摘要 | 第4-6页 |
abstract | 第6-7页 |
主要符号表 | 第11-12页 |
第1章 引言 | 第12-23页 |
1.1 转录组学研究进展 | 第12-16页 |
1.1.1 转录组和转录组学 | 第12页 |
1.1.2 转录组测序技术的发展 | 第12-16页 |
1.2 鱼类性腺性别分化的研究进展 | 第16-20页 |
1.2.1 性别决定和性别分化 | 第16-17页 |
1.2.2 鱼类性腺发育和性别分化 | 第17-18页 |
1.2.3 鱼类性腺性别分化相关基因的研究进展 | 第18-20页 |
1.3 大黄鱼性腺研究概况 | 第20-21页 |
1.3.1 大黄鱼简介 | 第20页 |
1.3.2 大黄鱼性腺性别分化研究进展 | 第20-21页 |
1.4 本研究目的和意义 | 第21页 |
1.5 本研究内容和技术路线 | 第21-23页 |
1.5.1 研究内容 | 第21-22页 |
1.5.2 技术路线 | 第22-23页 |
第2章 大黄鱼雌雄性腺基因表达差异比较研究 | 第23-48页 |
2.1 实验材料 | 第23-24页 |
2.1.1 实验用鱼 | 第23页 |
2.1.2 主要仪器和试剂 | 第23-24页 |
2.2 实验方法 | 第24-33页 |
2.2.1 石蜡切片 | 第24-26页 |
2.2.3 测序样品准备 | 第26-27页 |
2.2.4 文库构建和测序 | 第27-28页 |
2.2.5 测序数据生物信息学分析 | 第28-30页 |
2.2.6 差异基因功能注释 | 第30-32页 |
2.2.7 RT-PCR验证 | 第32-33页 |
2.3 结果 | 第33-44页 |
2.3.1 性腺的形态特征 | 第33页 |
2.3.2 RNA提取 | 第33-34页 |
2.3.3 测序和注释 | 第34-35页 |
2.3.4 差异表达基因的鉴定 | 第35-37页 |
2.3.5 性别差异表达基因的功能注释 | 第37-40页 |
2.3.6 性别相关基因 | 第40-43页 |
2.3.7 差异表达基因的RT-PCR验证 | 第43-44页 |
2.4 讨论 | 第44-46页 |
2.4.1 基于RNASeq的转录组分析是大规模分析性别相关基因表达谱的有效工具 | 第44页 |
2.4.2 差异表达分析 | 第44页 |
2.4.3 重要性别相关基因分析 | 第44-46页 |
2.5 本章小结 | 第46-48页 |
第3章 大黄鱼雌雄性腺基因表达差异时序性比较研究 | 第48-64页 |
3.1 实验材料 | 第48页 |
3.1.1 实验用鱼 | 第48页 |
3.1.2 主要仪器和试剂 | 第48页 |
3.2 实验方法 | 第48页 |
3.2.1 石蜡切片 | 第48页 |
3.2.2 测序样品准备 | 第48页 |
3.2.3 文库构建和测序 | 第48页 |
3.2.4 转录组组装和差异表达分析 | 第48页 |
3.3 结果 | 第48-58页 |
3.3.1 不同时段石蜡切片结果 | 第48-50页 |
3.3.2 大黄鱼性腺发育不同时期转录组测序数据统计 | 第50页 |
3.3.3 大黄鱼性腺发育不同时期基因表达比较 | 第50-58页 |
3.4 讨论 | 第58-62页 |
3.4.1 实验数据的差异分析 | 第58页 |
3.4.2 雌雄性腺发育相关表达基因的总体比较和时序性总体分析 | 第58-59页 |
3.4.3 数据筛选候选性别特异性表达基因分析 | 第59-62页 |
3.5 本章小结 | 第62-64页 |
第4章 结论与展望 | 第64-65页 |
4.1 研究结论 | 第64页 |
4.2 创新点 | 第64页 |
4.3 展望 | 第64-65页 |
致谢 | 第65-66页 |
参考文献 | 第66-81页 |
在学期间科研成果情况 | 第81页 |