-40页 |
| 2.8.6 实验验证 | 第40-41页 |
| 2.8.7 讨论和展望 | 第41-43页 |
| 第三章 复方靶点的多通路、多层次协同作用研究 | 第43-67页 |
| 3.1 引言 | 第43-44页 |
| 3.2 研究方法 | 第44-46页 |
| 3.2.1 构建分子数据库 | 第44页 |
| 3.2.2 活性化合物筛选 | 第44-45页 |
| 3.2.3 靶点预测与验证 | 第45-46页 |
| 3.2.4 靶点作用通路整合 | 第46页 |
| 3.2.5 靶点功能多层次分析 | 第46页 |
| 3.3 结果和讨论 | 第46-64页 |
| 3.3.1 潜在活性成分 | 第46-51页 |
| 3.3.2 复方多通路调节 | 第51-60页 |
| 3.3.3 复方通路协同模块化分析 | 第60-61页 |
| 3.3.4 靶点的多层次组织结构 | 第61-64页 |
| 3.4 小结 | 第64-67页 |
| 第四章 复方靶点网络的功能模块协同调节研究 | 第67-87页 |
| 4.1 引言 | 第67页 |
| 4.2 研究方法 | 第67-68页 |
| 4.2.1 数据集构建 | 第67-68页 |
| 4.2.2 活性化合物筛选 | 第68页 |
| 4.2.3 靶点预测 | 第68页 |
| 4.2.4 复方作用靶点网路模块化及功能分析 | 第68页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第68-85页 |
| 4.3.1 潜在活性化合物 | 第68-80页 |
| 4.3.2 复方作用靶点功能网络 | 第80-81页 |
| 4.3.3 复方作用靶点网路模块化分析 | 第81-85页 |
| 4.4 小结 | 第85-87页 |
| 第五章 结论与展望 | 第87-89页 |
| 5.1 结论 | 第87页 |
| 5.2 展望 | 第87-89页 |
| 参考文献 | 第89-101页 |
| 缩略词 | 第101-105页 |
| 致谢 | 第105-107页 |
| 作者简介 | 第107-108页 |