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水稻黄化苗基因CS3的图位克隆与功能分析

摘要第6-7页
abstract第7-8页
英文缩略表第14-15页
第一章 引言第15-28页
    1.1 光合作用第15-16页
        1.1.1 光合营养第15页
        1.1.2 光合作用的进化第15-16页
            1.1.2.1 质体的起源第15页
            1.1.2.2 反应中心的起源第15-16页
    1.2 叶绿体的形成第16-18页
        1.2.1 质体的分化第16-17页
        1.2.2 叶绿体的发育第17-18页
    1.3 光合色素第18-22页
        1.3.1 叶绿素的合成与降解第18-21页
            1.3.1.1 叶绿素a的合成第18-19页
            1.3.1.2 叶绿素b的合成第19-20页
            1.3.1.3 叶绿素循环第20页
            1.3.1.4 叶绿素的降解第20-21页
        1.3.2 类胡萝卜素的代谢第21-22页
    1.4 水稻叶色突变体的研究进展第22-25页
        1.4.1 水稻叶色突变体的类型第22页
        1.4.2 水稻叶色突变体的形成机制第22-25页
            1.4.2.1 叶绿素合成通路受阻第22-23页
            1.4.2.2 叶绿素降解通路受阻第23-24页
            1.4.2.3 叶绿体发育受阻第24-25页
    1.5 Ycf54蛋白的研究进展第25-27页
    1.6 本研究的目的与意义第27-28页
第二章 实验材料与方法第28-44页
    2.1 实验材料第28页
    2.2 实验方法第28-44页
        2.2.1 定位群体的构建与定位单株取样第28页
        2.2.2 突变体种子的保存第28页
        2.2.3 突变体等幼苗材料的培养第28页
        2.2.4 转基因材料的种植第28-29页
        2.2.5 测量光合色素含量第29页
        2.2.6 叶绿体透射电镜观察第29-30页
        2.2.7 水稻叶片DAB染色第30页
        2.2.8 测定水稻叶片中H2O2含量、CAT、POD和 SOD活力第30页
        2.2.9 提取基因组DNA第30-31页
        2.2.10 提取水稻组织RNA第31页
        2.2.11 制备水稻cDNA第31页
            2.2.11.1 一般反转录第31页
            2.2.11.2 定量反转录第31页
        2.2.12 引物设计第31-32页
            2.2.12.1 SSR引物设计第31页
            2.2.12.2 InDel引物设计第31-32页
            2.2.12.3 同源重组引物设计第32页
            2.2.12.4 定量引物设计第32页
            2.2.12.5 突变位点基因型检测引物设计第32页
        2.2.13 PCR反应第32-33页
            2.2.13.1 普通Taq酶的PCR反应第32页
            2.2.13.2 高保真酶的PCR反应第32页
            2.2.13.3 荧光定量qPCR反应第32-33页
        2.2.14 凝胶电泳第33-34页
            2.2.14.1 聚丙烯酰胺凝胶电泳第33-34页
            2.2.14.2 琼脂糖凝胶电泳第34页
        2.2.15 CS3基因的图位克隆第34-35页
            2.2.15.1 CS3基因的连锁筛选与初定位第34页
            2.2.15.2 CS3基因的精细定位第34-35页
            2.2.15.3 候选基因的分析与测序第35页
        2.2.16 氨基酸多重序列比对和进化树分析第35页
        2.2.17 琼脂糖凝胶回收第35页
        2.2.18 提取大肠杆菌质粒第35页
            2.2.18.1 质粒小提第35页
            2.2.18.2 质粒大提第35页
        2.2.19 纯化回收DNA产物第35-36页
        2.2.20 载体的构建第36-37页
            2.2.20.1 制备线性载体第36页
            2.2.20.2 获得插入片段第36页
            2.2.20.3 构建重组载体第36页
            2.2.20.4 转化大肠杆菌及验证第36-37页
        2.2.21 CS3基因功能验证第37-39页
            2.2.21.1 互补验证第37页
            2.2.21.2 过表达验证第37页
            2.2.21.3 RNAi验证第37-39页
            2.2.21.4 敲除验证第39页
        2.2.22 CS3基因的亚细胞定位第39-41页
            2.2.22.1 GFP融合表达载体构建第39页
            2.2.22.2 准备水稻幼苗第39-40页
            2.2.22.3 提取原生质体第40页
            2.2.22.4 瞬时转化GFP融合载体及亚细胞定位观察第40-41页
        2.2.23 GUS分析第41页
            2.2.23.1 GUS载体构建第41页
            2.2.23.2 GUS染色第41页
        2.2.24 测定叶绿素前体含量第41-42页
        2.2.25 酵母双杂第42-44页
            2.2.25.1 载体构建第42页
            2.2.25.2 制备酵母感受态细胞第42页
            2.2.25.3 载体转化酵母感受态细胞第42-43页
            2.2.25.4 酵母双杂验证第43-44页
第三章 结果与分析第44-64页
    3.1 cs3突变体的表型鉴定第44-46页
    3.2 突变体cs3叶绿体的超微结构分析第46-48页
    3.3 相关基因的表达量分析第48-51页
        3.3.1 叶绿素合成与降解通路相关基因表达量分析第48-50页
        3.3.2 衰老相关基因表达量分析第50页
        3.3.3 叶绿体发育相关基因表达量分析第50-51页
        3.3.4 光系统及光捕捉复合体相关基因表达量分析第51页
    3.4 CS3基因的精细定位与候选基因的确定第51-52页
    3.5 进化树分析和同源蛋白序列比对分析第52-56页
    3.6 CS3基因的功能验证第56-60页
        3.6.1 CS3基因的互补验证第56-57页
        3.6.2 CS3基因的过表达验证第57页
        3.6.3 CS3基因的敲除验证第57-59页
        3.6.4 CS3基因的RNAi验证第59-60页
    3.7 CS3蛋白的亚细胞定位第60-61页
    3.8 CS3基因的空间表达分析第61-62页
    3.9 CS3蛋白与YGL8蛋白互作第62-63页
    3.10 CS3蛋白参与叶绿素合成第63-64页
第四章 讨论第64-69页
    4.1 水稻cs3突变体是一个苗期黄化致死的突变体第64页
    4.2 cs3突变体中相关基因表达改变第64-66页
    4.3 CS3蛋白参与构成镁原卟啉IX单甲酯环化酶复合体第66-67页
    4.4 CS3蛋白S136F突变影响叶绿素合成第67-69页
第五章 全文总结与展望第69-71页
    5.1 全文总结第69-70页
    5.2 展望第70-71页
参考文献第71-82页
附录第82-88页
致谢第88-89页
作者简历第89页

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