| 附件 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-13页 |
| 英文缩略表 | 第13-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-30页 |
| ·棉花的主要遗传转化方法及发展 | 第14-16页 |
| ·农杆菌介导法 | 第14-15页 |
| ·基因枪轰击法 | 第15-16页 |
| ·花粉管通道法 | 第16页 |
| ·棉花组织培养技术的建立、发展及存在问题 | 第16-20页 |
| ·棉花组织培养体系的建立和发展 | 第16-17页 |
| ·棉花组织培养存在的问题 | 第17-18页 |
| ·棉花组织培养中基因型限制的研究 | 第18-20页 |
| ·影响棉花体细胞胚胎发生能力的主要因素 | 第20-21页 |
| ·不同外植体的体细胞胚胎发生能力 | 第20页 |
| ·培养基成分和培养条件对体细胞胚胎发生能力的影响 | 第20-21页 |
| ·分子标记的类型与特点 | 第21-25页 |
| ·RFLP标记 | 第22页 |
| ·RAPD标记 | 第22-23页 |
| ·SSR标记 | 第23页 |
| ·AFLP标记 | 第23-24页 |
| ·SNP标记 | 第24页 |
| ·其他分子标记技术 | 第24-25页 |
| ·数量性状基因座（QTL）定位研究 | 第25-28页 |
| ·体细胞胚胎发生（Somatic embryogenesis，SE）的差异基因表达研究进展 | 第28-29页 |
| ·研究目的和意义 | 第29页 |
| ·试验技术路线 | 第29-30页 |
| 第二章 陆地棉W10 高分化和不分化姊妹系的转录组分析 | 第30-62页 |
| ·材料与方法 | 第30-37页 |
| ·试验材料 | 第30页 |
| ·愈伤组织和胚性愈伤组织诱导 | 第30页 |
| ·RNA提取 | 第30页 |
| ·文库构建和Illumina测序 | 第30-31页 |
| ·生物信息学分析 | 第31-33页 |
| ·qRT-PCR定量验证 | 第33-35页 |
| ·内源IAA和zeatin的提取与测定 | 第35-36页 |
| ·EST-SSR引物设计 | 第36-37页 |
| ·试验结果与分析 | 第37-58页 |
| ·W10（CCRI24）自交后代高分化单株的选育 | 第37-39页 |
| ·总 RNA提取结果 | 第39页 |
| ·RNA-Seq测序结果分析 | 第39-40页 |
| ·unigenes的GO分类 | 第40-41页 |
| ·转录表达丰度 | 第41页 |
| ·差异基因分析结果 | 第41-42页 |
| ·KEGG富集分析 | 第42-47页 |
| ·与体细胞胚胎发生有关的Pathway分析 | 第47-57页 |
| ·利用qRT-PCR 技术验证RNA-Seq结果 | 第57-58页 |
| ·IAA和ZT在W10 姊妹系中体细胞胚胎发生过程的动态变化 | 第58页 |
| ·EST-SSR引物的设计结果 | 第58页 |
| ·讨论 | 第58-62页 |
| 第三章 愈伤组织分化率相关基因的QTL定位 | 第62-82页 |
| ·材料与方法 | 第62-68页 |
| ·试验材料 | 第62页 |
| ·作图群体的构建 | 第62页 |
| ·叶柄的组织培养 | 第62-63页 |
| ·叶柄的分化率统计 | 第63页 |
| ·DNA提取 | 第63-65页 |
| ·SSR标记技术 | 第65-67页 |
| ·数据整理及分析方法 | 第67-68页 |
| ·试验结果与分析 | 第68-79页 |
| ·SSR标记多态性筛选及群体扩增结果 | 第68-69页 |
| ·连锁图谱的构建 | 第69-72页 |
| ·SSR标记的偏分离检验 | 第72-76页 |
| ·QTL定位分析 | 第76-79页 |
| ·讨论 | 第79-82页 |
| 第四章 全文结论、展望及创新点 | 第82-85页 |
| ·全文结论 | 第82-84页 |
| ·全文展望 | 第84页 |
| ·本文创新点 | 第84-85页 |
| 参考文献 | 第85-95页 |
| 致谢 | 第95-96页 |
| 作者简历 | 第96页 |
