盐藻Cbr基因组序列克隆及生物信息学分析与表达研究
| 中文摘要 | 第1-9页 |
| 英文摘要 | 第9-11页 |
| 前言 | 第11-12页 |
| 第一章 Cbr基因组序列克隆和结构分析 | 第12-17页 |
| 1．材料和方法 | 第12-14页 |
| 1．1 材料 | 第12页 |
| 1．1．1 菌种与藻种 | 第12页 |
| 1．1．2 试剂 | 第12页 |
| 1．1．3 试剂盒 | 第12页 |
| 1．1．4 仪器 | 第12页 |
| 1．2 方法 | 第12-14页 |
| 1．2．1 盐藻总DNA的提取 | 第12-13页 |
| 1．2．2 引物设计 | 第13页 |
| 1．2．3 基因组DNA片段的克隆 | 第13页 |
| 1．2．4 基因组序列分析 | 第13-14页 |
| 2．结果 | 第14-16页 |
| 2．1 基因组DNA提取 | 第14页 |
| 2．2 基因组克隆片段结果 | 第14-16页 |
| 3．讨论 | 第16-17页 |
| 3．1 基因组DNA序列克隆 | 第16页 |
| 3．2 基因组DNA序列的分析 | 第16页 |
| 3．3 全长开放阅读框(ORF)的外显子分布 | 第16-17页 |
| 第二章 Cbr基因结构分析 | 第17-29页 |
| 1．分析方法 | 第17-18页 |
| 1．1 核苷酸序列分析 | 第17页 |
| 1．1．1 核酸GC含量分布 | 第17页 |
| 1．1．2 序列读框分析 | 第17页 |
| 1．1．3 加A信号位点预测 | 第17页 |
| 1．1．4 相似性搜索 | 第17页 |
| 1．2 蛋白质序列分析 | 第17-18页 |
| 1．2．1 蛋白质性质分析 | 第17页 |
| 1．2．2 蛋白质序列跨膜结构分析 | 第17页 |
| 1．2．3 BLOCKs分析和功能结构域确定 | 第17页 |
| 1．2．4 相似性搜索 | 第17页 |
| 1．2．5 二级结构预测 | 第17-18页 |
| 1．2．6 三级结构预测 | 第18页 |
| 1．2．7 色素结合位点预测 | 第18页 |
| 1．2．8 蛋白质家族分析 | 第18页 |
| 1．2．9 系统发育分析 | 第18页 |
| 2 结果与讨论 | 第18-27页 |
| 2．1 核酸序列分析 | 第18-21页 |
| 2．1．1 核酸GC含量分析 | 第18-19页 |
| 2．1．2 序列读框分析 | 第19页 |
| 2．1．3 加A信号位点预测 | 第19页 |
| 2．1．4 相似性搜索 | 第19-21页 |
| 2．2 蛋白质序列分析 | 第21-27页 |
| 2．2．1 蛋白质性质分析 | 第21页 |
| 2．2．2 蛋白质序列跨膜结构分析 | 第21-22页 |
| 2．2．3 BLOCKs分析和功能结构域的确定 | 第22-23页 |
| 2．2．4 二级结构预测 | 第23页 |
| 2．2．5 三级结构预测 | 第23-24页 |
| 2．2．6 色素结合位点分析 | 第24-25页 |
| 2．2．7 蛋白质家族分析 | 第25页 |
| 2．2．8 系统发育分析 | 第25-27页 |
| 3．讨论 | 第27-29页 |
| 3．1 生物信息学分析的方法 | 第27页 |
| 3．2 Cbr基因的结构和功能预测 | 第27-28页 |
| 3．3 Cbr的进化地位 | 第28-29页 |
| 第三章 盐胁迫对Cbr基因表达和色素积累的影响 | 第29-42页 |
| 1．材料和方法 | 第29-37页 |
| 1．1 材料 | 第29-31页 |
| 1．1．1．实验用藻种 | 第29页 |
| 1．1．2 实验用试剂 | 第29-31页 |
| 1．1．3 仪器 | 第31页 |
| 1．2 方法 | 第31-37页 |
| 1. 2．1 盐生杜氏藻的低渗、高渗震扰培养 | 第31-32页 |
| 1．2．2 Northen杂交 | 第32页 |
| 1．2．3 色素积累分析 | 第32-37页 |
| 2 结果 | 第37-40页 |
| 2．1 RNA质量分析 | 第37页 |
| 2．2 探针模板分析 | 第37-38页 |
| 2．3 Northenr杂交结果 | 第38-39页 |
| 2．4 色素积累的变化 | 第39-40页 |
| 3 讨论 | 第40-42页 |
| 3．1 RNA提取 | 第40-41页 |
| 3．2 Cbr表达积累与色素变化之间的关系 | 第41-42页 |
| 第四章 光胁迫对Cbr基因表达和色素积累的影响 | 第42-46页 |
| 1 材料和方法 | 第42页 |
| 1．1 材料 | 第42页 |
| 1．2 仪器 | 第42页 |
| 1．3 方法 | 第42页 |
| 1．3．1 盐藻的光胁迫处理 | 第42页 |
| 1．3．2 Northern杂交及色素含量分析 | 第42页 |
| 2 结果 | 第42-44页 |
| 2．1 RNA质量分析 | 第42-43页 |
| 2．2 探针模板 | 第43页 |
| 2．3 Northern结果 | 第43-44页 |
| 2．4 色素积累分析 | 第44页 |
| 3 讨论 | 第44-46页 |
| 结论 | 第46-47页 |
| 致谢 | 第47-48页 |
| 声明 | 第48-49页 |
| 综述一：植物光胁迫机理及其防御机制 | 第49-58页 |
| 综述二：ELIPs研究进展 | 第58-74页 |
| 参考文献 | 第74-86页 |
| 在校期间学习情况 | 第86页 |
