大黄鱼清道夫受体家族基因鉴定及表达分析
| 摘要 | 第1-11页 |
| ABSTRACT | 第11-18页 |
| 第一章 文献综述 | 第18-27页 |
| ·大黄鱼常见病原微生物 | 第18-19页 |
| ·鱼类主要免疫器官与免疫细胞 | 第19页 |
| ·先天性免疫模式识别受体 | 第19-23页 |
| ·可溶性桥接型模式识别受体 | 第20-21页 |
| ·内吞型模式识别受体 | 第21-22页 |
| ·信号传导型模式识别受体 | 第22-23页 |
| ·以巨噬细胞为主的先天免疫系统 | 第23页 |
| ·清道夫受体家族的发展历程及分类 | 第23-24页 |
| ·清道夫受体家族的发现 | 第23-24页 |
| ·家族成员分类 | 第24页 |
| ·清道夫受体家族的免疫特性 | 第24-25页 |
| ·本文所做工作及研究内容 | 第25-27页 |
| 第二章 大黄鱼清道夫受体家族密码子偏好性分析 | 第27-39页 |
| ·材料与方法 | 第27-30页 |
| ·基因组来源 | 第27页 |
| ·相关软件及计算公式 | 第27-30页 |
| ·结果与讨论 | 第30-37页 |
| ·常规参数 | 第30-31页 |
| ·偏好性指数 | 第31-35页 |
| ·基于RSCU值的偏好性分析 | 第35-36页 |
| ·对应性分析 | 第36-37页 |
| ·本章小结 | 第37-39页 |
| 第三章 大黄鱼清道夫受体家族系统演化分析 | 第39-52页 |
| ·材料与方法 | 第39-44页 |
| ·主要仪器 | 第39-40页 |
| ·实验材料预处理 | 第40页 |
| ·总RNA抽提与cDNA第一链合成 | 第40-41页 |
| ·大黄鱼清道夫受体家族基因扩增与纯化 | 第41-43页 |
| ·T-A克隆与测序 | 第43-44页 |
| ·序列分析 | 第44页 |
| ·结果与讨论 | 第44-51页 |
| ·重测序验证 | 第44页 |
| ·同源性分析 | 第44-46页 |
| ·系统进化发育分析 | 第46-48页 |
| ·基因线性结构分析 | 第48-49页 |
| ·外显子与内含子结构分析 | 第49-50页 |
| ·蛋白质三维结构分析 | 第50-51页 |
| ·本章小结 | 第51-52页 |
| 第四章 大黄鱼清道夫受体家族的表达调控分析 | 第52-61页 |
| ·材料与方法 | 第52-54页 |
| ·实验动物处理与样品收集 | 第52页 |
| ·总RNA抽提与cDNA第一链合成 | 第52页 |
| ·组织特异性分布表达 | 第52-53页 |
| ·受溶藻弧菌感染后的基因时空表达 | 第53页 |
| ·数据分析 | 第53-54页 |
| ·亚细胞定位预测 | 第54页 |
| ·结果与讨论 | 第54-60页 |
| ·8 种组织的总RNA特征 | 第54页 |
| ·清道夫受体的组织特异性分布 | 第54-56页 |
| ·受溶藻弧菌感染后清道夫受体的时空表达 | 第56-57页 |
| ·亚细胞结构定位 | 第57-60页 |
| ·本章小结 | 第60-61页 |
| 第五章 大黄鱼清道夫受体A家族鉴定和表达分析 | 第61-79页 |
| ·材料与方法 | 第61-65页 |
| ·样品收集与总RNA抽提 | 第61页 |
| ·cDNA第一链合成与基因克隆 | 第61页 |
| ·序列分析 | 第61-62页 |
| ·受溶藻弧菌感染后清道夫受体A家族基因的表达模式 | 第62页 |
| ·清道夫A家族MARCO基因胞内段克隆 | 第62-63页 |
| ·双酶切与原核表达重组载体构建 | 第63-64页 |
| ·诱导表达与SDS-PAGE电泳分析 | 第64-65页 |
| ·结果与讨论 | 第65-77页 |
| ·大黄鱼清道夫受体A家族基因序列分析 | 第65-68页 |
| ·氨基酸比对分析 | 第68-71页 |
| ·主要结构域分析 | 第71页 |
| ·系统进化分析 | 第71-72页 |
| ·基因结构分析 | 第72-74页 |
| ·mRNA表达分析 | 第74页 |
| ·原核表达分析 | 第74-76页 |
| ·讨论 | 第76-77页 |
| ·本章小结 | 第77-79页 |
| 第六章 大黄鱼清道夫受体F家族的鉴定和表达分析 | 第79-94页 |
| ·材料与方法 | 第79-80页 |
| ·样品收集与总RNA抽提 | 第79页 |
| ·cDNA第一链合成与基因克隆 | 第79页 |
| ·序列分析 | 第79-80页 |
| ·受溶藻弧菌感染后清道夫受体F家族基因的表达模式 | 第80页 |
| ·结果与讨论 | 第80-92页 |
| ·大黄鱼清道夫受体F家族基因序列分析 | 第80-82页 |
| ·氨基酸比对分析 | 第82-84页 |
| ·主要结构域分析 | 第84-86页 |
| ·系统进化分析 | 第86-87页 |
| ·基因结构分析 | 第87-88页 |
| ·基因线性结构分析 | 第88-90页 |
| ·mRNA表达分析 | 第90-91页 |
| ·讨论 | 第91-92页 |
| ·本章小结 | 第92-94页 |
| 参考文献 | 第94-105页 |
| 致谢 | 第105-106页 |
| 在读期间发表的学术论文及研究成果 | 第106-107页 |
