葡萄重要农艺性状的简化基因组关联分析
| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 缩略词 | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-23页 |
| 1.1 前言 | 第11页 |
| 1.2 葡萄农艺性状的遗传研究进展 | 第11-12页 |
| 1.3 关联分析 | 第12-16页 |
| 1.3.1 关联分析原理与策略 | 第13-14页 |
| 1.3.2 关联分析步骤 | 第14-15页 |
| 1.3.3 关联分析影响因素 | 第15-16页 |
| 1.4 开展果树关联分析的必要性及条件 | 第16-17页 |
| 1.4.1 开展果树关联分析的必要性 | 第16-17页 |
| 1.4.2 开展果树关联分析的条件 | 第17页 |
| 1.5 关联分析在果树上的应用及进展 | 第17-20页 |
| 1.6 关联分析在果树中开展存在的问题 | 第20-21页 |
| 1.7 本研究的目的意义 | 第21-23页 |
| 第二章 葡萄简化基因组测序 | 第23-35页 |
| 2.1 材料 | 第24页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第24页 |
| 2.2 试验方法 | 第24-26页 |
| 2.2.1 参考基因组确定 | 第24-25页 |
| 2.2.2 酶切方案确定 | 第25页 |
| 2.2.3 实验建库及高通量测序 | 第25页 |
| 2.2.4 实验建库评估 | 第25-26页 |
| 2.2.5 信息分析内容 | 第26页 |
| 2.3 结果与分析 | 第26-33页 |
| 2.3.1 酶切方案 | 第26-27页 |
| 2.3.2 酶切均匀性评估 | 第27-28页 |
| 2.3.3 测序质量值分布检查 | 第28-29页 |
| 2.3.4 碱基分布检查 | 第29-30页 |
| 2.3.5 实验建库评估 | 第30-31页 |
| 2.3.6 片段选择评估 | 第31页 |
| 2.3.7 SLAF标记开发及SNP信息统计 | 第31-33页 |
| 2.4 总结 | 第33-35页 |
| 第三章 连锁不平衡衰减及遗传进化分析 | 第35-41页 |
| 3.1 材料 | 第35-36页 |
| 3.1.1 材料 | 第35-36页 |
| 3.2 方法 | 第36页 |
| 3.2.1 连锁不平衡衰减分析 | 第36页 |
| 3.2.2 遗传进化分析 | 第36页 |
| 3.3 结果与分析 | 第36-40页 |
| 3.3.1 连锁不平衡衰减分析 | 第36页 |
| 3.3.2 遗传进化分析 | 第36-40页 |
| 3.4 讨论 | 第40-41页 |
| 第四章 重要农艺性状全基因组关联分析 | 第41-61页 |
| 4.1 材料 | 第41-42页 |
| 4.1.1 材料 | 第41-42页 |
| 4.2 方法 | 第42-43页 |
| 4.2.1 农艺性状调查及测量 | 第42页 |
| 4.2.2 GWAS关联分析 | 第42-43页 |
| 4.3 结果与分析 | 第43-56页 |
| 4.3.1 农艺性状调查及测量结果 | 第43-44页 |
| 4.3.2 花器类型关联分析 | 第44-45页 |
| 4.3.3 种子相关性状关联分析 | 第45-47页 |
| 4.3.4 成熟期关联分析 | 第47-52页 |
| 4.3.5 果粒相关性状关联分析 | 第52-55页 |
| 4.3.6 梢尖匍匐绒毛密度关联分析 | 第55-56页 |
| 4.4 讨论 | 第56-61页 |
| 4.4.1 农艺性状调查及测量 | 第56页 |
| 4.4.2 花器类型 | 第56-57页 |
| 4.4.3 种子相关性状 | 第57-58页 |
| 4.4.4 成熟期相关性状 | 第58页 |
| 4.4.5 果粒相关性状 | 第58-61页 |
| 全文结论 | 第61-63页 |
| 本文创新点 | 第63-65页 |
| 参考文献 | 第65-73页 |
| 攻读硕士期间论文发表与投稿情况 | 第73-75页 |
| 致谢 | 第75页 |
