基于序列分析的模式识别方法和功效研究
目录 | 第1-7页 |
摘要 | 第7-11页 |
Abstract | 第11-17页 |
第一章 引言 | 第17-25页 |
·生物信息学 | 第17-21页 |
·人类基因组计划 | 第17-19页 |
·DNA测序技术的发展 | 第19-21页 |
·与本论文相关的成果 | 第21-25页 |
·基于一代测序技术的Motif的识别 | 第21-22页 |
·基于二代测序的Motif的识别 | 第22-23页 |
·主要问题 | 第23-25页 |
第二章 模式识别统计功效的研究 | 第25-61页 |
·模型的描述 | 第25-27页 |
·理论描述 | 第27-37页 |
·正态近似 | 第27-34页 |
·复合泊松近似 | 第34-37页 |
·模拟实验和计算功效的在线项目 | 第37-51页 |
·模拟实验 | 第37-44页 |
·在线计算模式功效的项目 | 第44-51页 |
·生物数据的应用 | 第51-57页 |
·利用正态近似研究CpG富集区的功效 | 第51-54页 |
·利用复合泊松近似研究相对长的模式的功效 | 第54-57页 |
附表 | 第57-61页 |
第三章 基于NGS数据的模式识别 | 第61-111页 |
·理论描述 | 第61-82页 |
·基于二代测序的概率模型 | 第62-63页 |
·基于NGS数据的模式发生次数的正态近似 | 第63-75页 |
·基于NGS数据的模式发生次数的复合泊松近似 | 第75-77页 |
·基于双链模型的复合泊松近似 | 第77-81页 |
·模式发生次数的近似功效 | 第81-82页 |
·模拟研究和生物数据的使用 | 第82-105页 |
·正态近似和复合泊松近似的模拟研究 | 第82-86页 |
·功效的模拟研究 | 第86-94页 |
·在ChIP-Seq数据上的使用 | 第94-105页 |
附表 | 第105-111页 |
参考文献 | 第111-119页 |
致谢 | 第119-121页 |
作者简介 | 第121-124页 |
学位论文评阅及答辩情况表 | 第124页 |