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禽流感病毒H9亚型福建分离株的全基因组测定及遗传演化分析

摘要第1-10页
Abstract第10-12页
第一章 综述第12-23页
 1 禽流感概述第12-13页
 2 禽流感病原特征第13-17页
   ·形态和结构第13页
   ·禽流感病毒的分子生物学特性第13-17页
     ·基因组及其蛋白组成第13-16页
     ·禽流感病毒的分子进化与抗原变异第16-17页
 3 禽流感病毒的致病机制第17-19页
   ·血凝素(HA)与致病性关系第17页
   ·神经氨酸酶(NA)与致病性关系第17-18页
   ·核蛋白(NP)与致病性关系第18页
   ·基质蛋白(M)与致病性关系第18页
   ·非结构蛋白(NS)与致病性关系第18-19页
   ·聚合酶复合体(PB1,PB2,PA)与致病性关系第19页
 4 禽流感疫苗研究第19-22页
   ·灭活全病毒疫苗第19-20页
   ·亚单位疫苗第20页
   ·重组活载体疫苗第20-21页
   ·核酸疫苗第21页
   ·通用疫苗第21页
   ·反向遗传技术在禽流感疫苗研制中的应用第21-22页
   ·新型疫苗第22页
 5 本研究的目的和意义第22-23页
第二章 两株H9 亚型禽流感病毒全基因组的序列分析第23-58页
 1 试验材料第23-24页
   ·材料第23页
   ·主要试剂第23页
   ·主要仪器及材料第23-24页
   ·阿氏液配制第24页
   ·1%鸡红细胞悬液制备第24页
   ·LB 培养基配制第24页
 2 试验方法第24-30页
   ·病毒分离第24页
   ·病毒的血凝(HA)和血凝抑制(HI)试验第24页
   ·引物设计与合成第24-25页
   ·尿囊液病毒RNA 的抽提第25-26页
   ·RT-PCR第26-27页
     ·反转录(RT)(40μL 反应体系)第26页
     ·PCR(50μL 反应体系)第26-27页
   ·PCR 产物电泳鉴定第27页
   ·PCR 产物切胶回收第27-28页
   ·回收产物与pMD18-T vector 的连接第28页
   ·DH5α感受态细胞的制备(采用氯化钙法)第28页
   ·连接产物的转化第28-29页
   ·重组质粒的提取第29页
   ·重组质粒的PCR 鉴定(50μl 反应体系)第29页
   ·目的基因的核苷酸序列测定、拼接及分析第29-30页
 3 结果与分析第30-54页
   ·病毒分离结果第30页
   ·H9 亚型AIV 全基因组片段扩增结果第30页
   ·重组质粒PCR 鉴定结果第30-31页
   ·HA 基因序列测定与遗传进化分析第31-33页
     ·HA 基因的核苷酸和氨基酸序列测定第31页
     ·HA 基因的序列分析第31-32页
     ·HA 基因序列同源性分析第32-33页
     ·HA 基因序列遗传进化树分析第33页
   ·NA 基因序列测定与遗传进树分析第33-35页
     ·NA 基因的核苷酸和氨基酸序列测定第33-34页
     ·NA 基因的序列分析第34页
     ·NA 基因序列同源性分析第34-35页
     ·NA 基因序列遗传进化树分析第35页
   ·M 基因序列测定与遗传进树分析第35-36页
     ·M 基因的核苷酸和氨基酸序列测定第35页
     ·M 基因的序列分析第35-36页
     ·M 基因序列同源性分析第36页
     ·M 基因序列遗传进化树分析第36页
   ·NS 基因序列测定与遗传进树分析第36-37页
     ·NS 基因的核苷酸和氨基酸序列测定第36页
     ·NS 基因序列同源性分析第36-37页
     ·NS 基因序列遗传进化树分析第37页
   ·NP 基因序列测定与遗传进树分析第37-38页
     ·NP 基因的核苷酸和氨基酸序列测定第37页
     ·NP 基因序列同源性分析第37页
     ·NP 基因序列遗传进化树分析第37-38页
   ·PB1 基因序列测定与遗传进树分析第38页
     ·PB1 基因的核苷酸和氨基酸序列测定第38页
     ·PB1 基因序列同源性分析第38页
     ·PB1 基因序列遗传进化树分析第38页
   ·PB2 基因序列测定与遗传进树分析第38-39页
     ·PB2 基因的核苷酸和氨基酸序列测定第38页
     ·PB2 基因序列同源性分析第38-39页
     ·PB2 基因序列遗传进化树分析第39页
   ·PA 基因序列测定与遗传进树分析第39-54页
     ·PA 基因的核苷酸和氨基酸序列测定第39页
     ·PA 基因序列同源性分析第39页
     ·PA 基因序列遗传进化树分析第39-54页
 4 讨论第54-57页
   ·HA 基因氨基酸序列分析讨论第54-55页
   ·NA 基因氨基酸序列分析讨论第55页
   ·8 个基因的同源性和遗传演化分析讨论第55-57页
 5 小结第57-58页
结论第58-59页
参考文献第59-65页
附录第65-79页
致谢第79页

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