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基于混合模型的肿瘤组学数据聚类研究

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-13页
引言第13-17页
第一章 模型聚类简介第17-35页
   ·混合模型第17-18页
   ·高斯混合模型参数估计与聚类第18-24页
   ·模型选择第24页
   ·高斯混合模型在高维数据聚类中的困难第24-25页
   ·基于惩罚降维的高斯混合模型第25-31页
   ·基于特征提取的高斯混合模型第31-35页
第二章 惩罚混合共因子分析模型聚类第35-57页
   ·混合共因子分析模型第35-36页
   ·惩罚混合共因子分析模型第36-37页
   ·惩罚混合共因子分析模型参数估计与聚类第37-45页
   ·数据模拟试验第45-50页
   ·PMCFA在小圆蓝细胞瘤基因表达数据中的应用第50-54页
   ·PMCFA在宫颈癌miRNA表达数据中的应用第54-57页
第三章 实验材料和方法第57-66页
   ·宫颈癌新鲜组织标本的收集第57页
   ·细胞培养第57-58页
   ·荧光实时定量PCR(q RT-PCR)第58-59页
   ·原位杂交第59页
   ·蛋白质免疫印迹(Western blot)第59-60页
   ·免疫组织化学(immunohistochemistry)第60-61页
   ·稳定细胞系的建立第61-62页
   ·体外细胞功能实验第62-64页
   ·裸鼠皮下成瘤实验第64页
   ·在体裸鼠肺转移实验第64页
   ·双荧光素酶报告基因分析第64-65页
   ·实验统计学方法第65-66页
第四章 实验结果与分析第66-74页
   ·hsa-miR1405p的表达分析第66-68页
   ·hsa-miR1405p过表达对宫颈癌细胞增殖、侵袭的影响第68-70页
   ·hsa-mi R1405p过表达抑制宫颈癌细胞系体内成瘤与转移第70-72页
   ·预测并验证hsa-miR1405p的靶基因第72-74页
第五章 多形性胶质母细胞瘤预后分子标签第74-89页
   ·数据获取与预处理第74-75页
   ·临床和人口学指标与GBM生存的关联第75-80页
   ·GBM的RNA预后表达标签的鉴定第80-85页
   ·GBM分子预后标签的功能注释和通路分析第85-87页
   ·不同分子标签预后能力的比较第87-89页
第六章 总结与展望第89-91页
参考文献第91-104页
攻读博士学位期间的主要成果第104-105页
致谢第105-106页

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