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短乳杆菌M8菌株的筛选及其slpM基因的克隆与表达研究

缩略词第1-5页
摘要第5-8页
ABSTRACT第8-12页
目录第12-17页
第一章 益生性乳杆菌及其Slps的概述第17-33页
 1 国内外动态第17-31页
   ·乳杆菌的种类第17-18页
   ·乳杆菌的益生性作用第18-19页
   ·乳杆菌的黏附特征第19-25页
     ·黏附素第20-22页
     ·黏附靶受体第22-24页
     ·乳杆菌Slps黏附宿主的影响因素第24-25页
   ·乳杆菌的S-层蛋白(S1pS)第25-31页
     ·Slps的结构特点第25-26页
     ·乳杆菌Slps的分离与提纯第26-27页
     ·Slps及其编码基因的多样性第27-29页
     ·Slps序列比对及其二级结构分析第29页
     ·乳杆菌Slps的功能及应用第29-31页
 2 本文研究目的与意义第31页
 3 主要研究内容第31-33页
   ·Slps乳杆菌菌株的筛选、鉴定及其相关生物学特性研究第31-32页
   ·M8菌株Slps纯化、自组装超分子结构及免疫原性研究第32页
   ·Slps编码基因克隆、序列分析及结构功能预测第32-33页
第二章 Slps乳杆菌菌株的筛选及鉴定第33-55页
 1 材料与方法第33-44页
   ·材料第33-39页
     ·菌株第33页
     ·样品第33-34页
     ·培养基第34页
     ·菌体形态显微观察试剂第34-35页
     ·提取细菌基因组DNA相关试剂第35-36页
     ·琼脂糖电泳相关试剂第36-37页
     ·PCR相关试剂第37页
     ·SDS-PAGE相关试剂第37-39页
     ·主要仪器设备第39页
   ·方法第39-44页
     ·样品处理及增菌培养第39-40页
     ·乳杆菌的筛选与分离第40-41页
     ·乳杆菌的纯化第41页
     ·乳杆菌传代培养第41页
     ·乳杆菌Slps电泳样品准备第41页
     ·SDS-PAGE分析第41-42页
     ·SDS-PAGE分析菌株Slps的稳定性第42页
     ·细菌基因组DNA的提取第42-43页
     ·PCR扩增到16S rRNA序列第43-44页
     ·测序及数据分析第44页
 2 结果与分析第44-52页
   ·含Slps的乳杆菌菌落及细胞形态特征第44-46页
   ·SDS-PAGE检测各乳杆菌菌株Slps第46-47页
   ·菌株C7、M8产生Slps的稳定性分析第47-48页
   ·16SrRNA序列分析法鉴定Slps乳杆菌菌株第48-52页
     ·基因组DNA的提取第48页
     ·PCR扩增16S rRNA序列第48-49页
     ·序列测定及分析第49-50页
     ·系统发育树构建第50-52页
 3 讨论第52-54页
   ·Slps乳杆菌菌株的筛选及鉴定第52页
   ·乳杆菌Slps的鉴定第52-54页
 4 小结第54-55页
第三章 短乳杆菌M8菌株及其Sips的生物学特性分析第55-67页
 1 材料与方法第55-59页
   ·材料第55-57页
     ·菌株及细胞株第55页
     ·培养基第55页
     ·相关试剂第55-57页
     ·主要仪器设备第57页
   ·方法第57-59页
     ·菌株及细胞培养第57页
     ·对人工胃液、肠液的耐受能力第57-58页
     ·Slps的可再生性检测第58页
     ·体外黏附试验第58-59页
 2 结果与分析第59-65页
   ·耐消化酶能力第59-60页
   ·Slps可再生特性结果第60-62页
   ·体外黏附试验结果第62-65页
 3 讨论与小结第65-67页
   ·讨论第65-66页
   ·小结第66-67页
第四章 短乳杆菌M8菌株Slps的提纯及其氨基酸组成分析第67-78页
 1 材料与方法第67-71页
   ·材料第67-68页
     ·菌株及培养基第67页
     ·相关试剂第67-68页
     ·主要仪器设备第68页
   ·方法第68-71页
     ·菌株培养第68-69页
     ·Slps的提取第69页
     ·SDS-PAGE分析第69页
     ·Slps浓度测定第69-70页
     ·Slps的浓缩及复溶第70页
     ·Slps纯化第70-71页
     ·纯化后的Slps纯度与浓度检测第71页
     ·氨基酸组成分析第71页
 2 结果第71-76页
   ·SDS-PAGE分析透析后的Slps第71-72页
   ·M8菌株Slps的纯化第72-75页
     ·BSA标准曲线制作第72-73页
     ·Slps浓度测定及浓缩第73页
     ·Slps的纯化及纯度检测第73-74页
     ·Slps浓度及纯化效率分析第74-75页
   ·氨基酸组成分析第75-76页
 3 讨论与小结第76-78页
   ·讨论第76-77页
   ·小结第77-78页
第五章 M8菌株Slps分子的自组装结构与免疫原性初探第78-93页
 1 材料与方法第78-83页
   ·材料第78-79页
