| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-14页 |
| 第一章 SNXs家族蛋白概述 | 第14-28页 |
| ·Sorting nexins(SNXs) | 第14-15页 |
| ·PX结构域 | 第15-18页 |
| ·PX结构域的结构 | 第15-16页 |
| ·PX结构域介导PX蛋白与膜结合 | 第16-18页 |
| ·PX结构域与蛋白相互作用 | 第18页 |
| ·SNXs与蛋白分选运输 | 第18-24页 |
| ·SNXs与网格蛋白介导的细胞内吞 | 第19-20页 |
| ·SNXs参与调节蛋白由初级内体到溶酶体的运输 | 第20-21页 |
| ·SNXs调节营养素受体由初级内体向质膜的循环运输 | 第21-22页 |
| ·SNXs调节蛋白由内体向反面高尔基体网的运输 | 第22-24页 |
| ·SNXs蛋白与信号传递 | 第24-26页 |
| ·SNXs蛋白的结构生物学研究现状、意义 | 第26-28页 |
| 第一部分 SNX16的结构生物学研究 | 第28-78页 |
| 第二章 SNX16的研究背景 | 第28-34页 |
| ·SNX16的结构域组成 | 第28页 |
| ·Coiled coil结构域 | 第28-31页 |
| ·Coiled coil结构域概述 | 第28页 |
| ·Coiled coil结构结构域的结构特征 | 第28-31页 |
| ·SNX16的结构与功能 | 第31-34页 |
| ·Coiled coil结构域参与SNX16的寡聚化 | 第31-32页 |
| ·SNX16与内体运输 | 第32页 |
| ·SNX16与疾病 | 第32-34页 |
| 第三章 实验材料、设备与方法 | 第34-43页 |
| ·实验材料 | 第34-35页 |
| ·质粒与菌株 | 第34页 |
| ·试剂 | 第34-35页 |
| ·仪器设备 | 第35页 |
| ·实验方法 | 第35-43页 |
| ·重组质粒的构建 | 第35-37页 |
| ·目的蛋白的表达 | 第37-39页 |
| ·目的蛋白的纯化 | 第39-40页 |
| ·蛋白酶解实验 | 第40页 |
| ·蛋白甲基化修饰 | 第40-41页 |
| ·动态光散射(DLS)实验 | 第41页 |
| ·Native-PAGE实验 | 第41页 |
| ·蛋白质结晶 | 第41-42页 |
| ·数据收集和结构解析 | 第42-43页 |
| 第四章 结果与讨论 | 第43-77页 |
| ·全长SNX16的纯化 | 第43-45页 |
| ·SNX161~(101-283)的纯化和结晶 | 第45-49页 |
| ·野生型和硒代SNX16~(101-283)的纯化和结晶 | 第45-48页 |
| ·SNX16~(101-283)的甲基化以及甲基化SNX16~(101-283)的结晶和优化 | 第48-49页 |
| ·SNX16~(100-278)的纯化和结晶 | 第49-53页 |
| ·野生型SNX16~(100-278)的纯化 | 第49-50页 |
| ·SNX16~(100-278)的甲基化 | 第50-52页 |
| ·野生型、甲基化和甲基化硒代SNX161~(100-278)的晶体筛选和优化 | 第52-53页 |
| ·甲基化硒代的SNX16~(100-278)晶体衍射数据收集、结构解析和结构修正 | 第53-62页 |
| ·数据收集与处理 | 第53-54页 |
| ·结构解析 | 第54页 |
| ·SNX16~(100-278)-P2_1和SNX16~(100-278)-P2_12_12_1的结构修正 | 第54-56页 |
| ·SNX16~(100-278)-P2_1和SNX16~(100-278)-P2_12_12_1结构模型的质量评估 | 第56-62页 |
| ·SNX16~(100-278)的结构分析 | 第62-77页 |
| ·SNX16~(100-278)的总体结构 | 第62-63页 |
| ·SNX16~(100-278)的Coiled coil结构域 | 第63-65页 |
| ·SNX16的PX结构域 | 第65-68页 |
| ·SNX16~(100-278)结构域之间的相互作用 | 第68-71页 |
| ·SNX16~(100-278)二聚体结构中独特的PI3P结合口袋 | 第71-75页 |
| ·SNX16~(100-278)二聚体结构中的膜结合界面 | 第75-77页 |
| 本篇小结 | 第77-78页 |
| 第二部分 SNX11的结构生物学研究 | 第78-101页 |
| 第五章 SNX11的研究背景 | 第78-80页 |
| ·前言 | 第78页 |
| ·SNX~(PX)调节内体的形态发生 | 第78-79页 |
| ·SNX~(PX)的结构与功能 | 第79-80页 |
| 第六章 实验材料、设备与方法 | 第80-86页 |
| ·实验材料 | 第80-81页 |
| ·质粒与菌株 | 第80页 |
| ·试剂 | 第80页 |
| ·仪器设备 | 第80-81页 |
| ·实验方法 | 第81-86页 |
| ·重组质粒的构建 | 第81-82页 |
| ·目的蛋白的表达 | 第82-83页 |
| ·蛋白的纯化 | 第83页 |
| ·蛋白甲基化修饰 | 第83-84页 |
| ·蛋白质结晶 | 第84页 |
| ·数据收集、结构解析和修正 | 第84-86页 |
| 第七章 结果与讨论 | 第86-100页 |
| ·晶体衍射数据处理、结构解析与修正 | 第86-89页 |
| ·晶体衍射数据处理 | 第86页 |
| ·结构解析与修正 | 第86-88页 |
| ·结构模型的质量评估 | 第88-89页 |
| ·SNX11-142C和甲基化的SNX11-170C的结构分析 | 第89-100页 |
| ·SNX11-142C和甲基化的SNX11-170C的总体结构 | 第89-91页 |
| ·SNX11-170C是一个新的PX结构域 | 第91-92页 |
| ·SNX11-PXe结构域的膜结合界面分析 | 第92-96页 |
| ·SNX11的多序列比对和功能域分析 | 第96-97页 |
| ·不同PX结构域β 2/β 3 Loop的分析 | 第97-100页 |
| 本篇小结 | 第100-101页 |
| 第三部分 其他SNXs蛋白的研究 | 第101-107页 |
| 第八章 SNX17的研究 | 第101-106页 |
| ·研究背景 | 第101-104页 |
| ·前言 | 第101页 |
| ·SNX17及其同源蛋白的结构特征 | 第101-102页 |
| ·SNX17参与质膜蛋白的运输 | 第102-103页 |
| ·SNX17及同源蛋白与信号传导 | 第103页 |
| ·PX-FERM-like蛋白与Ras及跨膜蛋白的结合模型 | 第103-104页 |
| ·实验结果与讨论 | 第104-106页 |
| ·人源SNX17的表达与纯化 | 第104页 |
| ·斑马鱼SNX17(dSNX17)的表达与纯化 | 第104-106页 |
| 第九章 SNX7的研究 | 第106-107页 |
| 参考文献 | 第107-118页 |
| 附录1 载体图谱 | 第118-120页 |
| 附录2 分子克隆的一些方法 | 第120-124页 |
| 附录3 聚丙稀酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE) | 第124-127页 |
| 附录4 培养基配制 | 第127-129页 |
| 致谢 | 第129-130页 |
| 在读期间发表的学术论文与参加的学术会议 | 第130页 |
