| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 第一章 绪论 | 第11-23页 |
| 1.1 新一代高通量测序的研究进展 | 第11-16页 |
| 1.1.1 主要测序平台研究进展 | 第11-15页 |
| 1.1.2 新一代高通量测序技术的应用 | 第15-16页 |
| 1.1.3 新一代高通量测序技术的发展前景 | 第16页 |
| 1.2 游离核酸的研究进展 | 第16-19页 |
| 1.2.1 游离核酸的发现 | 第17页 |
| 1.2.2 游离核酸的研究进展和应用 | 第17-18页 |
| 1.2.3 胎儿游离核酸的研究进展和应用 | 第18-19页 |
| 1.3 宿主-共生物共生代谢发展的研究进展 | 第19-21页 |
| 1.3.1 宿主-共生物共生系统的节律特性 | 第19-20页 |
| 1.3.2 代谢物在共生系统中的调控 | 第20页 |
| 1.3.3 鱿鱼-费氏弧菌共生系统的研究 | 第20-21页 |
| 1.4 本论文的主要内容 | 第21-23页 |
| 1.4.1 高通量测序文库制备方法的优化 | 第21页 |
| 1.4.2 基于高通量测序平台的孕妇血浆miRNA的研究 | 第21-22页 |
| 1.4.3 高通量测序技术在共生系统共生物RNA表达分析中的应用 | 第22页 |
| 1.4.4 鱿鱼-费氏弧菌共生系统的化学对话发展 | 第22页 |
| 1.4.5 壳质对鱿鱼-费氏弧菌共生系统共生菌代谢通路的调控 | 第22-23页 |
| 第二章 高通量测序技术样本制备方法的研究 | 第23-61页 |
| 2.1 引言 | 第23页 |
| 2.2 高通量测序样本制备方法优化 | 第23-44页 |
| 2.2.1 实验材料 | 第24-25页 |
| 2.2.2 高通量测序miRNA文库制备实验方法 | 第25-27页 |
| 2.2.3 高通量测序模板制备实验方法 | 第27-33页 |
| 2.2.4 实验结果 | 第33-44页 |
| 2.3 基于高通量测序平台的孕妇血浆miRNA的研究 | 第44-59页 |
| 2.3.1 背景介绍 | 第44-45页 |
| 2.3.2 实验材料 | 第45-47页 |
| 2.3.3 实验方法 | 第47-49页 |
| 2.3.4 实验结果 | 第49-59页 |
| 2.4 分析与讨论 | 第59-61页 |
| 第三章 高通量测序技术在共生系统共生物RNA表达分析中的应用 | 第61-86页 |
| 3.1 引言 | 第61-63页 |
| 3.2 高通量测序平台的共生物RNA表达的研究 | 第63-65页 |
| 3.2.1 实验材料与方法 | 第64-65页 |
| 3.3 测序结果 | 第65-85页 |
| 3.3.1 RNA检测 | 第65-68页 |
| 3.3.2 数据质控 | 第68-69页 |
| 3.3.3 数据过滤 | 第69-70页 |
| 3.3.4 比对 | 第70页 |
| 3.3.5 比对结果分析 | 第70-71页 |
| 3.3.6 基因表达定量 | 第71-72页 |
| 3.3.7 基因差异表达分析 | 第72-78页 |
| 3.3.8 GO富集性分析 | 第78-81页 |
| 3.3.9 KEGG pathway富集性分析 | 第81-85页 |
| 3.4 分析与讨论 | 第85-86页 |
| 第四章 鱿鱼-费氏弧菌共生系统的化学对话发展 | 第86-112页 |
| 4.1 引言 | 第86-89页 |
| 4.2 鱿鱼-费氏弧菌共生系统的化学节律发展 | 第89-112页 |
| 4.2.1 背景介绍 | 第89页 |
| 4.2.2 实验材料与方法 | 第89-95页 |
| 4.2.3 实验结果 | 第95-110页 |
| 4.2.4 分析与讨论 | 第110-112页 |
| 第五章 壳质对鱿鱼-费氏弧菌共生系统共生菌生理学的调控 | 第112-130页 |
| 5.1 引言 | 第112页 |
| 5.2 壳质对费氏弧菌生理学的调控 | 第112-130页 |
| 5.2.1 背景介绍 | 第112-113页 |
| 5.2.2 实验材料与方法 | 第113-118页 |
| 5.2.3 实验结果 | 第118-128页 |
| 5.2.4 分析与讨论 | 第128-130页 |
| 第六章 总结与展望 | 第130-133页 |
| 6.1 研究总结 | 第130-131页 |
| 6.2 未来展望 | 第131-133页 |
| 参考文献 | 第133-144页 |
| 致谢 | 第144-145页 |
| 攻读博士期间取得的主要成果 | 第145-146页 |
