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草鱼RLRs家族基因的甲基化状态与草鱼出血病的关联研究

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-12页
第一章 文献综述第12-20页
   ·草鱼出血病概述第12-14页
     ·草鱼呼肠孤病毒第12-13页
     ·草鱼出血病的防治策略第13-14页
   ·先天性免疫模式识别受体第14-18页
     ·鱼类先天性免疫第14页
     ·模式识别受体第14-18页
   ·DNA甲基化第18-19页
     ·表观遗传学第18页
     ·DNA甲基化的调控机制第18-19页
     ·DNA甲基化在鱼类的研究进展第19页
   ·研究目的与意义第19-20页
第二章 草鱼LGP2基因的甲基化状态与草鱼出血病的关联分析第20-31页
   ·前言第20页
   ·材料与方法第20-23页
     ·试验材料第20-21页
     ·试验试剂和仪器第21页
     ·攻毒试验第21页
     ·基因组DNA的提取和亚硫酸氢盐修饰第21页
     ·CiLGP2基因CpG岛预测第21-22页
     ·BSP扩增第22-23页
     ·总RNA提取与cDNA合成第23页
     ·实时荧光定量PCR检测基因表达第23页
     ·数据统计第23页
   ·结果与分析第23-29页
     ·易感与抗性个体鉴定第23-24页
     ·CiLGP2基因CpG岛预测结果第24-25页
     ·CpG位点甲基化状态以及与易感/抗性性状的关联分析第25-27页
     ·-1411 CpG位点的甲基化状态与CiLGP2表达量的关联分析第27-28页
     ·-1411 CpG位点转录因子预测第28-29页
   ·讨论第29页
   ·小结第29-31页
第三章 草鱼MDA5基因的甲基化状态与草鱼出血病的关联分析第31-40页
   ·前言第31页
   ·材料与方法第31-33页
     ·试验材料第31页
     ·试验试剂和仪器第31页
     ·攻毒试验第31页
     ·基因组DNA的提取和亚硫酸氢盐修饰第31页
     ·CiMDA5基因CpG岛预测第31页
     ·BSP扩增第31-32页
     ·总RNA提取、cDNA合成与病毒检测第32页
     ·实时荧光定量PCR检测基因表达第32页
     ·数据统计第32页
     ·生物信息分析第32-33页
   ·结果与分析第33-38页
     ·易感与抗性个体鉴定第33页
     ·CiMDA5基因CpG岛预测结果第33-34页
     ·CiMDA5中与抗性相关的甲基化位点第34-36页
     ·CpA/CpG位点甲基化水平与基因表达的关联分析第36页
     ·DME转录因子和蛋白结构域预测第36-38页
   ·讨论第38-39页
   ·小结第39-40页
第四章 草鱼RIG-I基因的甲基化状态与草鱼出血病的关联分析第40-48页
   ·前言第40页
   ·材料与方法第40-42页
     ·试验材料第40页
     ·试验试剂和仪器第40页
     ·攻毒试验第40页
     ·基因组DNA的提取和亚硫酸氢盐修饰第40页
     ·CiRIG-I基因CpG岛预测第40页
     ·BSP扩增第40-41页
     ·总RNA提取、cDNA合成与病毒检测第41页
     ·实时荧光定量PCR检测基因表达第41页
     ·数据统计第41-42页
   ·结果与分析第42-46页
     ·易感与抗性个体鉴定第42页
     ·CiRIG-I基因CpG岛预测结果第42页
     ·CiRIG-I基因中与抗性相关的甲基化位点第42-45页
     ·CiRIG-I基因表达与甲基化的关联分析第45页
     ·-534与-293 CpG位点转录因子预测第45-46页
   ·讨论第46-47页
   ·小结第47-48页
结论第48-49页
参考文献第49-55页
附录第55-59页
缩略词第59-61页
致谢第61-62页
作者简介第62页

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