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淡水枝角类耐受微囊藻胁迫的快速适应及其分子机制

摘要第3-6页
Abstract第6-10页
第1章 绪论第16-42页
    1.1 枝角类的生态学研究进展第16-21页
        1.1.1 枝角类——生态学研究模式生物第16-18页
        1.1.2 枝角类的生态学功能第18-20页
        1.1.3 温度升高对枝角类的影响第20-21页
    1.2 蓝藻水华第21-25页
        1.2.1 富营养化和高温是形成蓝藻水华的必要条件第22-23页
        1.2.2 蓝藻水华基因型组成研究第23页
        1.2.3 水华微囊藻对枝角类的影响第23-25页
    1.3 枝角类的快速适应研究第25-28页
        1.3.1 猎物——反捕食特性第25页
        1.3.2 宿主-寄主共进化第25-26页
        1.3.3 捕食者——对蓝藻的牧食适应第26-28页
    1.4 本论文的研究目的、内容第28-30页
        1.4.1 研究目的第28页
        1.4.2 主要研究内容第28-29页
        1.4.3 研究框架图第29页
        1.4.4 本研究的主要创新点第29-30页
    参考文献第30-42页
第2章 大型溞亲代牧食无毒微囊藻对子代耐受有毒微囊藻胁迫的影响第42-58页
    2.1 引言第42-43页
    2.2 材料与方法第43-48页
        2.2.1 枝角类的培养第43-44页
        2.2.2 藻类的培养第44-45页
        2.2.3 藻毒素合成基因鉴定及藻毒素含量的测定第45-46页
        2.2.4 实验设计第46-47页
        2.2.5 数据分析第47-48页
    2.3 结果第48-50页
        2.3.1 PCR扩增法和HPLC进行产毒能力的定性和定量检测第48-49页
        2.3.2 子代(F_1)生活史特征描述第49-50页
        2.3.3 AH克隆子代(F_1)抗氧化酶活性及个体代谢率描述第50页
    2.4 讨论第50-53页
    2.5 结论第53页
    参考文献第53-58页
第3章 两种个体大小不同的枝角类亲代不同温度经历对子代耐受有毒微囊藻胁迫的影响第58-75页
    3.1 引言第58-59页
    3.2 材料与方法第59-62页
        3.2.1 枝角类的培养第59页
        3.2.2 藻类的培养第59页
        3.2.3 实验设计第59-61页
        3.2.4 数据分析第61-62页
    3.3 结果第62-68页
        3.3.1 温度对亲代(F_0)的影响第62-63页
        3.3.2 亲代的温度影响子代(F_1)对铜绿微囊藻胁迫响应第63-68页
    3.4 讨论第68-70页
    3.5 结论第70页
    参考文献第70-75页
第4章 大型溞精氨酸激酶基因克隆及其在耐受产毒微囊藻胁迫的作用第75-98页
    4.1 引言第75-76页
    4.2 材料与方法第76-85页
        4.2.1 枝角类的培养第76页
        4.2.2 藻类的培养第76页
        4.2.3 实验仪器、试剂第76-77页
        4.2.4 D.magna RNA提取(优化的TRIzol法)第77页
        4.2.5 RNA质量、浓度的确定第77-78页
        4.2.6 cDNA反转录合成第78-79页
        4.2.7 目的基因保守序列的获得第79-80页
        4.2.8 cDNA末端快速扩增技术(RACE)扩增基因全长第80-82页
        4.2.9 序列特性分析第82-83页
        4.2.10 产毒微囊藻对D.magna胁迫的处理第83-84页
        4.2.11 子代D.magna对产毒微囊藻抗性的诱导第84页
        4.2.12 Dm-AK基因表达第84-85页
        4.2.13 ATP含量的测定第85页
        4.2.14 数据分析第85页
    4.3 结果第85-91页
        4.3.1 Dm-AK cDNA序列分析第85页
        4.3.2 Dm-AK氨基酸(AA)序列特性分析第85-86页
        4.3.3 Dm-AK进化树分析第86页
        4.3.4 AK蛋白三级结构比较第86-91页
        4.3.5 产毒铜绿微囊藻诱导的Dm-AK和ATP含量变化第91页
    4.4 讨论第91-93页
    4.5 结论第93页
    参考文献第93-98页
