| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-13页 |
| 缩写词 | 第13-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-52页 |
| 1 无脊椎动物的免疫进化 | 第15-19页 |
| ·原生动物 | 第15-16页 |
| ·海绵动物 | 第16页 |
| ·腔肠动物 | 第16页 |
| ·扁形动物 | 第16页 |
| ·纽形动物 | 第16-17页 |
| ·环节动物 | 第17页 |
| ·星虫 | 第17页 |
| ·软体动物 | 第17-18页 |
| ·节肢动物 | 第18-19页 |
| ·棘皮动物 | 第19页 |
| 2 先天性免疫与获得性免疫的关系 | 第19-31页 |
| ·先天性免疫与获得性免疫的免疫识别策略 | 第22-23页 |
| ·模式识别受体 | 第23-24页 |
| ·模式识别效应 | 第24-25页 |
| ·模式识别的免疫生物学意义 | 第25-28页 |
| ·模式识别决定着获得性免疫应答的类型 | 第28-29页 |
| ·先天性免疫对自身抗原的识别 | 第29页 |
| ·先天性免疫与疾病 | 第29页 |
| ·先天性免疫的组成性防御与诱导性防御 | 第29-30页 |
| ·细胞毒性T淋巴细胞的免疫识别 | 第30-31页 |
| 3 无脊椎动物模式识别受体的研究进展 | 第31-42页 |
| ·肽聚糖识别蛋白 | 第32-34页 |
| ·硫酯蛋白 | 第34页 |
| ·革兰氏阴性菌结合蛋白 | 第34页 |
| ·清道夫受体 | 第34-35页 |
| ·C-型凝集素 | 第35页 |
| ·硫依赖型凝集素 | 第35页 |
| ·Toll受体 | 第35-40页 |
| ·IMD途径 | 第40-42页 |
| 4 胞内识别机制 | 第42-44页 |
| 5 蛋白抗原 | 第44-45页 |
| 6 超抗原的免疫识别 | 第45页 |
| 7 贝类免疫学研究进展 | 第45-48页 |
| ·我国贝类养殖面临的困境 | 第45-47页 |
| ·贝类免疫学研究进展 | 第47-48页 |
| 8 免疫识别在水产养殖中的应用 | 第48-50页 |
| ·免疫增强剂 | 第48-50页 |
| ·疾病监控 | 第50页 |
| 9 本研究的目的和意义 | 第50-52页 |
| 第二章 材料与方法 | 第52-62页 |
| 1 材料 | 第52-53页 |
| ·样品及样品处理 | 第52-53页 |
| ·主要试剂、仪器及设备 | 第53页 |
| 2 方法 | 第53-62页 |
| ·从cDNA 文库中扩增所需基因 | 第53-54页 |
| ·RNA 提取 | 第54-55页 |
| ·cDNA 第一链的合成 | 第55-56页 |
| ·感受态细胞的制备 | 第56-57页 |
| ·连接 | 第57页 |
| ·转化 | 第57-58页 |
| ·RACE PCR 获得全长cDNA 序列 | 第58-59页 |
| ·Northern Blot | 第59页 |
| ·RT-PCR 检测目的基因的表达 | 第59-60页 |
| ·目的基因的生物信息学分析 | 第60-62页 |
| 第三章 栉孔扇贝脂多糖葡聚糖结合蛋白（LGBP）基因的克隆与表达的研究 | 第62-89页 |
| 1 研究背景 | 第62-66页 |
| 2 材料与方法 | 第66-67页 |
| ·LGBP 基因3’末端的克隆 | 第66页 |
| ·LGBP 基因5’末端的克隆 | 第66页 |
| ·序列注册 | 第66页 |
| ·栉孔扇贝 LGBP 同源蛋白的系统发生分析 | 第66页 |
| ·半定量 RT-PCR 分析 LGBP 基因的表达 | 第66-67页 |
| 3 结果 | 第67-81页 |
| ·LGBP 基因3’末端的克隆 | 第67页 |
| ·LGBP 基因5’末端的克隆 | 第67-68页 |
| ·LGBP 序列分析 | 第68-76页 |
| ·栉孔扇贝 LGBP 二级结构预测 | 第76页 |
| ·栉孔扇贝 LGBP mRNA 二级结构预测 | 第76-79页 |
| ·栉孔扇贝 LGBP 相关蛋白的系统发生 | 第79页 |
| ·用半定量 RT-PCR 检测 LGBP 基因在不同组织中的表达 | 第79页 |
| ·用半定量 RT-PCR 检测LGBP 基因在鳗弧菌刺激后的表达 | 第79-80页 |
| ·用半定量 RT-PCR 检测 LGBP 基因在毕赤酵母刺激后的表达 | 第80-81页 |
| 4 讨论与结论 | 第81-89页 |
| 第四章 栉孔扇贝肽聚糖识别蛋白（PGRP-S1）基因的克隆与表达的研究 | 第89-125页 |
| 1 研究背景 | 第89-95页 |
| ·先天性免疫系统对肽聚糖的识别 | 第89-91页 |
| ·肽聚糖识别蛋白（Peptidoglycan recognition proteins, PGRPs）的发现 | 第91-93页 |
| ·PGRPs 的结构 | 第93-94页 |
| ·昆虫 PGRPs 的表达 | 第94-95页 |
| ·哺乳动物 PGRPs 的表达 | 第95页 |
| 2 材料与方法 | 第95-97页 |
| ·PGRP-S1 基因3’末端的克隆 | 第95-96页 |
| ·PGRP-S1 基因5’末端的克隆 | 第96-97页 |
| ·Virtual Northern Blotting | 第97页 |
| ·序列注册 | 第97页 |
| ·半定量 RT-PCR 分析 PGRP-S1 基因的表达 | 第97页 |
| 3 结果 | 第97-115页 |
| ·PGRP-S1 基因3’末端的克隆 | 第97-98页 |
| ·PGRP-S1 基因5’末端的克隆 | 第98页 |
| ·Virtual Northern Blotting | 第98-99页 |
| ·PGRP-S1 序列分析 | 第99-111页 |
| ·栉孔扇贝 PGRP-S1 二级结构预测 | 第111页 |
| ·栉孔扇贝 PGRP-S1 mRNA 二级结构预测 | 第111-113页 |
| ·栉孔扇贝 PGRP-S1 相关部分蛋白的系统发生 | 第113-114页 |
| ·用半定量 RT-PCR 检测 PGRP-S1 基因在不同组织中的表达 | 第114页 |
| ·用半定量 RT-PCR 检测 PGRP-S1 基因在鳗弧菌及溶壁微球菌刺激后的表达 | 第114-115页 |
| 4 讨论与结论 | 第115-125页 |
| 第五章 结论 | 第125-127页 |
| 1 栉孔扇贝脂多糖葡聚糖结合蛋白基因 | 第125-126页 |
| 2 栉孔扇贝肽聚糖识别蛋白基因 | 第126-127页 |
| 参考文献 | 第127-153页 |
| 攻读博士学位期间发表和完成的论文 | 第153-155页 |
| 致谢 | 第155页 |
