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表观遗传修饰在HOXB13基因转录中的调控机制及意义

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-8页
引言第8-37页
 一、HOX 基因家族简介第8-13页
  (一) HOX 家族成员第8-10页
  (二) HOX 家族蛋白的功能第10-11页
  (三) HOXB13 基因及其功能研究第11-13页
 二、组蛋白乙酰化修饰、DNA 甲基化与真核生物基因的转录调控第13-28页
  (一) 真核生物的染色质结构与转录调控的关系第13-15页
  (二) 组蛋白乙酰化修饰与转录调控第15-21页
  (三) 组蛋白去乙酰化酶第21-25页
  (四) 组蛋白去乙酰化酶抑制剂第25-26页
  (五) DNA 甲基化与基因转录调控第26-28页
 三、PCG(POLYCOMB GROUP)蛋白复合物及其功能研究概述第28-34页
  (一) PcG 蛋白复合物第29-34页
 四、本论文研究的内容和意义第34-37页
  (一) 立题依据第34-35页
  (二) 本论文的研究内容和意义第35-37页
实验材料与方法第37-52页
 一、实验材料第37-38页
  (一) 质粒第37页
  (二) 蛋白质和抗体第37页
  (三) 哺乳动物细胞系第37-38页
  (四) 试剂第38页
 二、实验方法第38-52页
  Ⅰ. 分子生物学实验方法第38-46页
   (一) 分子克隆第38页
   (二) DNA 的琼脂糖电泳第38页
   (三) 质粒大量制备的方法第38-40页
   (四) 哺乳动物细胞总RNA 的提取和反转录第40-42页
   (五) 染色质免疫沉淀实验(Chromatin immunoprecipitation,ChIP)第42-44页
   (六) RNA 干涉(RNAi)第44-45页
   (七) 亚硫酸氢钠测序(bisulfite genomic sequencing)第45-46页
  Ⅱ. 细胞生物学实验方法第46-52页
   (一) 哺乳动物细胞系的培养第46页
   (二) 真核生物细胞的瞬时转染和荧光素酶报告基因检测第46-47页
   (三) 真核生物细胞系的脂质体和罗氏瞬时转染第47页
   (四) 蛋白质的Western Blot 分析第47-49页
   (五) 免疫共沉淀(co-immunoprecipitation assay,CoIP)实验第49-51页
   (六) MTT 细胞活性检测实验第51-52页
实验结果与分析第52-72页
 一、HOXB13 参与组蛋白去酰化酶抑制剂丁酸钠(NAB)诱导的前列腺癌细胞生长抑制第52-55页
  (一) NaB 抑制了前列腺癌细胞DU145 的生长并且提高了HOXB13 基因的表达水平第52-53页
  (二) NaB 诱导的前列腺癌细胞生长停滞部分依赖于HOXB13第53-55页
 二、组蛋白去乙酰化酶参与调控HOXB13 基因转录的分子机制及意义第55-65页
  (一) HDAC4 参与HOXB13 基因的表达调控机制及意义第55-59页
  (二) YY1 参与HOXB13 基因的表达调控机制及意义第59-63页
  (三) 转录因子YY1 能够与HDAC4 结合并且招募HDAC4 到HOXB13 基因启动子上第63-65页
 三、POLYCOMB参与HOXB13 基因的表达调控及机制第65-68页
  (一) Polycomb 家族蛋白表达与HOXB13 的表达呈现明显的负相关,Polycomb 调控HOXB13 的表达第65-67页
  (二) Polycomb 通过影响HOXB13 基因启动子上H3K27 三基化的水平调控基因的表达第67-68页
 四、DNA 甲基化参与HOXB13 基因的表达调控及机制第68-72页
  (一) 在前列腺癌细胞DU145 中HOXB13 基因启动子高甲基化第68-69页
  (二) DNA 甲基转移酶DNMT36 参与HOXB13 基因的调控第69-72页
讨论第72-76页
 一、HOXB13 与肿瘤的关系第72-73页
 二、HDAC 调控HOXB13 基因转录活性的特异性第73页
 三、转录因子YY1 在乙酰化修饰调控HOXB13 基因的过程中发挥重要的作用第73-74页
 四、PCG 家族蛋白转录调控HOXB13 基因的具体分子机制第74-75页
 五、PCG 家族蛋白与前列腺癌的关系第75-76页
主要结论和创新点第76-77页
 一、主要结论第76页
 二、主要创新点第76-77页
参考文献第77-94页
附录第94-96页
致谢第96-97页
在学期间公开发表论文及著作情况第97页

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