| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-9页 |
| 英文缩略词 | 第9-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-25页 |
| ·HIV的流行和分型 | 第13-14页 |
| ·我国HIV流行情况 | 第14-15页 |
| ·HIV病毒基因变异与分子进化 | 第15-17页 |
| ·HIV病毒 | 第15-16页 |
| ·HIV的基因变异与准种的发生 | 第16页 |
| ·HIV的分子进化 | 第16-17页 |
| ·HIV抗病毒治疗与耐药性 | 第17-19页 |
| ·HIV低频率耐药性突变研究进展 | 第19-25页 |
| ·HIV-1低频率耐药性突变 | 第19-20页 |
| ·HIV-1低频率耐药性突变的检测方法 | 第20-22页 |
| ·HIV-1低频率耐药性突变对抗病毒治疗的影响 | 第22-24页 |
| ·HIV-1低频率耐药性突变研究展望 | 第24-25页 |
| 第二章 材料与方法 | 第25-36页 |
| ·材料 | 第25-27页 |
| ·研究样本 | 第25页 |
| ·实验试剂和耗材 | 第25-27页 |
| ·实验仪器和设备 | 第27页 |
| ·实验方法 | 第27-35页 |
| ·全血样本中HIV cDNA的提取 | 第27-28页 |
| ·模板DNA浓度测定 | 第28页 |
| ·巢式聚合酶链式反应(Nested-PCR) | 第28-30页 |
| ·巢式PCR产物纯化 | 第30-31页 |
| ·巢式PCR产物克隆 | 第31-34页 |
| ·菌落PCR(Colony PCR) | 第34-35页 |
| ·核酸序列测定 | 第35页 |
| ·数据处理 | 第35-36页 |
| 第三章 结果与分析 | 第36-55页 |
| ·巢式PCR和菌落PCR产物鉴定 | 第36-38页 |
| ·gag基因巢式PCR和菌落PCR产物鉴定 | 第36页 |
| ·env基因巢式PCR和菌落PCR产物鉴定 | 第36-37页 |
| ·pol基因巢式PCR和菌落PCR产物鉴定 | 第37-38页 |
| ·基因分型 | 第38-40页 |
| ·gag基因进化树分析 | 第38-40页 |
| ·gag基因与国际参考株基因离散率和基因同源性分析 | 第40页 |
| ·gag、env、pol基因序列基因离散率和熵值分析 | 第40-46页 |
| ·gag、env、pol基因PCR序列基因离散率 | 第40-42页 |
| ·gag、env、pol基因克隆序列基因离散率 | 第42-43页 |
| ·gag、env、pol基因PCR序列熵值 | 第43页 |
| ·gag、env、pol基因克隆序列熵值 | 第43-46页 |
| ·gag、env、pol基因选择压力分析 | 第46-47页 |
| ·gag基因序列变异特征分析 | 第47页 |
| ·P17区序列变异特征 | 第47页 |
| ·gag基因抗原表位 | 第47页 |
| ·env基因序列变异特征分析 | 第47-50页 |
| ·V3环顶端四肽序列特征 | 第47-48页 |
| ·辅助受体使用预测 | 第48-49页 |
| ·N-糖基化位点 | 第49-50页 |
| ·pol基因耐药性突变分析 | 第50-55页 |
| ·pol基因多态性 | 第50-51页 |
| ·pol基因耐药性 | 第51-55页 |
| 第四章 讨论与结论 | 第55-63页 |
| ·讨论 | 第55-61页 |
| ·HIV-1亚型流行特征 | 第55页 |
| ·gag、env、pol基因变异程度与准种变异比较 | 第55-56页 |
| ·选择压力分析 | 第56-57页 |
| ·gag基因抗原表位变异 | 第57页 |
| ·env基因序列变异特征 | 第57-59页 |
| ·耐药性突变分析 | 第59-61页 |
| ·结论 | 第61-62页 |
| ·创新点 | 第62-63页 |
| 参考文献 | 第63-71页 |
| 致谢 | 第71-72页 |
| 附录 | 第72-76页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第76页 |
