蛋白质网络中的功能模块挖掘算法与关键蛋白识别方法研究
| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 第1章 绪论 | 第9-17页 |
| 1.1 论文的研究背景与意义 | 第9-10页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第10-16页 |
| 1.2.1 概述 | 第10-11页 |
| 1.2.2 基于无权网络拓扑结构的方法 | 第11-13页 |
| 1.2.3 基于加权网络特征的方法 | 第13-14页 |
| 1.2.4 基于多数据融合的方法 | 第14-15页 |
| 1.2.5 基于动态网络的方法 | 第15-16页 |
| 1.3 论文的研究内容 | 第16页 |
| 1.4 论文的组织结构 | 第16-17页 |
| 第2章 研究基础 | 第17-27页 |
| 2.1 本章概述 | 第17页 |
| 2.2 图 | 第17-18页 |
| 2.2.1 无向图 | 第17页 |
| 2.2.2 无权图 | 第17-18页 |
| 2.2.3 有权图 | 第18页 |
| 2.3 马尔可夫链 | 第18-19页 |
| 2.4 群智能优化算法 | 第19-25页 |
| 2.4.1 烟花算法 | 第19-22页 |
| 2.4.2 萤火虫优化算法 | 第22页 |
| 2.4.3 粒子群优化算法 | 第22-24页 |
| 2.4.4 人工鱼群算法 | 第24-25页 |
| 2.5 本章小结 | 第25-27页 |
| 第3章 动态蛋白质相互作用网络 | 第27-31页 |
| 3.1 多数据融合 | 第27页 |
| 3.2 蛋白质的活跃时间点 | 第27-28页 |
| 3.3 构建动态网络模型 | 第28-29页 |
| 3.4 蛋白质相互作用数据和基因表达数据 | 第29-30页 |
| 3.5 本章小结 | 第30-31页 |
| 第4章 烟花算法用于蛋白质功能模块挖掘 | 第31-37页 |
| 4.1 烟花算法 | 第31页 |
| 4.2 烟花算法直接用于蛋白质功能模块挖掘 | 第31页 |
| 4.3 烟花算法结合MCL用于蛋白质功能模块挖掘 | 第31-34页 |
| 4.3.1 MCL以及它的改进方法 | 第32-33页 |
| 4.3.2 烟花算法结合MCL | 第33-34页 |
| 4.4 实验结果与分析 | 第34-36页 |
| 4.4.1 性能度量准则 | 第34-35页 |
| 4.4.2 实验结果对比与分析 | 第35-36页 |
| 4.5 本章小结 | 第36-37页 |
| 第5章 萤火虫优化算法用于蛋白质功能模块挖掘 | 第37-45页 |
| 5.1 概述 | 第37页 |
| 5.2 萤火虫蛋白质功能模块挖掘算法 | 第37-38页 |
| 5.3 实验结果及分析 | 第38-44页 |
| 5.4 本章小结 | 第44-45页 |
| 第6章 蛋白质功能模块中的关键蛋白识别 | 第45-53页 |
| 6.1 概述 | 第45-46页 |
| 6.2 数据来源与度量方法 | 第46-48页 |
| 6.2.1 实验数据 | 第46页 |
| 6.2.2 度量方法 | 第46-48页 |
| 6.3 实验方法 | 第48-51页 |
| 6.4 本章小结 | 第51-53页 |
| 第7章 结束语 | 第53-55页 |
| 7.1 研究工作总结 | 第53-54页 |
| 7.2 研究展望 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-63页 |
| 致谢 | 第63-65页 |
| 攻读硕士学位期间的研究成果 | 第65-66页 |
