| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 目录 | 第6-8页 |
| 1 文献综述 | 第8-20页 |
| ·棉纤维及其细胞的分化与发育 | 第8-9页 |
| ·棉纤维的形成 | 第8页 |
| ·棉纤维细胞的分化与发育 | 第8-9页 |
| ·HD-Zip 家族的研究进展 | 第9-12页 |
| ·HD-Zip 家族简介 | 第9-10页 |
| ·HD-Zip 家族的四个亚类 | 第10-12页 |
| ·HD-Zip 家族的进化研究 | 第12页 |
| ·选择性剪接的研究进展 | 第12-17页 |
| ·选择性剪接 | 第12-13页 |
| ·mRNA 剪接的基本模式 | 第13页 |
| ·选择性剪接的基本形式 | 第13-14页 |
| ·植物选择性剪接的研究进展 | 第14-16页 |
| ·棉花选择性剪接的研究 | 第16-17页 |
| ·生物信息学概述 | 第17-19页 |
| ·生物进化与生物信息学 | 第17页 |
| ·分子进化 | 第17-19页 |
| ·分子系统发育分析 | 第19页 |
| ·目的与意义 | 第19-20页 |
| 2 棉花中 HD-Zip 基因家族分类及成员分析 | 第20-32页 |
| ·材料与方法 | 第20-21页 |
| ·棉花及其他物种中 HD-Zip 基因家族的数据收集 | 第20页 |
| ·HD-Zip 基因在染色体上分布图的绘制 | 第20页 |
| ·HD-Zip 家族基因序列的进化分析 | 第20页 |
| ·HD-Zip 基因的结构分析 | 第20页 |
| ·基序分布分析 | 第20-21页 |
| ·结果与分析 | 第21-31页 |
| ·棉花 HD-Zip 基因家族的分类 | 第21-25页 |
| ·HD-Zip 基因在棉花染色体上的分布 | 第25-26页 |
| ·棉花 HD-Zip 基因的结构分析与基序分布 | 第26-31页 |
| ·讨论 | 第31-32页 |
| 3 HD-Zip 基因家族进化分析 | 第32-35页 |
| ·材料与方法 | 第32页 |
| ·HD-Zip 家族基因序列的获取与进化分析 | 第32页 |
| ·结果与分析 | 第32-34页 |
| ·HD-Zip 基因的系统进化分析 | 第32-34页 |
| ·讨论 | 第34-35页 |
| 4 HD-Zip 基因家族在棉纤维发育中的表达分析及验证 | 第35-40页 |
| ·材料与方法 | 第35-38页 |
| ·深度测序表达谱的获得与分析 | 第35页 |
| ·棉花不同发育时期的 RNA 的提取及反转录 | 第35-37页 |
| ·RT-PCR 检测 | 第37-38页 |
| ·结果与分析 | 第38-40页 |
| ·HD-Zip 基因在棉纤维发育不同时期的表达 | 第38页 |
| ·棉花各时期 RNA 电泳检测 | 第38-39页 |
| ·各基因在棉纤维发育不同时期的表达 | 第39-40页 |
| ·讨论 | 第40页 |
| 5 HD-Zip 基因家族选择性剪接分析及验证 | 第40-48页 |
| ·材料与方法 | 第40-43页 |
| ·序列数据的收集和分析 | 第40-41页 |
| ·基因外显子和内含子位置预测 | 第41页 |
| ·棉花不同发育时期的 RNA 的提取及反转录 | 第41页 |
| ·HOX53 和 HOX51 基因引物的合成 | 第41页 |
| ·PCR 扩增 | 第41-42页 |
| ·PCR 产物的胶回收 | 第42页 |
| ·连接 | 第42页 |
| ·连接产物的转化 | 第42-43页 |
| ·菌落 PCR 检测 | 第43页 |
| ·目的片段测序 | 第43页 |
| ·结果与分析 | 第43-47页 |
| ·不同时期选择性剪接分析 | 第43-44页 |
| ·HOX53 和 HOX51PCR 扩增产物电泳检测 | 第44页 |
| ·胶回收产物电泳检测 | 第44-45页 |
| ·菌落 PCR 产物电泳检测 | 第45页 |
| ·HOX53 和 HOX51 转录本类型及差异 | 第45-47页 |
| ·讨论 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-54页 |
| 个人简介 | 第54-55页 |
| 致谢 | 第55页 |
