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基于piggyBac基因抓捕体系的重编程相关基因的高通量筛选

摘要第1-5页
Abstract第5-9页
缩略词第9-10页
技术路线图第10-11页
第一章 引言第11-33页
   ·干细胞与重编程研究第11-25页
     ·干细胞概念和分类第11-12页
     ·干细胞研究历史第12-13页
     ·干细胞机理研究第13-16页
     ·干细胞多能性差异第16页
     ·重编程方法研究第16-18页
     ·诱导多能干细胞研究第18-24页
     ·诱导多能干细胞分化及应用第24-25页
   ·piggyBac转座子第25-29页
     ·转座子的概念及分类第25-26页
     ·piggyBac转座子第26-28页
     ·piggyBac在哺乳动物中的应用第28页
     ·piggyBac转座子在干细胞研究中的应用第28-29页
   ·基因抓捕第29-31页
     ·基因抓捕的概念第29页
     ·基因抓捕的应用第29-31页
   ·正向遗传学第31-32页
     ·正向遗传学和反向遗传学概念第31页
     ·正向遗传学应用第31-32页
   ·研究目的和意义第32-33页
第二章 材料和方法第33-59页
   ·实验材料第33-37页
     ·实验动物第33页
     ·细胞系与菌株第33页
     ·实验试剂第33页
     ·分子实验试剂的配制第33-34页
     ·细胞培养相关试剂第34-35页
     ·细胞培养基的配置第35-36页
     ·实验所用试剂盒第36页
     ·引物第36页
     ·主要仪器设备及耗材第36-37页
     ·分析软件和网址第37页
   ·实验方法第37-59页
     ·感受态细胞的制备及效价的测定第37-38页
     ·质粒DNA的制备第38-39页
     ·细胞基因组DNA的提取第39页
     ·胚胎成纤维细胞系的建立第39-40页
     ·饲养层细胞的制备第40-41页
     ·胚胎成纤维细胞的培养第41-42页
     ·小鼠多能性干细胞的培养第42-43页
     ·人多能性干细胞的培养第43-44页
     ·多能性干细胞碱性磷酸酶检测第44页
     ·反向PCR第44-46页
     ·二代测序Ion torrent第46-58页
     ·选热测序运行程序第58-59页
第三章 结果与分析第59-89页
   ·piggBac多能基因筛选体系确定第59-65页
     ·载体构建第59-60页
     ·利用抓捕载体pFindl结合KSM筛选重编程相关基因第60-61页
     ·利用抓捕载体pFindl结合OKS筛选重编程相关基因第61-63页
     ·OKS+pFindl单克隆扩繁与突变位点基因鉴定第63-65页
   ·利用OKS+pFind1高通量筛选多能性相关基因第65-77页
     ·突变克隆群体诱导与收集第65页
     ·突变群体基因库获取第65-67页
     ·突变基因建库与二代测序第67页
     ·大规模测序数据分析第67-71页
     ·绘制全基因组突变热点图谱第71-73页
     ·绘制基因重编程相关度排名表第73-75页
     ·Top1000基因GO分析第75-76页
     ·Top1000基因进行KEGG通路分析第76-77页
   ·IFN多能性验证第77-89页
     ·人诱导多能性干细胞体系的建立第77-81页
     ·人干扰素对人成纤维细胞重编程的作用(cell line CRL2097)第81-82页
     ·人干扰素对人成纤维细胞重编程的作用(cell line PCS201-10)第82-83页
     ·人干扰素IFN对重编程的剂量效应第83-84页
     ·人干扰素IFN对小鼠成纤维细胞重编程作用第84-85页
     ·小鼠干扰素对重编程的作用第85页
     ·小鼠干扰素IFNα对重编程的剂量效应第85-87页
     ·小鼠干扰素IFNγ对重编程的时间效应第87-89页
第四章 讨论与展望第89-91页
   ·piggyBac基因抓捕系统的评价第89页
   ·IFN对重编程的影响第89-90页
   ·先天免疫通路与重编程相关性第90页
   ·人iPSCs的诱导与鉴定第90-91页
第五章 结论第91-92页
参考文献第92-99页
附录第99-110页
 附录1 引物设计第99-102页
 附录2 单染色体热点图第102-110页
致谢第110-111页
个人简历第111页

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