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酵母细胞基因组中与钙离子稳态相关基因的功能研究

中文摘要第1-4页
ABSTRACT第4-8页
第一章 文献综述第8-27页
   ·酿酒酵母细胞中钙离子信号传导途径网络第8-17页
     ·酿酒酵母细胞中钙离子信号途径简介第8-9页
     ·钙调磷酸酯酶第9-11页
     ·酵母钙调磷酸酯酶在应答环境压力中的作用第11-12页
     ·转录因子 Crz15777第12-14页
     ·钙离子通道第14-16页
     ·小结第16-17页
   ·ESCRT 的功能和组成第17-20页
     ·ESCRT 综述第17页
     ·ESCRT 复合体的组成第17-20页
     ·小结第20页
   ·ESCRT 复合体与 Rim101 信号传导途径的关系第20-26页
     ·Rim101 通路的概述第20-21页
     ·ESCRT 复合体与 Rim101 信号传导途径的关系第21-25页
     ·结论第25-26页
   ·本论文的研究内容及意义第26-27页
第二章 材料与方法第27-40页
   ·实验仪器与材料第27-34页
     ·实验所用仪器第27-28页
     ·主要实验试剂及试剂盒第28-29页
     ·主要溶液及配制方法第29-32页
     ·实验所用培养基第32-34页
   ·所有实验的通用方法第34-40页
     ·菌株传代与保存第34页
     ·质粒或连接体系转化大肠杆菌感受态细胞第34页
     ·碱裂解法快速提取质粒 DNA第34页
     ·PCR 反应体系的建立和产物纯化第34-36页
     ·酶切反应体系的建立第36页
     ·连接反应体系的建立第36页
     ·酿酒酵母细胞的转化第36-37页
     ·酿酒酵母细胞的基因组 DNA 的提取第37-38页
     ·细胞中总蛋白的提取第38页
     ·Western blot第38页
     ·倍比稀释法进行表型实验第38页
     ·生物信息学方法第38-40页
第三章 酿酒酵母钙离子敏感菌株的文库筛选第40-61页
   ·实验材料第40-42页
     ·实验菌株-缺失株文库第40-41页
     ·实验中用到的引物第41-42页
   ·本章实验方法第42-43页
     ·实验所涉及到的通用实验方法第42页
     ·钙离子敏感菌株的文库筛选第42-43页
     ·胞内钙离子含量测定第43页
   ·实验结果第43-58页
     ·Ca~(2+)敏感菌株的文库筛选结果第43-48页
     ·Ca~(2+)敏感菌株的功能和定位分析第48-49页
     ·CsA 对钙离子敏感菌株敏感性的抑制作用第49-52页
     ·胞内钙离子含量测定第52-56页
     ·MgCl_2对钙离子敏感菌株的抑制作用第56-58页
   ·本章小结与讨论第58-61页
第四章 Class E VPS 基因与钙离子信号转导的关系第61-76页
   ·实验材料与方法第61-65页
     ·实验所用菌株、质粒和引物第61-63页
     ·实验所涉及到的通用实验方法第63页
     ·酿酒酵母细胞质内钙离子含量的测定第63页
     ·酿酒酵母双基因缺失株的构建策略第63-64页
     ·酿酒酵母β-半乳糖苷酶活性的测定第64-65页
   ·实验结果第65-75页
     ·Class E VPS 基因的缺失导致胞内钙离子含量和细胞质内钙离子浓度提高第65-66页
     ·CsA 抑制 ESCRT 缺失株对钙离子敏感性的作用机理研究第66-71页
     ·PMR1 转录水平的降低导致 ESCRT 基因缺失株对钙离子敏感第71-74页
     ·PMR1 的过表达可以抑制 ESCRT 缺失株对钙离子的敏感性第74-75页
   ·本章小结第75-76页
第五章 Nrg1 负调控 Pmr1第76-92页
   ·实验材料和方法第76-81页
     ·实验所用菌株、引物和质粒第76-78页
     ·实验所涉及到的通用实验方法第78页
     ·EMSA 实验原理和方法第78-79页
     ·GST-Nrg1 融合蛋白的纯化第79页
     ·染色质免疫共沉淀(ChIP)实验原理和方法第79-81页
   ·实验结果第81-90页
     ·ESCRT 缺失株中Rim101不能被正常剪切导致其对钙离子和锂离子敏感第81-84页
     ·ESCRT 缺失株中 NRG1 表达量的升高导致 PMR1 表达量的降低第84-85页
     ·Nrg1 通过 PMR1 启动子上的两个结合位点对其进行负调控第85-88页
     ·Nrg1 可以与 PMR1 启动子序列体内、体外结合第88-90页
   ·本章小结第90-92页
第六章 Crz1 对 PMR1 正调控第92-100页
   ·实验材料和方法第92-94页
     ·实验所用菌株、引物和质粒第92-93页
     ·实验所涉及到的通用实验方法第93页
     ·GST-Crz1 的纯化第93-94页
   ·实验结果第94-97页
     ·Crz1 与 PMR1 启动子结合位点的鉴定第94-95页
     ·Crz1 通过 PMR1 启动子上两个保守序列对其正调控第95-97页
   ·PMR1 在碱性应答条件下的表达第97-98页
   ·PMR1,PMC1 和 7 个 ESCRT 复合物以及 NRG1 和 CRZ1 遗传学相互作用第98-99页
   ·本章小结第99-100页
第七章 全文总结与展望第100-102页
   ·主要工作总结第100页
   ·相关工作的展望第100-102页
参考文献(References)第102-114页
发表论文和科研情况说明第114-115页
致谢第115页

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