| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-10页 |
| 1 前言 | 第10-23页 |
| ·SSR分子标记的研究 | 第10-14页 |
| ·研究概况 | 第10-11页 |
| ·SSR分子标记的应用 | 第11-12页 |
| ·SSR分子标记的开发 | 第12-14页 |
| ·菠萝的研究概况 | 第14-17页 |
| ·菠萝的简介 | 第14-15页 |
| ·生产和贸易概况 | 第15-16页 |
| ·菠萝的加工 | 第16页 |
| ·世界和我国的育种情况 | 第16-17页 |
| ·菠萝种质资源和分子标记的研究 | 第17-20页 |
| ·菠萝种质资源研究概况 | 第17-19页 |
| ·菠萝的分子标记研究 | 第19-20页 |
| ·本研究内容与意义 | 第20-23页 |
| ·选题依据 | 第20-21页 |
| ·研究内容 | 第21-22页 |
| ·研究的目的和意义 | 第22页 |
| ·技术路线 | 第22-23页 |
| 2 材料和方法 | 第23-39页 |
| ·菠萝基因组SSR分子标记的开发 | 第23-34页 |
| ·材料 | 第23页 |
| ·方法 | 第23-34页 |
| ·菠萝EST-SSR分子标记的开发 | 第34-35页 |
| ·植物材料和EST的获得 | 第34-35页 |
| ·数据分析 | 第35页 |
| ·引物筛选 | 第35页 |
| ·菠萝遗传多样性分析 | 第35-37页 |
| ·植物材料 | 第35-37页 |
| ·引物选择 | 第37页 |
| ·数据处理 | 第37页 |
| ·位点变异分析 | 第37页 |
| ·部分菠萝SSR指纹图谱构建 | 第37-39页 |
| ·植物材料 | 第37页 |
| ·PCR扩增和电泳检测 | 第37-38页 |
| ·图谱构建方法 | 第38-39页 |
| 3 结果 | 第39-54页 |
| ·基因组SSR分子标记开发 | 第39-44页 |
| ·菠萝叶片总DNA的提取 | 第39页 |
| ·DNA的酶切检测和抑制性PCR、预扩增产物的检测 | 第39-40页 |
| ·Selectively Amplified Microsatellite(SAM)扩增结果分析 | 第40页 |
| ·SAM扩增产物的回收、纯化与克隆 | 第40-41页 |
| ·克隆产物的测序结果分析 | 第41-42页 |
| ·特异引物的设计 | 第42-43页 |
| ·多态性引物的筛选 | 第43-44页 |
| ·菠萝EST-SSR分子标记开发 | 第44-48页 |
| ·菠萝转录子组中SSR的分布和频率 | 第44-46页 |
| ·EST-SSR分子标记的开发 | 第46页 |
| ·EST-SSR多态性引物的筛选 | 第46-48页 |
| ·菠萝遗传多样性分析 | 第48-51页 |
| ·基因组SSR和EST-SSR标记多态性分析 | 第48页 |
| ·聚类分析 | 第48-49页 |
| ·位点变异检测 | 第49-51页 |
| ·SSR指纹图谱构建 | 第51-54页 |
| ·SSR标准引物的筛选 | 第51页 |
| ·标准带谱的建立 | 第51页 |
| ·标准图谱的构建 | 第51-54页 |
| 4 讨论 | 第54-60页 |
| ·从基因组开发的SSR | 第54-55页 |
| ·SAM法分离SSR标记的效率 | 第54页 |
| ·SSR序列的分析 | 第54-55页 |
| ·从EST开发的SSR | 第55-56页 |
| ·从EST分离SSR标记的效率 | 第55页 |
| ·SSR序列的分析 | 第55-56页 |
| ·从基因组开发SSR和从EST开发SSR的比较 | 第56页 |
| ·SSR标记开发效率 | 第56页 |
| ·SSR序列的分析 | 第56页 |
| ·新开发的SSR标记对菠萝种质的遗传多样性分析 | 第56-58页 |
| ·遗传多样性分析 | 第56-58页 |
| ·位点变异检测 | 第58页 |
| ·指纹图谱的构建 | 第58-60页 |
| ·引物的选择及图谱构建 | 第58-59页 |
| ·微卫星标记的选择 | 第59-60页 |
| 5.结论 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-67页 |
| 附录 | 第67-72页 |
| 附表1 特异SSR引物情况表 | 第67-69页 |
| 附表2 SSR引物扩增结果表 | 第69-71页 |
| 附表3 SSR引物扩增结果表 | 第71-72页 |
| 感谢 | 第72页 |