     ·菌株及培养基第78页
     ·相关试剂第78-79页
     ·主要仪器设备第79页
   ·方法第79-83页
     ·菌株培养第79页
     ·M8菌株细胞AFM观察样品制备第79页
     ·纯化Slps的AFM观察样品制备第79-80页
     ·显微镜观察第80页
     ·SDS-PAGE电泳分离Slps第80页
     ·切胶回收Slps第80-81页
     ·Sips多克隆抗体的制备第81-82页
     ·Western blotting分析第82-83页
 2 结果与分析第83-89页
   ·M8菌体细胞表面形貌展示第83-84页
   ·离体后的Slps表面形貌展示第84-86页
   ·TEM观测结果第86-87页
   ·SDS-PAGE电泳及切胶回收第87-88页
   ·Slps多抗制备ELISA法效价分析第88页
   ·Slps兔抗IgG的纯化及其特异性检测第88-89页
 3 讨论与小结第89-93页
   ·讨论第89-91页
     ·Slps自组装超分子结构观测第89-90页
     ·Slps免疫原性探讨第90-91页
   ·小结第91-93页
     ·Slps分子呈纳米尺度结构第91-92页
     ·Slps免疫原性分析第92-93页
第六章 M8菌株SlpM基因克隆与表达研究第93-110页
 1 材料与方法第93-99页
   ·材料第93-95页
     ·菌株和载体第93-94页
     ·培养基第94页
     ·主要试剂及试剂盒第94页
     ·主要仪器设备第94-95页
   ·方法第95-99页
     ·菌株培养第95页
     ·菌株L.brevis M8基因组DNA提取第95页
     ·引物确定第95页
     ·PCR扩增及测序分析第95-96页
     ·PCR扩增S-层基因ORF(slpM)第96页
     ·连接及转化第96-97页
     ·转化第97页
     ·PCR法鉴定阳性重组子第97页
     ·重组质粒提取第97页
     ·质粒双酶切第97-98页
     ·片段回收第98页
     ·原核表达载体pQE30-slpM的构建第98-99页
     ·原核表达载体转化及双酶切验证第99页
     ·提取重组质粒及转化第99页
     ·诱导表达第99页
     ·Slps电泳样品准备第99页
     ·SDS-PAGE检测第99页
 2 结果与分析第99-107页
   ·基因组DNA的提取第99-100页
   ·通用引物扩增Slps第100-101页
   ·slpMC序列Blastn比对分析第101页
   ·slpMC序列Blastx比对分析第101-102页
   ·slpM基因开放阅读框分析第102-103页
   ·slpM基因的扩增第103页
   ·slpM基因的克隆及阳性重组子验证第103-104页
   ·双酶切目的片段第104-105页
   ·双酶切pQE30质粒第105页
   ·回收酶切产物第105-106页
   ·pQE30-slpM载体构建第106-107页
   ·诱导表达第107页
 3 讨论与小结第107-110页
   ·讨论第107-108页
   ·小结第108-110页
     ·slpM基因的获得第108-109页
     ·slpM基因的克隆与表达第109-110页
第七章 M8菌株SlpM的生物信息学分析第110-125页
 1 软件及用途第110页
 2 结果与分析第110-122页
   ·蛋白SlpM序列及其氨基酸组成分析第110-113页
   ·SlpM分子量与等电点预测第113页
   ·SlpM亲疏水性分析第113-114页
   ·SlpM跨膜结构预测第114-115页
   ·SlpM的信号肽序列分析第115-116页
   ·SlpM与其他Slps进行多序列比对第116-119页
   ·SlpM与源自其他L.brevis菌株的Slps的遗传进化分析第119-120页
     ·比对序列的确定第119页
     ·遗传进化树构建及分析第119-120页
   ·SlpM的二级结构预测第120-121页
   ·SlpM三级结构预测及其功能推导第121-122页
 3 讨论与小结第122-125页
   ·讨论第122-123页
   ·小结第123-125页
     ·SlpM基本理化性质预测第123页
     ·SlpM 二级结构预测第123-124页
     ·SlpM三级结构预测第124-125页
第八章 全文总结第125-128页
 1 主要研究成果第125-126页
   ·Slps乳杆菌菌株的筛选及鉴定第125页
   ·L.brevis M8及其Slps的生物学特性研究第125页
   ·M8菌株Slps的提纯及氨基酸组成分析第125-126页
   ·M8菌株Slps自组装结构初探第126页
   ·slpM基因的克隆与表达第126页
   ·SlpM蛋白结构及功能的预测第126页
 2 全文的创新点第126-127页
 3 展望第127-128页
参考文献第128-141页
附件第141-148页
致谢第148-149页
作者简介第149页

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