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醇脱氢酶的结构、定向进化及酶法制备萘普生的研究

摘要第1-7页
Abstract第7-14页
第1章 文献综述(一)第14-22页
   ·萘普生简介第14-16页
     ·手性第14页
     ·手性药物第14-15页
     ·非甾体类抗炎药——萘普生第15-16页
   ·酯酶简介第16-18页
   ·化学法合成(S)-萘普生第18页
   ·(S)-萘普生的酶法拆分第18-20页
     ·脂肪酶在萘普生拆分中的应用第19-20页
     ·酯酶在萘普生拆分中的应用第20页
   ·研究目的和意义第20页
   ·研究思路和内容提要第20-22页
第2章 酯酶的制备及其在萘普生甲酯酶促拆分中的应用第22-37页
   ·引言第22页
   ·材料与方法第22-28页
     ·菌种、试剂和培养基第22-23页
     ·主要仪器和设备第23页
     ·实验方法第23-28页
       ·酯酶的克隆、表达及粗酶的获得第23-25页
       ·酯酶酶活力及蛋白测定方法第25页
       ·酯酶催化不同链长脂肪酸的对硝基苯酚酯的水解反应速率第25-26页
       ·HPLC法测定酯酶对萘普生酯的催化活性和对映选择性第26页
       ·产物浓度标准曲线的绘制第26页
       ·酯酶催化萘普生甲酯水解反应条件优化第26页
       ·(S)-萘普生的酶促拆分重复批式制备第26-28页
   ·结果与讨论第28-36页
     ·酯酶的克隆与表达第28-29页
     ·酯酶对对硝基苯酚酯的底物特异性第29-30页
     ·酯酶水解拆分萘普生甲酯的反应条件优化第30-35页
       ·温度的影响第31-32页
       ·pH的影响第32页
       ·吐温-80浓度的影响第32-33页
       ·底物浓度的影响第33-34页
       ·产物甲醇的影响第34页
       ·产物萘普生的抑制作用第34-35页
     ·(S)-萘普生的酶促拆分重复批式制备第35-36页
   ·本章小结第36-37页
第3章 文献综述(二)第37-52页
   ·生物能源异丁醇第37-41页
     ·生物能源简介第37-38页
     ·生物能源异丁醇及其研究进展第38-41页
   ·醇脱氢酶第41-45页
     ·醇脱氢酶简介第41-42页
     ·醇脱氢酶的三维结构第42-44页
       ·辅酶结合域第43页
       ·催化域第43-44页
       ·锌离子第44页
     ·醇脱氢酶的催化机理第44-45页
     ·醇脱氢酶的构象变化第45页
     ·醇脱氢酶在异丁醇生物合成中的作用第45页
   ·蛋白质定向进化第45-50页
     ·蛋白质定向进化技术简介第45-46页
     ·突变文库的构建方法第46-48页
       ·随机突变第46-47页
       ·饱和突变第47-48页
       ·DNA重组第48页
     ·突变文库的高通量筛选策略第48-49页
     ·定向进化研究进展第49-50页
   ·研究目的和意义第50页
   ·研究思路和内容提要第50-52页
第4章 醇脱氢酶的定向进化第52-71页
   ·引言第52页
   ·定向进化技术路线第52-53页
   ·材料和方法第53-60页
     ·菌株、引物、试剂和培养基第53-54页
     ·主要仪器、设备及分析软件第54-55页
     ·实验方法第55-60页
       ·定向进化起点的选择第55页
       ·突变文库的构建第55-57页
       ·高通量筛选第57-58页
       ·醇脱氢酶的大量表达和粗酶的获得第58页
       ·醇脱氢酶的纯化第58-59页
       ·醇脱氢酶及其有益突变体的表征第59页
       ·醇脱氢酶活力的测定第59页
       ·异丁醇厌氧发酵质粒和菌株的构建以及异丁醇的发酵生产第59页
       ·发酵产物异丁醇的分析第59-60页
   ·结果和讨论第60-70页
     ·定向进化起点的选择第60页
     ·高通量筛选方法的建立第60-61页
     ·醇脱氢酶LlAdhA的定向进化第61-66页
       ·第1轮——随机突变第61-62页
       ·第2轮——组合突变第62页
       ·第3轮——随机突变第62-63页
       ·第4轮——定点饱和突变第63页
       ·第5轮——组合突变第63页
       ·第6轮——活性中心序列随机突变第63-64页
       ·第7轮——密码子偏好组合突变第64页
       ·第8轮——定点饱和突变第64-65页
       ·第9轮——随机突变第65页
       ·定向进化小结第65-66页
     ·突变体的表征第66-68页
       ·热稳定性——T_(50)值第66页
       ·辅酶NADH的K_M值第66-67页
       ·催化异丁醇氧化的K_M值第67页
       ·底物特异性第67-68页
     ·定向进化导致的异丁醇产量的提高第68-70页
   ·本章小结第70-71页
第5章 醇脱氢酶及其突变体的晶体结构和结构解析第71-82页
   ·引言第71页
   ·材料和方法第71-73页
     ·菌种、试剂及培养基第71页
     ·主要仪器、设备及分析软件第71页
     ·实验方法第71-73页
       ·AdhA和突变体RE1在大肠杆菌中的大量表达和纯化第71-72页
       ·晶体的获得第72页
       ·X射线晶体衍射和数据收集第72页
       ·分子置换和结构精修第72-73页
       ·结构分析与建模第73页
       ·蛋白质数据库录入编号第73页
   ·结果和讨论第73-81页
     ·LlAdhA的结构表征第73-77页
     ·定向进化的结构基础第77-81页
       ·突变体RE1对异丁醛活性提高的结构基础第77-79页
       ·突变N110S对突变体29C8活力提高的作用第79-80页
       ·定向进化对热稳定性的影响第80页
       ·定向进化对底物特异性的影响第80-81页
   ·本章小结第81-82页
第6章 总结与展望第82-85页
   ·全文总结第82-83页
   ·论文创新点第83-84页
   ·工作展望第84-85页
参考文献第85-96页
附录1第96-97页
附录2第97-100页
附录3第100-101页
附录4第101-102页
附录5第102-103页
附录6第103-104页
攻读博士期间撰写的论文与专利第104-105页
致谢第105页

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