| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第11-20页 |
| 1 研究背景 | 第11-13页 |
| 1.1 绿肥应用研究概述 | 第11-12页 |
| 1.2 烟草主要土传病害与其生物防治的重要性 | 第12-13页 |
| 2 国内外研究进展 | 第13-17页 |
| 2.1 土壤微生物多样性研究现状 | 第13-15页 |
| 2.1.1 自然因素 | 第14页 |
| 2.1.2 人为因素 | 第14-15页 |
| 2.2 土壤微生物多样性研究方法的发展 | 第15-16页 |
| 2.3 Miseq高通量测序技术在土壤微生物多样性研究中的应用 | 第16-17页 |
| 3 研究意义和内容 | 第17-19页 |
| 3.1 研究意义 | 第17-18页 |
| 3.2 研究内容 | 第18-19页 |
| 4 技术路线 | 第19-20页 |
| 第二章 绿肥-烟草轮作对烟田土壤性质的影响 | 第20-26页 |
| 1 材料与仪器 | 第20-21页 |
| 1.1 试验材料 | 第20-21页 |
| 1.1.1 土壤样品 | 第20页 |
| 1.1.2 试验试剂 | 第20页 |
| 1.1.3 试验仪器 | 第20-21页 |
| 2 试验方法 | 第21-23页 |
| 2.1 土壤样品的采集和青枯病发病率调查 | 第21页 |
| 2.2 土壤样品理化性质的测定 | 第21-22页 |
| 2.2.1 供试土壤含水量的测定 | 第21页 |
| 2.2.2 供试土壤pH值的测定 | 第21页 |
| 2.2.3 供试土壤的全元素分析 | 第21页 |
| 2.2.4 土壤样品总N含量的测定 | 第21-22页 |
| 2.2.5 土壤样品总C含量的测定 | 第22页 |
| 2.3 数据分析 | 第22-23页 |
| 3 结果与分析 | 第23-24页 |
| 3.1 绿肥-烟草轮作对烟田土壤理化性质的影响 | 第23-24页 |
| 3.1.1 绿肥-烟草轮作对烟田土壤PH和含水量的影响 | 第23页 |
| 3.1.2 绿肥-烟草轮作对土壤元素含量的影响 | 第23页 |
| 3.1.3 绿肥-烟草轮作对土壤总碳和总氮的影响 | 第23-24页 |
| 4 讨论 | 第24-26页 |
| 第三章 土壤样品的16S rRNA高通量测序 | 第26-35页 |
| 1 材料与仪器 | 第26页 |
| 1.1 试验材料 | 第26页 |
| 1.1.1 土壤样品 | 第26页 |
| 1.1.2 试验试剂 | 第26页 |
| 1.2 试验仪器 | 第26页 |
| 2 试验方法 | 第26-30页 |
| 2.1 DNA提取液的配制 | 第26-27页 |
| 2.2 土壤微生物总DNA提取和纯化 | 第27-28页 |
| 2.3 土壤总DNA的16S rRNA扩增 | 第28-29页 |
| 2.3.1 土壤总DNA的检测和定量 | 第28页 |
| 2.3.2 土壤总DNA 16S rRNA的PCR扩增 | 第28页 |
| 2.3.3 PCR产物琼脂糖凝胶电泳检测 | 第28-29页 |
| 2.4 Illumina Miseq高通量测序 | 第29-30页 |
| 2.4.1 PCR产物定量和混样 | 第29页 |
| 2.4.2 琼脂糖凝胶DNA回收 | 第29-30页 |
| 2.4.3 细菌总DNA文库构建和上机测序 | 第30页 |
| 2.4.4 测序有效序列筛选及优化 | 第30页 |
| 3 结果分析 | 第30-34页 |
| 3.1 样品DNA检测 | 第30-31页 |
| 3.2 PCR扩增产物的琼脂糖凝胶电泳检测 | 第31-32页 |
| 3.3 PCR扩增产物的酶标仪检测 | 第32-33页 |
| 3.4 Miseq高通量测序结果 | 第33-34页 |
| 4 讨论 | 第34-35页 |
| 第四章 绿肥-烟草轮作下土壤细菌多样性、土壤性质和烟草青枯病发病率的联系 | 第35-49页 |
| 1 材料与仪器 | 第35页 |
| 2 试验方法 | 第35-37页 |
| 2.1 分类学分析 | 第35页 |
| 2.2 OTU聚类统计 | 第35页 |
| 2.3 稀释曲线构建 | 第35-36页 |
| 2.4 群落结构和组成差异分析 | 第36页 |
| 2.4.1 群落结构差异分析 | 第36页 |
| 2.4.2 群落组成差异分析 | 第36页 |
| 2.5 Alpha多样性分析 | 第36页 |
| 2.6 mantel test相关性分析 | 第36-37页 |
| 2.7 皮尔森系数相关性分析 | 第37页 |
| 2.8 PLSPM相关性分析 | 第37页 |
| 3 结果分析 | 第37-46页 |
| 3.1 OTU聚类和稀释曲线 | 第37-38页 |
| 3.2 绿肥-烟草轮作对烟田土壤细菌群落结构的影响 | 第38-40页 |
| 3.2.1 烟田土壤细菌群落结构的统计分析 | 第38-39页 |
| 3.2.2 烟田土壤细菌群落结构的不相似性分析 | 第39页 |
| 3.2.3 烟田土壤细菌群落结构的去趋势对应分析 | 第39-40页 |
| 3.3 绿肥-烟草轮作对烟田土壤细菌群落组成的影响 | 第40-42页 |
| 3.3.1 绿肥-烟草轮作烟田土壤细菌群落组成在门和属水平上的差异 | 第40-42页 |
| 3.4 绿肥-烟草轮作对土壤细菌多样性的影响 | 第42页 |
| 3.5 土壤性质和烟田土壤细菌之间的Mantel test相关性分析 | 第42-43页 |
| 3.6 土壤性质、烟草发病率和烟田土壤细菌之间的皮尔森相关性分析 | 第43-45页 |
| 3.7 土壤性质、烟草发病率和烟田土壤菌群之间的PLSPM分析 | 第45-46页 |
| 4 讨论 | 第46-49页 |
| 第五章 结论与展望 | 第49-51页 |
| 1 结论 | 第49页 |
| 2 展望 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
| 作者简介 | 第59页 |