第5章 大型溞delta分型谷胱甘肽转移酶基因克隆及其对微囊藻胁迫的响应第98-120页
    5.1 引言第98-99页
    5.2 材料和方法第99-105页
        5.2.1 枝角类的培养第99页
        5.2.2 藻类的培养第99-100页
        5.2.3 实验仪器、试剂第100页
        5.2.4 D.magna RNA提取(优化的Trizo法)第100页
        5.2.5 RNA质量、浓度的确定第100页
        5.2.6 cDNA反转录合成第100页
        5.2.7 目的基因保守序列的获得第100页
        5.2.8 cDNA末端快速扩增技术(RACE)扩增基因全长第100页
        5.2.9 序列特性分析第100页
        5.2.10 Dm-dGST蛋白原核表达第100-104页
        5.2.11 Dm-dGST蛋白浓度、活性的测定第104页
        5.2.12 Dm-dGST在不同温度、pH、变性剂下的活性分析第104-105页
        5.2.13 不同胁迫下Dm-dGST基因表达检测第105页
        5.2.14 数据分析第105页
    5.3 结果第105-112页
        5.3.1 Dm-dGST全长的扩增第105-106页
        5.3.2 Dm-dGST氨基酸(AA)序列保守功能域分析第106-108页
        5.3.3 Dm-dGST进化树分析第108-109页
        5.3.4 Dm-dGST蛋白三级结构构建第109页
        5.3.5 Dm-dGST蛋白体外原核表达第109-110页
        5.3.6 不同胁迫下Dm-dGST基因表达检测第110-112页
    5.4 讨论第112-114页
    5.5 结论第114-115页
    参考文献第115-120页
第6章 基于iTRAQ技术揭示微囊藻对大型溞蛋白组的影响第120-151页
    6.1 引言第120-121页
    6.2 材料和方法第121-126页
        6.2.1 枝角类的培养第121页
        6.2.2 藻类的培养第121页
        6.2.3 主要器材及设备第121-122页
        6.2.4 主要试剂第122页
        6.2.5 慢性饮食暴露第122页
        6.2.6 大型溞总蛋白的提取第122-123页
        6.2.7 iTRAQ实验第123-124页
        6.2.8 生物信息学分析第124-126页
        6.2.9 数据分析第126页
    6.3 结果第126-144页
        6.3.1 个体生长率(BGR)的变化第126页
        6.3.2 总蛋白浓度测定及电泳检测第126-127页
        6.3.3 蛋白鉴定结果分析第127-144页
    6.4 讨论第144-147页
    6.5 结论第147页
    参考文献第147-151页
第7章 两种克隆系拟同形溞耐受产毒微囊藻的差异及其转录组水平机制第151-174页
    7.1 引言第151-152页
    7.2 材料和方法第152-156页
        7.2.1 枝角类的培养第152页
        7.2.2 藻类的培养第152页
        7.2.3 七天慢性饮食暴露第152-153页
        7.2.4 D.similoides总RNA的提取第153页
        7.2.5 cDNA文库构建和测序第153-154页
        7.2.6 转录组测序原始数据的统计、质控、去杂处理和序列的拼接第154页
        7.2.7 拼接结果的注释第154页
        7.2.8 基因表达量分析第154-155页
        7.2.9 COG分类第155页
        7.2.10 差异表达基因筛选,第155页
        7.2.11 Gene Ontology功能显著性富集分析第155-156页
        7.2.12 Pathway显著性富集分析第156页
        7.2.13 差异表达基因的实时荧光定量PCR(qPCR)验证第156页
    7.3 结果第156-168页
        7.3.1 产毒微囊藻胁迫下Clone LM和Clone LS个体生长率(BGR)第156-157页
        7.3.2 Clone LM和Clone LS对产毒微囊藻胁迫响应的RNA-seq第157-168页
    7.4 讨论第168-170页
    7.5 小结第170-171页
    参考文献第171-174页
第8章 总结与展望第174-177页
在读期间发表的学术论文、资助及奖励第177-179页
致谢第179页

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