| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-12页 |
| 第1章 绪论 | 第12-22页 |
| ·河流污染概况 | 第12-15页 |
| ·海河流域污染现状 | 第13-15页 |
| ·污染河流的微生物群落多样性研究 | 第15-20页 |
| ·PCR-DGGE研究微生物群落多样性 | 第17-19页 |
| ·高通量测序技术研究微生物群落多样性 | 第19-20页 |
| ·本论文立题依据和研究内容 | 第20-22页 |
| 第2章 研究方法 | 第22-33页 |
| ·研究区域概况 | 第22-23页 |
| ·样点设置 | 第23-24页 |
| ·样品的采集和处理 | 第24-25页 |
| ·水体理化因子的测定 | 第25页 |
| ·PCR-DGGE实验方法 | 第25-30页 |
| ·主要实验仪器和试剂 | 第25-26页 |
| ·样品DNA的提取 | 第26页 |
| ·基因组DNA的扩增 | 第26-27页 |
| ·样品PCR产物的变性梯度凝胶电泳（DGGE）分析 | 第27页 |
| ·DGGE图谱分析 | 第27-28页 |
| ·DGGE条带的回收和重新扩增 | 第28页 |
| ·DGGE回收条带的克隆和转化 | 第28-29页 |
| ·DGGE回收条带序列测定和同源性比较 | 第29-30页 |
| ·水样样品DGGE图谱与环境因子关系分析 | 第30页 |
| ·高通量测序 | 第30-33页 |
| ·样品的处理及送测 | 第30页 |
| ·高通量测序方法 | 第30-31页 |
| ·数据处理及分类信息学和群落结构分析 | 第31-33页 |
| 第3章 PCR-DGGE方法研究汪洋沟细菌群落多样性 | 第33-64页 |
| ·PCR-DGGE方法研究汪洋沟水体细菌群落多样性 | 第33-51页 |
| ·汪洋沟水体环境因子变化特征 | 第33-36页 |
| ·汪洋沟水样细菌总DNA的提取和PCR扩增 | 第36-37页 |
| ·汪洋沟水中细菌PCR产物DGGE分析结果 | 第37-41页 |
| ·汪洋沟水中细菌的克隆与测序 | 第41-45页 |
| ·水体细菌群落的时空变化特征及与环境因子的关系 | 第45-47页 |
| ·讨论 | 第47-51页 |
| ·PCR-DGGE方法研究汪洋沟沉积物细菌群落多样性 | 第51-64页 |
| ·汪洋沟沉积物样品细菌总DNA的提取和PCR扩增 | 第51-52页 |
| ·汪洋沟沉积物中细菌PCR产物DGGE分析结果 | 第52-56页 |
| ·汪洋沟沉积物中细菌的克隆与测序 | 第56-59页 |
| ·讨论 | 第59-64页 |
| 第4章 高通量测序方法研究汪洋沟细菌群落多样性 | 第64-86页 |
| ·高通量测序方法研究汪洋沟水体细菌群落多样性 | 第64-76页 |
| ·水样品细菌群落丰富度及多样性 | 第64-67页 |
| ·细菌群落组成与结构 | 第67-71页 |
| ·水体细菌群落的时空变化特征及与环境因子的关系 | 第71-73页 |
| ·讨论 | 第73-76页 |
| ·高通量测序方法研究汪洋沟沉积物中细菌群落多样性 | 第76-86页 |
| ·沉积物样品细菌群落丰富度及多样性 | 第76-78页 |
| ·细菌群落组成与结构 | 第78-83页 |
| ·讨论 | 第83-86页 |
| 结论 | 第86-87页 |
| 参考文献 | 第87-98页 |
| 致谢 | 第98-99页 |
| 攻读学位期间取得的科研成果 | 第99页 |
