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实时荧光定量PCR技术用于土壤中烟草青枯病菌的定量检测及动态分析

中文摘要第7-9页
Abstract第9-10页
1 前言第11-15页
    1.1 烟草青枯病菌的发生状况第11-13页
        1.1.1 烟草青枯病的病原第11页
        1.1.2 烟草青枯病的浸染循环第11-12页
        1.1.3 烟草青枯病的发生第12页
        1.1.4 烟草青枯病的防治第12-13页
    1.2 烟草青枯病的检测方法第13-14页
        1.2.1 指示植物检测方法第13页
        1.2.2 平板涂布分离法第13-14页
    1.3 实时荧光定量PCR技术第14页
        1.3.1 实时荧光定量PCR技术原理第14页
        1.3.2 实时荧光定量PCR技术在病原体检测中应用第14页
    1.4 本研究的目的意义第14-15页
2 材料与方法第15-22页
    2.1 烟草植株根际微生物的分离和筛选第15-16页
        2.1.1 土样的采集第15页
        2.1.2 土壤微生物的分离和纯化第15-16页
    2.2 烟草青枯病菌荧光定量PCR检测体系的建立和优化第16-19页
        2.2.0 供试菌株第16页
        2.2.1 烟草青枯病菌荧光定量PCR检测引物的设计和合成第16-17页
        2.2.2 青枯病菌DNA的提取方法(CTAB/Na Cl法)第17-18页
        2.2.3 烟草青枯病菌荧光定量PCR检测引物的特异性验证第18页
        2.2.4 烟草青枯病菌荧光定量PCR检测体系的建立及优化第18-19页
        2.2.5 引物灵敏度检测和标准曲线的绘制第19页
    2.3 土壤样品的采集与处理第19-22页
        2.3.1 样品的采集第19-20页
        2.3.2 土样和烟草样本总DNA的提取第20-21页
        2.3.3 病害的调查第21页
        2.3.4 样品中青枯病菌的检测第21页
        2.3.5 气象资料的收集第21-22页
3 结果与分析第22-46页
    3.1 烟草植株根际青枯菌的分离和筛选第22页
    3.2 引物特异性检测第22-30页
        3.2.1 常规PCR技术检测引物特异性第22-24页
        3.2.2 实时荧光定量技术检测引物特异性第24-25页
        3.2.3 优化的real-time PCR反应条件第25-26页
        3.2.4 引物灵敏度检测第26-27页
        3.2.5 标准曲线绘制第27-28页
        3.2.6 普通PCR和Real-time PCR结果对比第28-30页
    3.3 烟草青枯病的危害以及气象因子调查第30-37页
    3.4 土壤中烟草青枯病菌的Real-time PCR检测结果第37-43页
    3.5 烟草青枯病的危害度与土壤中病原菌的种群数量及气象因子的关系分析第43-46页
        3.5.1 气象条件与菌量、病情指数规律第43-44页
        3.5.2 数据的正态分布检验及Boxcox转换第44-45页
        3.5.3 土壤中的青枯病菌数量与气象因子的关系第45-46页
4 讨论第46-48页
    4.1 土壤中DNA提取第46页
    4.2 实时荧光定量PCR技术的选择与优化第46-47页
    4.3 土壤中烟草青枯病菌的检测和动态分析第47页
    4.4 其他环境因素的影响第47-48页
5 结论第48-49页
参考文献第49-51页
致谢第51页

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