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藏绵羊DRB1基因第3外显子多态性及生物信息学分析

摘要第1-5页
Summary第5-8页
第一部分 论文综述第8-15页
 1 MHC 概述第8页
 2 MHC 分子的结构第8-10页
   ·MHCⅠ类分子的结构第8-9页
   ·MHCⅡ类分子的结构第9-10页
   ·MHCⅢ类分子的结构第10页
 3 MHC 的遗传特点第10-11页
   ·单倍型遗传第10页
   ·同源性第10页
   ·共显性遗传第10-11页
   ·连锁不平衡第11页
   ·高度多态性第11页
 4 绵羊的主要组织复合体(OLA)的研究概况第11-13页
   ·绵羊的主要组织相容性复合体(OLA)基因第11页
   ·绵羊的主要组织相容性复合体(OLA)的研究进展第11-13页
 5 生物信息学概况第13页
 6 藏绵羊概况第13-14页
 7 本研究的目的和意义第14-15页
第二部分 藏绵羊DRB1 基因第3 外显子多态性分析第15-33页
 1 实验材料与研究方法第15-18页
   ·实验材料第15页
   ·主要试剂第15页
   ·主要仪器设备第15-16页
   ·分析软件第16页
   ·溶液试剂的配制方法第16-18页
 2 实验操作具体步骤第18-25页
   ·基因组DNA 的提取方法以及检测方法第18-20页
   ·DRB1 基因的PCR 扩增第20-21页
   ·DRB1 基因的SSCP 实验步骤第21-23页
   ·DRB1 基因克隆测序的具体步骤第23-25页
   ·序列分析的使用方法第25页
 3 结果和分析第25-33页
   ·藏绵羊基因组DNA 样品的检测第25-26页
   ·藏绵羊DRB1 基因第3 外显子PCR 扩增产物检测结果第26页
   ·藏绵羊DRB1 基因第3 外显子SSCP 检测结果第26-27页
   ·藏绵羊DRB1 基因第3 外显子克隆、SSCP 检测和测序结果第27-29页
   ·藏绵羊DRB1 基因第3 外显子等位基因数和多态位点分析第29-30页
   ·藏绵羊DRB1 基因第3 外显子等位基因氨基酸序列对比分析第30-31页
   ·藏绵羊DRB1 基因第3 外显子系统发育分析第31-33页
第三部分 绵羊DRB1 基因生物信息学分析第33-41页
 1 材料与方法第33-35页
   ·软件工具第33页
   ·核酸开放阅读框分析第33页
   ·蛋白质氨基酸组成分析第33页
   ·蛋白质疏水性/亲水性预测和分析第33-34页
   ·蛋白质信号肽的分析第34页
   ·亚细胞的定位分析第34页
   ·蛋白质折叠及二级结构预测第34页
   ·蛋白质功能预测与分析第34页
   ·蛋白质序列同源性分析第34-35页
 2 结果与分析第35-41页
   ·OLA-DRB1 基因开放阅读框分析第35页
   ·OLA-DRB1 编码产物的理化性质分析第35-36页
   ·OLA-DRB1 编码产物疏水性/亲水性预测和分析第36-37页
   ·OLA-DRB1 编码产物的信号肽分析第37-38页
   ·OLA-DRB1 编码产物亚细胞定位分析第38页
   ·OLA-DRB1 编码产物的二级结构预测第38-39页
   ·OLA-DRB1 编码产物功能预测与分析第39页
   ·OLA-DRB1 编码产物序列同源性分析第39-41页
第四部分 讨论第41-45页
 1 MHC-DRB1 作为遗传标记技术的可行性第41页
 2 引物设计与PCR 扩增第41-42页
 3 PCR-SSCP 实验技术第42-43页
 4 藏绵羊DRB1 基因多态性第43-44页
 5 OLA-DRB1 基因聚类分析第44页
 6 绵羊DRB1 基因的生物学特性及其功能分析第44-45页
第五部分 结论第45-46页
致谢第46-47页
参考文献第47-52页
作者简介第52-53页
导师简介第53-54页

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