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TREK-1通道的分子动力学行为研究及其配体的发现

致谢第4-6页
摘要第6-8页
Abstract第8-9页
第1章 抑郁症与TREK-1 通道第14-34页
    1.1 引言第14-16页
    1.2 TREK-1 通道的结构与功能第16-19页
    1.3 TREK-1 通道的分布与调控第19-21页
    1.4 TREK-1 通道是治疗抑郁症的新靶标第21-22页
    1.5 TREK-1 通道的活性小分子研究进展第22-24页
    1.6 本章小结第24-26页
    参考文献第26-34页
第2章 胞外pH调控TREK-1 通道失活的分子机制第34-52页
    2.1 引言第34-35页
    2.2 研究方法第35-38页
        2.2.1 模拟体系第35-36页
        2.2.2 分子动力学模拟第36-38页
    2.3 结果第38-43页
        2.3.1 TREK-1 通道的SF结构的构象变化第38-39页
        2.3.2 TREK-1 通道的SF结构周围的氢键网络第39-41页
        2.3.3 His126的质子化促进TREK-1 通道的SF结构处于不传导状态第41-43页
    2.4 讨论第43-45页
        2.4.1 TREK-1 通道的SF结构的失活构象第43页
        2.4.2 pH调控TREK-1 通道失活的分子机制第43-44页
        2.4.3 pH对钾离子通道的调控第44-45页
        2.4.4 水分子在钾离子通道失活过程中的作用第45页
    2.5 本章小结第45-47页
    参考文献第47-52页
第3章 基于TREK-1 通道的胞外Cap区的小分子发现第52-76页
    3.1 引言第52-53页
    3.2 研究方法第53-59页
        3.2.1 细胞转染与培养第53页
        3.2.2 电生理实验第53-54页
        3.2.3 共聚焦显微镜分析TREK-1 通道的内化第54页
        3.2.4 化合物第54-55页
        3.2.5 分子对接第55-56页
        3.2.6 分子动力学模拟第56页
        3.2.7 虚拟筛选第56-57页
        3.2.8 抗抑郁活性测试第57-58页
        3.2.9 实验数据的统计与分析第58-59页
    3.3 结果第59-69页
        3.3.1 小分子TKDC对TREK家族通道具有抑制活性第59-61页
        3.3.2 TREK-1 的Cap区可能是小分子TKDC的结合位点第61-63页
        3.3.3 小分子TKDC在TREK-1 通道Cap区的结合模型第63-64页
        3.3.4 TRAAK通道的Cap区突变会增加TKDC的抑制效果第64-65页
        3.3.5 小分子NH28显著提高对TRAAK的抑制效果第65页
        3.3.6 小分子TKDC可以阻断离子的传导路径第65-67页
        3.3.7 虚拟筛选发现新的TREK-1 通道抑制剂第67-68页
        3.3.8 小分子TKDC具有抗抑郁活性第68-69页
    3.4 讨论第69-71页
        3.4.1 TREK-1 通道的Cap区是潜在的抑制剂结合位点第69-70页
        3.4.2 K2P通道特异性抑制剂的设计思路第70页
        3.4.3 小分子TKDC的作用机制第70-71页
    3.5 本章小结第71-72页
    参考文献第72-76页
第4章 基于TREK-1 通道跨膜区域动态行为的小分子发现第76-98页
    4.1 引言第76-79页
    4.2 研究方法第79-81页
        4.2.1 分子动力学模拟第79页
        4.2.2 虚拟筛选第79-80页
        4.2.3 细胞转染与培养第80页
        4.2.4 电生理实验以及数据分析第80-81页
    4.3 结果与讨论第81-92页
        4.3.1 TREK-1 通道的胞内侧跨膜区域存在多种构象第81-84页
        4.3.2 不同状态TREK-1 通道的跨膜区域内部的相互作用分析第84-88页
        4.3.3 TREK-1 通道跨膜区域可能的抑制剂结合位点分析第88-89页
        4.3.4 基于I1构象抑制剂的筛选第89-90页
        4.3.5 小分子TA007与TREK-1 的结合模型第90-92页
    4.4 本章小结第92-94页
    参考文献第94-98页
总结与展望第98-102页
附录第102-112页
作者简历第112-114页
科研成果第114页

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