| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-12页 |
| 第一章 引言 | 第12-19页 |
| ·传染性喉气管炎概述 | 第12页 |
| ·传染性喉气管炎病毒的生物学特性 | 第12页 |
| ·病毒和毒株分类 | 第12页 |
| ·病毒形态学 | 第12页 |
| ·病毒复制 | 第12-13页 |
| ·宿主范围 | 第13页 |
| ·流行病学 | 第13-14页 |
| ·ILTV 的发病机理 | 第14页 |
| ·ILTV 基因组学研究 | 第14-16页 |
| ·ILTV 主要结构蛋白的研究 | 第16-18页 |
| ·研究目的和意义 | 第18-19页 |
| 第二章 三株传染性喉气管炎病毒基因组序列测定与分析 | 第19-42页 |
| ·材料 | 第19页 |
| ·毒株，菌种，质粒，鸡胚 | 第19页 |
| ·试剂 | 第19页 |
| ·实验仪器 | 第19页 |
| ·方法 | 第19-27页 |
| ·病毒的分离与增殖 | 第19-20页 |
| ·分离病毒的鉴定 | 第20页 |
| ·引物设计 | 第20-23页 |
| ·基因组的分段扩增 | 第23页 |
| ·单引物扩增确定 TRS区与 UL区接头 | 第23-24页 |
| ·IRS和 TRS重复区的确定 | 第24-25页 |
| ·PCR 产物鉴定及回收纯化 | 第25页 |
| ·PCR 产物连接与转化 | 第25-26页 |
| ·重组质粒的提取、鉴定及序列测定 | 第26页 |
| ·全基因组序列拼接、分析及比较 | 第26-27页 |
| ·结果 | 第27-38页 |
| ·分离病毒增殖 | 第27页 |
| ·病毒基因组 DNA 鉴定 | 第27-28页 |
| ·病毒电镜观察 | 第28页 |
| ·间接免疫荧光检测 | 第28页 |
| ·TRS/UL区接头的确定 | 第28-29页 |
| ·重复区序列的确定 | 第29页 |
| ·基因组序列分段扩增结果 | 第29-31页 |
| ·三株 ILTV 基因组结构组成 | 第31-32页 |
| ·遗传进化分析 | 第32-33页 |
| ·开放阅读框分析 | 第33-36页 |
| ·单核苷酸多态性（SNP）分析 | 第36页 |
| ·与细胞嗜性相关糖蛋白氨基酸突变分析 | 第36-37页 |
| ·非编码区分析 | 第37-38页 |
| ·讨论 | 第38-42页 |
| 第三章 全文结论 | 第42-43页 |
| 参考文献 | 第43-52页 |
| 附录 | 第52-64页 |
| 致谢 | 第64-65页 |
| 作者简介 | 第65页 |