| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 1 绪论 | 第8-12页 |
| ·研究背景 | 第8-9页 |
| ·国内外研究现况 | 第9-10页 |
| ·本文内容与结构 | 第10-12页 |
| 2 OBO-Parser 的需求分析 | 第12-18页 |
| ·生物本体的概述及其作用 | 第12-15页 |
| ·语义网和OWL | 第15-16页 |
| ·OBO-Parser 的功能概述 | 第16-17页 |
| ·本章小结 | 第17-18页 |
| 3 OBO-Parser 的架构 | 第18-26页 |
| ·设计模式概述 | 第18-19页 |
| ·模式的四个基本要素 | 第18-19页 |
| ·应用设计模式的优点 | 第19页 |
| ·MVC 模式介绍 | 第19-21页 |
| ·OBO-Parser 中的 Struts 架构实现 | 第21-25页 |
| ·Struts 的体系结构 | 第21-23页 |
| ·Struts 在OBO-Parser 的应用 | 第23-25页 |
| ·本章小结 | 第25-26页 |
| 4 语义相似度模型 | 第26-29页 |
| ·语义相似度在生物学的作用 | 第26页 |
| ·基于语义路径覆盖的模型 | 第26-28页 |
| ·本章小结 | 第28-29页 |
| 5 OBO-Parser 功能模块的实现 | 第29-45页 |
| ·OBO 文件格式和数据表的设计 | 第29-37页 |
| ·OBO 文件格式 | 第29-33页 |
| ·数据库基本表的设计 | 第33-37页 |
| ·OBO 文件格式转换OWL 格式 | 第37-40页 |
| ·OBO 文件中header 的转换 | 第37-38页 |
| ·OBO 文件中Stanza 的转换 | 第38-40页 |
| ·用户使用范例 | 第40-42页 |
| ·系统运行环境与数据库的连接 | 第42-44页 |
| ·本章小结 | 第44-45页 |
| 6 总结 | 第45-46页 |
| 致谢 | 第46-47页 |
| 参考文献 | 第47-50页 |