| 目录 | 第1-7页 |
| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-12页 |
| 縮略语表 | 第12-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-27页 |
| ·植物抗病反应信号传导 | 第13-19页 |
| ·植物先天免疫系统 | 第13-14页 |
| ·依赖R基因的信号传导路径 | 第14-15页 |
| ·依赖SA的系统获得性抗性信号路径 | 第15-16页 |
| ·依赖JA和ET的诱导系统抗性信号路径 | 第16-19页 |
| ·抗病信号传导路径的交互作用 | 第19页 |
| ·棉花黄萎病概述 | 第19-20页 |
| ·棉花黄萎病抗病机制研究进展 | 第20-25页 |
| ·抗病基因介导的抗性 | 第20-22页 |
| ·乙烯对在棉花与黄萎病菌互作中的作用 | 第22-23页 |
| ·棉花对黄萎病的组织结构抗性 | 第23-24页 |
| ·棉花对黄萎病的生理生化抗性 | 第24-25页 |
| ·本课题研究意义与目的 | 第25-27页 |
| 第二章 基于抑制差减杂交方法的棉花抗病表达谱分析 | 第27-44页 |
| ·前言 | 第27页 |
| ·实验材料 | 第27页 |
| ·植物材料和病原菌 | 第27页 |
| ·菌株和载体 | 第27页 |
| ·实验方法 | 第27-32页 |
| ·黄萎病菌活化及培养 | 第27-28页 |
| ·棉花病菌处理及激素处理 | 第28-29页 |
| ·RNA提取及纯化 | 第29页 |
| ·SSH文库构建 | 第29页 |
| ·反向Northern杂交筛选差异克隆 | 第29-30页 |
| ·测序和数据分析 | 第30页 |
| ·Northern杂交 | 第30-31页 |
| ·RT-PCR和qPCR分析 | 第31-32页 |
| ·结果与分析 | 第32-41页 |
| ·受黄萎病菌诱导的棉花抗黄萎病SSH cDNA文库构建 | 第32-33页 |
| ·序列分析及BLAST检索结果 | 第33-34页 |
| ·Northern杂交结果及分析 | 第34-36页 |
| ·RT-PCR和qPCR结果及分析 | 第36页 |
| ·激素(SA,JA和ET)及H202处理后的基因表达分析 | 第36-39页 |
| ·乙烯相关基因的表达分析 | 第39-41页 |
| ·讨论 | 第41-44页 |
| ·基于构建SSH文库的方法分析棉花抗黄萎病的表达谱 | 第41页 |
| ·棉花黄萎病抗病表达谱分析 | 第41-42页 |
| ·乙烯在棉花与黄萎病菌互作中的作用 | 第42-44页 |
| 第三章 基于RNA-Seq方法研究棉花与黄萎病菌的分子互作 | 第44-76页 |
| ·前言 | 第44页 |
| ·实验材料 | 第44-45页 |
| ·实验方法 | 第45-50页 |
| ·RNA-Seq测序方法 | 第45页 |
| ·RNA-Seq测序数据分析 | 第45-46页 |
| ·差异表达基因的筛选 | 第46-47页 |
| ·基因表达模式聚类 | 第47页 |
| ·基于Gene Ontology基因功能富集分析 | 第47页 |
| ·RNA-Seq数据验证 | 第47页 |
| ·苯丙氨酸代谢路径相关基因表达模式分析 | 第47-48页 |
| ·木质素合成相关酶的酶活检测 | 第48页 |
| ·木质素组织化学检测 | 第48页 |
| ·木质素总量检测 | 第48-49页 |
| ·木质素单体含量检测 | 第49-50页 |
| ·实验结果 | 第50-68页 |
| ·棉花接种结果 | 第50页 |
| ·RNA-Seq结数据分析 | 第50-51页 |
| ·差异表达基因筛选及表达模式聚类 | 第51-52页 |
| ·差异表达基因GO功能聚类 | 第52-54页 |
| ·RNA-Seq数据验证结果分析 | 第54页 |
| ·基于RNA-Seq的棉花抗病表达谱分析 | 第54-60页 |
| ·苯丙环代谢路径及木质素合成代谢关键基因表达分析 | 第60-63页 |
| ·PAL及POD酶活检测 | 第63页 |
| ·木质素的组织化学检测 | 第63-66页 |
| ·木质素的总量及单体含量测定 | 第66-68页 |
| ·讨论 | 第68-76页 |
| ·RNA-Seq在研究棉花抗病表达谱分析上的应用 | 第68-69页 |
| ·棉花与黄萎病菌的分子互作机制 | 第69-72页 |
| ·木质素代谢在棉花与黄萎病菌分子互作中的作用 | 第72-75页 |
| ·RNA-Seq数据信息的深入挖掘 | 第75-76页 |
| 第四章 GbWRKY1基因在拟南芥中的功能鉴定 | 第76-94页 |
| ·前言 | 第76-78页 |
| ·材料与方法 | 第78-81页 |
| ·植物材料 | 第78页 |
| ·GbWRKY1基因的克隆与分离 | 第78页 |
| ·载体构建及遗传转化 | 第78-79页 |
| ·转基因植株检测及表达量分析 | 第79页 |
| ·转基因拟南芥植株低磷处理 | 第79-81页 |
| ·结果 | 第81-91页 |
| ·GbWRKY1基因序列的克隆与序列分析 | 第81-82页 |
| ·GbWRKY1基因的表达分析 | 第82页 |
| ·GbWRKY1拟南芥超量表达植株表达分析 | 第82-83页 |
| ·转基因植株低磷表型分析及花青素含量测定 | 第83-84页 |
| ·转基因植株低磷处理下根系结构分析 | 第84-85页 |
| ·转基因植株根尖淀粉粒染色结果 | 第85-86页 |
| ·磷酸酶活性以及总磷和无机磷检测结果 | 第86-87页 |
| ·低磷诱导相关基因表达分析结果 | 第87-89页 |
| ·GbWRKY1对生长素信号的响应 | 第89-91页 |
| ·讨论 | 第91-94页 |
| ·GbWRKY1超量表达能缓解拟南芥在低磷胁迫下的反应 | 第91-92页 |
| ·转基因植株改变对生长素敏感性 | 第92页 |
| ·低磷胁迫反应与抗病反应 | 第92-94页 |
| 附录 | 第94-108页 |
| 参考文献 | 第108-123页 |
| 攻读学位期间已发表和待发表论文 | 第123页 |
| 申请专利 | 第123-124页 |
| 致谢 | 第124页 |