| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-19页 |
| ·前言 | 第11-12页 |
| ·肝硬化-肝癌发展机制研究进展 | 第12-14页 |
| ·硬化的细胞外基质（ECM）促进癌细胞的发展 | 第12页 |
| ·细胞因子与整合蛋白介导癌症发生 | 第12-13页 |
| ·NK细胞介导的致癌 | 第13-14页 |
| ·表观遗传学的调控 | 第14页 |
| ·生物分子网络构建与分析 | 第14-16页 |
| ·系统生物学的产生与发展 | 第14-15页 |
| ·网络的数据和类型 | 第15-16页 |
| ·网络结构和分析 | 第16页 |
| ·中药系统药理学研究进展 | 第16-19页 |
| 第二章 基于调控网络探究丙肝肝硬化发展为肝癌的分子机制 | 第19-40页 |
| ·研究目的 | 第19页 |
| ·材料与方法 | 第19-22页 |
| ·芯片数据的获取与预处理 | 第19-20页 |
| ·芯片数据的差异分析 | 第20-21页 |
| ·芯片数据的聚类分析 | 第21页 |
| ·差异共表达分析 | 第21页 |
| ·疾病相关调控关系的确定 | 第21页 |
| ·调控网络的构建 | 第21-22页 |
| ·GO富集与通路富集分析 | 第22页 |
| ·结果与讨论 | 第22-38页 |
| ·肝硬化-肝癌基因差异表达分析 | 第22-25页 |
| ·肝硬化-肝癌miRNA的差异表达分析 | 第25-27页 |
| ·肝硬化-肝癌基因甲基化水平的差异分析 | 第27-29页 |
| ·肝硬化与肝癌差异共表达网络的构建与分析 | 第29-30页 |
| ·调控网络的构建与分析 | 第30-34页 |
| ·GO富集与通路富集分析 | 第34-38页 |
| ·本章小结 | 第38-40页 |
| 第三章 基于系统药理学分析护肝片的作用机制 | 第40-54页 |
| ·研究目的 | 第40页 |
| ·材料与方法 | 第40-41页 |
| ·护肝片的主要成分 | 第40页 |
| ·活性化合物的筛选 | 第40-41页 |
| ·化合物靶点的预测 | 第41页 |
| ·蛋白质-蛋白质相互作用网络的构建 | 第41页 |
| ·GO富集与通路富集分析 | 第41页 |
| ·结果与讨论 | 第41-53页 |
| ·活性化合物的筛选 | 第41-43页 |
| ·护肝片的预测靶点与化合物-靶点相互作用网络 | 第43-45页 |
| ·靶点PPI网络的构建与分析 | 第45-46页 |
| ·GO富集与通路富集分析 | 第46-49页 |
| ·网络的比较分析 | 第49-53页 |
| ·本章小结 | 第53-54页 |
| 第四章 结论和展望 | 第54-56页 |
| ·结论 | 第54-55页 |
| ·创新点 | 第55页 |
| ·展望 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-64页 |
| 附录 | 第64-77页 |
| 致谢 | 第77-78页 |
| 作者简介 | 第78页 |