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鼠疫耶尔森氏菌比较和进化基因组学研究

中文摘要第1-9页
英文摘要第9-13页
前言Ⅰ 环境、宿主与鼠疫耶尔森氏菌第13-21页
 1 鼠疫-典型的自然疫源性疾病第13页
 2 鼠疫耶尔森氏菌的贮存宿主第13-14页
 3 鼠疫耶尔森氏菌的传播媒介第14页
 4 鼠疫耶尔森氏菌、宿主、媒介的相互作用第14-15页
 5 中国鼠疫自然疫源地第15-20页
 参考文献第20-21页
前言Ⅱ 细菌的比较和进化基因组学第21-30页
 1 细菌基因组进化第21-22页
 2 细菌的比较和进化基因组学第22-24页
 3 细菌比较基因组学研究方法第24-26页
 4 鼠疫耶尔森氏菌的比较和进化基因组学第26-28页
 5 本研究的目的与意义第28-29页
 参考文献第29-30页
第一章 鼠疫耶尔森氏菌全基因组DNA芯片的研制及用于比较基因组学分析第30-44页
 1 导论第30页
 2 材料和方法第30-35页
 3 结果和讨论第35-42页
   ·鼠疫耶尔森氏菌全基因组DNA芯片的研制第35-37页
   ·芯片评价及用于比较基因组杂交第37-41页
   ·基于DNA芯片的鼠疫耶尔森氏菌比较基因组学第41-42页
 参考文献第42-44页
第二章 鼠疫耶尔森氏菌基因组进化与生态位适应研究第44-78页
 1 导论第44-45页
 2 材料和方法第45-49页
 3 结果和讨论第49-76页
   ·鼠疫耶尔森氏菌自然分离株质粒和pgm位点的缺失特性第49-50页
   ·鼠疫耶尔森氏菌自然分离株的DFR第50-51页
   ·基于DFR的鼠疫耶尔森氏菌基因组分型第51-53页
   ·鼠疫耶尔森氏菌的起源进化第53-56页
   ·鼠疫耶尔森氏菌种内微进化第56-57页
   ·鼠疫耶尔森氏菌在中国的传播与演化第57-59页
   ·鼠疫耶尔森氏菌生态位适应与基因组进化第59-76页
 参考文献第76-78页
第三章 鼠疫耶尔森氏菌生物型遗传基础的研究和新生物型--田鼠型的提出第78-88页
 1 导论第78页
 2 材料和方法第78-82页
 3 结果和讨论第82-86页
   ·田鼠疫源地鼠疫耶尔森氏菌的独特表型特征第82-83页
   ·田鼠疫源地鼠疫耶尔森氏菌的独特分子特征第83-84页
   ·新生物型--田鼠型的提出第84页
   ·glpD基因突变与东方型甘油降解阴性表型第84页
   ·napA基因突变与中世纪型和田鼠型的脱氮阴性表型第84-85页
   ·araC基因突变与田鼠型阿拉伯糖利用阴性表型第85-86页
   ·对田鼠型鼠疫耶尔森氏菌对人不致病性的解释第86页
 参考文献第86-88页
第四章 鼠疫耶尔森氏菌DNA标识序列的鉴定及其应用研究第88-95页
 1 导论第88页
 2 材料和方法第88-90页
 3 结果和讨论第90-93页
   ·鼠疫耶尔森氏菌标识基因的鉴定第90-92页
   ·鼠疫耶尔森氏菌特异性引物的设计及其应用第92-93页
 参考文献第93-95页
第五章 鼠疫耶尔森氏菌活疫苗株的比较基因组学研究第95-115页
 1 导论第95页
 2 材料和方法第95-98页
 3 结果和讨论第98-112页
   ·鼠疫活疫苗株缺失了大片段基因第98-102页
   ·鼠疫耶尔森氏菌活疫苗株中存在大片段基因的拷贝增多第102-103页
   ·EV菌苗和Tjiwidei菌苗的遗传变异第103-104页
   ·结语第104-112页
 参考文献第112-115页
细菌基因组进化的分子策略(综述)第115-128页
发表论文和申报专利第128-130页
致谢第130页

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